MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	TCAA	2	8	90	97	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019737	ACAA	2	8	1014	1021	75 %	0 %	0 %	25 %	428303660
3	NC_019737	GAAG	2	8	1372	1379	50 %	0 %	50 %	0 %	428303660
4	NC_019737	ACTT	2	8	1797	1804	25 %	50 %	0 %	25 %	428303661
5	NC_019737	CTAT	2	8	2161	2168	25 %	50 %	0 %	25 %	428303661
6	NC_019737	AATT	2	8	2675	2682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019737	TTCG	2	8	3100	3107	0 %	50 %	25 %	25 %	428303662
8	NC_019737	CTTC	2	8	3351	3358	0 %	50 %	0 %	50 %	428303662
9	NC_019737	ATCC	2	8	3491	3498	25 %	25 %	0 %	50 %	428303662
10	NC_019737	TGAT	2	8	4375	4382	25 %	50 %	25 %	0 %	428303662
11	NC_019737	TACT	2	8	4913	4920	25 %	50 %	0 %	25 %	428303663
12	NC_019737	GTTG	2	8	5526	5533	0 %	50 %	50 %	0 %	428303664
13	NC_019737	ACCG	2	8	5787	5794	25 %	0 %	25 %	50 %	428303664
14	NC_019737	AAAC	2	8	6462	6469	75 %	0 %	0 %	25 %	428303664
15	NC_019737	GAAT	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	428303664
16	NC_019737	TTAT	2	8	6650	6657	25 %	75 %	0 %	0 %	428303664
17	NC_019737	TCAA	2	8	6772	6779	50 %	25 %	0 %	25 %	428303664
18	NC_019737	TTAA	2	8	6862	6869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019737	GATT	2	8	6971	6978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019737	TCTT	2	8	6981	6988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019737	TAAC	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	428303665
22	NC_019737	GTTC	2	8	7600	7607	0 %	50 %	25 %	25 %	428303665
23	NC_019737	GAAA	2	8	7718	7725	75 %	0 %	25 %	0 %	428303665
24	NC_019737	TTGA	2	8	8181	8188	25 %	50 %	25 %	0 %	428303666
25	NC_019737	ATTG	2	8	8281	8288	25 %	50 %	25 %	0 %	428303666
26	NC_019737	TCGT	2	8	8476	8483	0 %	50 %	25 %	25 %	428303666
27	NC_019737	TGGC	2	8	8619	8626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019737	TCAA	2	8	9088	9095	50 %	25 %	0 %	25 %	428303667
29	NC_019737	CTTT	2	8	9636	9643	0 %	75 %	0 %	25 %	428303667
30	NC_019737	TATC	2	8	9671	9678	25 %	50 %	0 %	25 %	428303667
31	NC_019737	TTGG	2	8	9842	9849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019737	TCAA	2	8	10722	10729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019737	TAAA	2	8	11606	11613	75 %	25 %	0 %	0 %	428303670
34	NC_019737	TGAT	2	8	11615	11622	25 %	50 %	25 %	0 %	428303670
35	NC_019737	AATT	2	8	11715	11722	50 %	50 %	0 %	0 %	428303670
36	NC_019737	TGCT	2	8	12010	12017	0 %	50 %	25 %	25 %	428303671
37	NC_019737	ATTA	2	8	12160	12167	50 %	50 %	0 %	0 %	428303671
38	NC_019737	TTAT	2	8	12525	12532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019737	AAAT	2	8	12595	12602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019737	CCTT	2	8	13229	13236	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
41	NC_019737	TTCT	2	8	13611	13618	0 %	75 %	0 %	25 %	428303674
42	NC_019737	GACT	2	8	13773	13780	25 %	25 %	25 %	25 %	428303674
43	NC_019737	AGCC	2	8	14077	14084	25 %	0 %	25 %	50 %	428303674
44	NC_019737	GATT	2	8	14163	14170	25 %	50 %	25 %	0 %	428303674
45	NC_019737	AAAG	2	8	15068	15075	75 %	0 %	25 %	0 %	428303674
46	NC_019737	TAAT	2	8	15939	15946	50 %	50 %	0 %	0 %	428303674
47	NC_019737	TTCC	2	8	15976	15983	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
48	NC_019737	TGAT	2	8	16216	16223	25 %	50 %	25 %	0 %	428303674
49	NC_019737	TTTG	2	8	16233	16240	0 %	75 %	25 %	0 %	428303674
50	NC_019737	AATT	2	8	16350	16357	50 %	50 %	0 %	0 %	428303675
51	NC_019737	CTGG	2	8	16518	16525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019737	CCAT	2	8	16669	16676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019737	AGCC	2	8	16966	16973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019737	ATGA	2	8	17081	17088	50 %	25 %	25 %	0 %	428303677
55	NC_019737	AAAG	2	8	18054	18061	75 %	0 %	25 %	0 %	428303679
56	NC_019737	TTGT	2	8	18593	18600	0 %	75 %	25 %	0 %	428303680
57	NC_019737	TCAG	2	8	18924	18931	25 %	25 %	25 %	25 %	428303681
58	NC_019737	TCAG	2	8	18967	18974	25 %	25 %	25 %	25 %	428303681
59	NC_019737	GGAT	2	8	19400	19407	25 %	25 %	50 %	0 %	428303682
60	NC_019737	GCTC	2	8	19585	19592	0 %	25 %	25 %	50 %	428303682
61	NC_019737	GTAA	2	8	19777	19784	50 %	25 %	25 %	0 %	428303683
62	NC_019737	TGAT	2	8	20510	20517	25 %	50 %	25 %	0 %	428303685
63	NC_019737	GGAA	2	8	21119	21126	50 %	0 %	50 %	0 %	428303685
64	NC_019737	AATT	2	8	21800	21807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019737	TGGG	2	8	22937	22944	0 %	25 %	75 %	0 %	428303688
66	NC_019737	AATT	2	8	23060	23067	50 %	50 %	0 %	0 %	428303688
67	NC_019737	ATCC	2	8	23495	23502	25 %	25 %	0 %	50 %	428303688
68	NC_019737	ACCC	2	8	24181	24188	25 %	0 %	0 %	75 %	428303689
69	NC_019737	CCAA	2	8	24231	24238	50 %	0 %	0 %	50 %	428303689
70	NC_019737	CCAA	2	8	24843	24850	50 %	0 %	0 %	50 %	428303689
71	NC_019737	TTAA	2	8	24875	24882	50 %	50 %	0 %	0 %	428303689
72	NC_019737	TGAT	2	8	25578	25585	25 %	50 %	25 %	0 %	428303689
73	NC_019737	TTAG	2	8	25937	25944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019737	ATTA	2	8	26811	26818	50 %	50 %	0 %	0 %	428303690
75	NC_019737	AAAT	2	8	27098	27105	75 %	25 %	0 %	0 %	428303691
76	NC_019737	TGGT	2	8	27111	27118	0 %	50 %	50 %	0 %	428303691
77	NC_019737	ATAA	2	8	27386	27393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019737	GTAT	2	8	27452	27459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019737	TCCT	2	8	27584	27591	0 %	50 %	0 %	50 %	428303692
80	NC_019737	CTCA	2	8	27723	27730	25 %	25 %	0 %	50 %	428303692
81	NC_019737	AAAG	2	8	28269	28276	75 %	0 %	25 %	0 %	428303692
82	NC_019737	CCTA	2	8	28443	28450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.