MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	CG	3	6	389	394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019737	CT	3	6	2741	2746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019737	CA	3	6	3422	3427	50 %	0 %	0 %	50 %	428303662
4	NC_019737	AT	3	6	3992	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	428303662
5	NC_019737	GA	3	6	4281	4286	50 %	0 %	50 %	0 %	428303662
6	NC_019737	CT	3	6	4754	4759	0 %	50 %	0 %	50 %	428303663
7	NC_019737	TG	3	6	5135	5140	0 %	50 %	50 %	0 %	428303663
8	NC_019737	AG	3	6	5176	5181	50 %	0 %	50 %	0 %	428303663
9	NC_019737	AT	3	6	5248	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019737	TC	3	6	5346	5351	0 %	50 %	0 %	50 %	428303664
11	NC_019737	GA	3	6	5624	5629	50 %	0 %	50 %	0 %	428303664
12	NC_019737	CG	3	6	5880	5885	0 %	0 %	50 %	50 %	428303664
13	NC_019737	AT	3	6	6148	6153	50 %	50 %	0 %	0 %	428303664
14	NC_019737	AT	3	6	8388	8393	50 %	50 %	0 %	0 %	428303666
15	NC_019737	AT	3	6	8813	8818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019737	TC	3	6	9096	9101	0 %	50 %	0 %	50 %	428303667
17	NC_019737	GT	3	6	9999	10004	0 %	50 %	50 %	0 %	428303668
18	NC_019737	AG	3	6	11555	11560	50 %	0 %	50 %	0 %	428303670
19	NC_019737	AG	3	6	12043	12048	50 %	0 %	50 %	0 %	428303671
20	NC_019737	TC	3	6	12509	12514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019737	AT	3	6	12889	12894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019737	AC	3	6	12914	12919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019737	AT	3	6	13737	13742	50 %	50 %	0 %	0 %	428303674
24	NC_019737	AG	3	6	13946	13951	50 %	0 %	50 %	0 %	428303674
25	NC_019737	CT	3	6	13971	13976	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
26	NC_019737	TC	3	6	16006	16011	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
27	NC_019737	TC	5	10	16015	16024	0 %	50 %	0 %	50 %	428303674
28	NC_019737	TA	3	6	16430	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	428303675
29	NC_019737	TA	3	6	16907	16912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019737	TA	3	6	18454	18459	50 %	50 %	0 %	0 %	428303680
31	NC_019737	AG	3	6	18907	18912	50 %	0 %	50 %	0 %	428303681
32	NC_019737	AG	3	6	19473	19478	50 %	0 %	50 %	0 %	428303682
33	NC_019737	AT	3	6	20664	20669	50 %	50 %	0 %	0 %	428303685
34	NC_019737	AC	3	6	20777	20782	50 %	0 %	0 %	50 %	428303685
35	NC_019737	GA	3	6	21733	21738	50 %	0 %	50 %	0 %	428303685
36	NC_019737	AT	3	6	22128	22133	50 %	50 %	0 %	0 %	428303687
37	NC_019737	AT	3	6	23140	23145	50 %	50 %	0 %	0 %	428303688
38	NC_019737	CA	3	6	23885	23890	50 %	0 %	0 %	50 %	428303689
39	NC_019737	AT	3	6	24673	24678	50 %	50 %	0 %	0 %	428303689
40	NC_019737	AT	3	6	26154	26159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019737	TA	3	6	26491	26496	50 %	50 %	0 %	0 %	428303690

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.