MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	AGCTGA	2	12	1029	1040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308346
2	NC_019736	TCAACA	2	12	4212	4223	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019736	AATTTC	2	12	4950	4961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019736	CAGAGT	2	12	8051	8062	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308354
5	NC_019736	TAGAGC	2	12	8122	8133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308354
6	NC_019736	GCCCAA	2	12	15233	15244	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428308359
7	NC_019736	AGCTTG	2	12	15856	15867	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019736	AACTAA	2	12	20700	20711	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308364
9	NC_019736	AGGAGC	2	12	21130	21141	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428308364
10	NC_019736	ACTCCG	2	12	22794	22805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428308364
11	NC_019736	TTCCCC	2	12	25221	25232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308365
12	NC_019736	CAGCTT	2	12	25966	25977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308366
13	NC_019736	TTCCTT	2	12	27454	27465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
14	NC_019736	CGTCTG	2	12	29033	29044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
15	NC_019736	TACTGT	2	12	29361	29372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428308367
16	NC_019736	GACCTT	2	12	35350	35361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308374

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.