MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	GAT	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303660
2	NC_019737	AAC	2	6	938	943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303660
3	NC_019737	CAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303660
4	NC_019737	GGC	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303660
5	NC_019737	TAC	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
6	NC_019737	CAC	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303660
7	NC_019737	ATC	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
8	NC_019737	TTA	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303660
9	NC_019737	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
10	NC_019737	CAG	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303660
11	NC_019737	GCG	2	6	1630	1635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303660
12	NC_019737	TGA	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303660
13	NC_019737	TCA	2	6	1702	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303660
14	NC_019737	TTA	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303660
15	NC_019737	ATT	2	6	1829	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303661
16	NC_019737	ACG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303661
17	NC_019737	ATC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303661
18	NC_019737	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303661
19	NC_019737	GAA	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303661
20	NC_019737	CGA	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303661
21	NC_019737	TGA	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303661
22	NC_019737	TGC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303661
23	NC_019737	TTG	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
24	NC_019737	TAC	2	6	3142	3147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
25	NC_019737	GTT	2	6	3186	3191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
26	NC_019737	TAA	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303662
27	NC_019737	TTA	2	6	3293	3298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303662
28	NC_019737	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303662
29	NC_019737	TTC	2	6	3499	3504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
30	NC_019737	AGC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303662
31	NC_019737	TCA	4	12	3605	3616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
32	NC_019737	ATC	3	9	3622	3630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
33	NC_019737	CAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
34	NC_019737	CTT	2	6	3798	3803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
35	NC_019737	TTG	2	6	3817	3822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
36	NC_019737	TGG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303662
37	NC_019737	CTT	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
38	NC_019737	CTA	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
39	NC_019737	TTC	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
40	NC_019737	ATC	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303662
41	NC_019737	CTG	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303662
42	NC_019737	TCT	2	6	4202	4207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
43	NC_019737	TTC	2	6	4267	4272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
44	NC_019737	TTG	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
45	NC_019737	TTG	2	6	4338	4343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
46	NC_019737	TGT	2	6	4347	4352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303662
47	NC_019737	TTC	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303662
48	NC_019737	TGC	3	9	4474	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303662
49	NC_019737	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303663
50	NC_019737	AGA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303663
51	NC_019737	CTA	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303663
52	NC_019737	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303663
53	NC_019737	CTT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303663
54	NC_019737	AAT	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303663
55	NC_019737	CTT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303663
56	NC_019737	GTC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303663
57	NC_019737	TTG	2	6	5324	5329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303664
58	NC_019737	AGT	2	6	5385	5390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303664
59	NC_019737	CAA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
60	NC_019737	CAA	2	6	5517	5522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
61	NC_019737	CAA	2	6	5658	5663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
62	NC_019737	ATT	2	6	5766	5771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303664
63	NC_019737	AGA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303664
64	NC_019737	CAA	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
65	NC_019737	ACG	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303664
66	NC_019737	ACT	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303664
67	NC_019737	TTA	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303664
68	NC_019737	CCA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303664
69	NC_019737	CAA	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303664
70	NC_019737	TGC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303664
71	NC_019737	TGG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303664
72	NC_019737	AGA	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303664
73	NC_019737	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303664
74	NC_019737	CAT	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303664
75	NC_019737	TTC	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303664
76	NC_019737	CAG	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303664
77	NC_019737	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303664
78	NC_019737	GTC	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
79	NC_019737	CTG	3	9	7130	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
80	NC_019737	CTG	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
81	NC_019737	GTT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303665
82	NC_019737	CTG	4	12	7214	7225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
83	NC_019737	TAT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303665
84	NC_019737	TTG	2	6	7374	7379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303665
85	NC_019737	AGC	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303665
86	NC_019737	TAA	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303665
87	NC_019737	TGA	2	6	7804	7809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303665
88	NC_019737	TTA	2	6	7882	7887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303665
89	NC_019737	ATC	2	6	7920	7925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303665
90	NC_019737	ATT	3	9	7968	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303665
91	NC_019737	GCA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303665
92	NC_019737	CTG	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303665
93	NC_019737	AAG	2	6	8049	8054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303665
94	NC_019737	TCT	2	6	8062	8067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303665
95	NC_019737	TAA	2	6	8108	8113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303665
96	NC_019737	TCA	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303666
97	NC_019737	CTG	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303666
98	NC_019737	CTA	2	6	8275	8280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303666
99	NC_019737	GTT	2	6	8291	8296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303666
100	NC_019737	CTG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303666
101	NC_019737	GTG	2	6	8341	8346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303666
102	NC_019737	TGC	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303666
103	NC_019737	CAG	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303666
104	NC_019737	ACT	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303667
105	NC_019737	TGG	2	6	8895	8900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303667
106	NC_019737	ACC	2	6	8903	8908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303667
107	NC_019737	GCC	2	6	8919	8924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303667
108	NC_019737	TGG	2	6	9105	9110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303667
109	NC_019737	TAA	2	6	9221	9226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303667
110	NC_019737	TCC	2	6	9312	9317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303667
111	NC_019737	ATT	2	6	9363	9368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303667
112	NC_019737	TAA	2	6	9527	9532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303667
113	NC_019737	AGT	2	6	9648	9653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303667
114	NC_019737	TTC	2	6	9759	9764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303667
115	NC_019737	TCA	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303667
116	NC_019737	CTG	2	6	9993	9998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303668
117	NC_019737	TTA	2	6	10037	10042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303668
118	NC_019737	GCT	2	6	10079	10084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303668
119	NC_019737	TTC	2	6	10120	10125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303668
120	NC_019737	CTT	2	6	10149	10154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303668
121	NC_019737	TCT	2	6	10239	10244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303668
122	NC_019737	TGC	2	6	10274	10279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303668
123	NC_019737	AGC	2	6	11095	11100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303669
124	NC_019737	CAG	2	6	11111	11116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303669
125	NC_019737	TAA	2	6	11161	11166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303669
126	NC_019737	TAA	2	6	11211	11216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303669
127	NC_019737	GAC	2	6	11242	11247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303669
128	NC_019737	AGT	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303669
129	NC_019737	GAT	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303669
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.