MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	ACAA	2	8	1014	1021	75 %	0 %	0 %	25 %	428303660
2	NC_019737	GAAG	2	8	1372	1379	50 %	0 %	50 %	0 %	428303660
3	NC_019737	ACTT	2	8	1797	1804	25 %	50 %	0 %	25 %	428303661
4	NC_019737	CTAT	2	8	2161	2168	25 %	50 %	0 %	25 %	428303661
5	NC_019737	TTCG	2	8	3100	3107	0 %	50 %	25 %	25 %	428303662
6	NC_019737	CTTC	2	8	3351	3358	0 %	50 %	0 %	50 %	428303662
7	NC_019737	ATCC	2	8	3491	3498	25 %	25 %	0 %	50 %	428303662
8	NC_019737	TGAT	2	8	4375	4382	25 %	50 %	25 %	0 %	428303662
9	NC_019737	TACT	2	8	4913	4920	25 %	50 %	0 %	25 %	428303663
10	NC_019737	GTTG	2	8	5526	5533	0 %	50 %	50 %	0 %	428303664
11	NC_019737	ACCG	2	8	5787	5794	25 %	0 %	25 %	50 %	428303664
12	NC_019737	AAAC	2	8	6462	6469	75 %	0 %	0 %	25 %	428303664
13	NC_019737	GAAT	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	428303664
14	NC_019737	TTAT	2	8	6650	6657	25 %	75 %	0 %	0 %	428303664
15	NC_019737	TCAA	2	8	6772	6779	50 %	25 %	0 %	25 %	428303664
16	NC_019737	TAAC	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	428303665
17	NC_019737	GTTC	2	8	7600	7607	0 %	50 %	25 %	25 %	428303665
18	NC_019737	GAAA	2	8	7718	7725	75 %	0 %	25 %	0 %	428303665
19	NC_019737	TTGA	2	8	8181	8188	25 %	50 %	25 %	0 %	428303666
20	NC_019737	ATTG	2	8	8281	8288	25 %	50 %	25 %	0 %	428303666
21	NC_019737	TCGT	2	8	8476	8483	0 %	50 %	25 %	25 %	428303666
22	NC_019737	TCAA	2	8	9088	9095	50 %	25 %	0 %	25 %	428303667
23	NC_019737	CTTT	2	8	9636	9643	0 %	75 %	0 %	25 %	428303667
24	NC_019737	TATC	2	8	9671	9678	25 %	50 %	0 %	25 %	428303667
25	NC_019737	TAAA	2	8	11606	11613	75 %	25 %	0 %	0 %	428303670
26	NC_019737	TGAT	2	8	11615	11622	25 %	50 %	25 %	0 %	428303670
27	NC_019737	AATT	2	8	11715	11722	50 %	50 %	0 %	0 %	428303670
28	NC_019737	TGCT	2	8	12010	12017	0 %	50 %	25 %	25 %	428303671
29	NC_019737	ATTA	2	8	12160	12167	50 %	50 %	0 %	0 %	428303671
30	NC_019737	CCTT	2	8	13229	13236	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
31	NC_019737	TTCT	2	8	13611	13618	0 %	75 %	0 %	25 %	428303674
32	NC_019737	GACT	2	8	13773	13780	25 %	25 %	25 %	25 %	428303674
33	NC_019737	AGCC	2	8	14077	14084	25 %	0 %	25 %	50 %	428303674
34	NC_019737	GATT	2	8	14163	14170	25 %	50 %	25 %	0 %	428303674
35	NC_019737	AAAG	2	8	15068	15075	75 %	0 %	25 %	0 %	428303674
36	NC_019737	TAAT	2	8	15939	15946	50 %	50 %	0 %	0 %	428303674
37	NC_019737	TTCC	2	8	15976	15983	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
38	NC_019737	TGAT	2	8	16216	16223	25 %	50 %	25 %	0 %	428303674
39	NC_019737	TTTG	2	8	16233	16240	0 %	75 %	25 %	0 %	428303674
40	NC_019737	AATT	2	8	16350	16357	50 %	50 %	0 %	0 %	428303675
41	NC_019737	ATGA	2	8	17081	17088	50 %	25 %	25 %	0 %	428303677
42	NC_019737	AAAG	2	8	18054	18061	75 %	0 %	25 %	0 %	428303679
43	NC_019737	TTGT	2	8	18593	18600	0 %	75 %	25 %	0 %	428303680
44	NC_019737	TCAG	2	8	18924	18931	25 %	25 %	25 %	25 %	428303681
45	NC_019737	TCAG	2	8	18967	18974	25 %	25 %	25 %	25 %	428303681
46	NC_019737	GGAT	2	8	19400	19407	25 %	25 %	50 %	0 %	428303682
47	NC_019737	GCTC	2	8	19585	19592	0 %	25 %	25 %	50 %	428303682
48	NC_019737	GTAA	2	8	19777	19784	50 %	25 %	25 %	0 %	428303683
49	NC_019737	TGAT	2	8	20510	20517	25 %	50 %	25 %	0 %	428303685
50	NC_019737	GGAA	2	8	21119	21126	50 %	0 %	50 %	0 %	428303685
51	NC_019737	TGGG	2	8	22937	22944	0 %	25 %	75 %	0 %	428303688
52	NC_019737	AATT	2	8	23060	23067	50 %	50 %	0 %	0 %	428303688
53	NC_019737	ATCC	2	8	23495	23502	25 %	25 %	0 %	50 %	428303688
54	NC_019737	ACCC	2	8	24181	24188	25 %	0 %	0 %	75 %	428303689
55	NC_019737	CCAA	2	8	24231	24238	50 %	0 %	0 %	50 %	428303689
56	NC_019737	CCAA	2	8	24843	24850	50 %	0 %	0 %	50 %	428303689
57	NC_019737	TTAA	2	8	24875	24882	50 %	50 %	0 %	0 %	428303689
58	NC_019737	TGAT	2	8	25578	25585	25 %	50 %	25 %	0 %	428303689
59	NC_019737	ATTA	2	8	26811	26818	50 %	50 %	0 %	0 %	428303690
60	NC_019737	AAAT	2	8	27098	27105	75 %	25 %	0 %	0 %	428303691
61	NC_019737	TGGT	2	8	27111	27118	0 %	50 %	50 %	0 %	428303691
62	NC_019737	TCCT	2	8	27584	27591	0 %	50 %	0 %	50 %	428303692
63	NC_019737	CTCA	2	8	27723	27730	25 %	25 %	0 %	50 %	428303692
64	NC_019737	AAAG	2	8	28269	28276	75 %	0 %	25 %	0 %	428303692

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.