MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	ATTTT	2	10	2649	2658	20 %	80 %	0 %	0 %	428308349
2	NC_019736	CCTTG	2	10	5400	5409	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019736	GACGT	2	10	6181	6190	20 %	20 %	40 %	20 %	428308351
4	NC_019736	CATCG	2	10	6908	6917	20 %	20 %	20 %	40 %	428308353
5	NC_019736	GTGAG	2	10	7291	7300	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019736	CAAAC	2	10	8514	8523	60 %	0 %	0 %	40 %	428308354
7	NC_019736	ATGGG	2	10	9653	9662	20 %	20 %	60 %	0 %	428308354
8	NC_019736	CTTCT	2	10	12255	12264	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019736	ATTTT	2	10	14446	14455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019736	TGCAA	2	10	16181	16190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019736	TCAAA	2	10	16462	16471	60 %	20 %	0 %	20 %	428308361
12	NC_019736	TCCAA	2	10	17218	17227	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019736	TTGAC	2	10	19067	19076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019736	ATTTT	2	10	19765	19774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019736	AGTTG	2	10	20400	20409	20 %	40 %	40 %	0 %	428308364
16	NC_019736	GTTTT	2	10	20413	20422	0 %	80 %	20 %	0 %	428308364
17	NC_019736	AGTTT	2	10	22236	22245	20 %	60 %	20 %	0 %	428308364
18	NC_019736	CAGTA	2	10	23327	23336	40 %	20 %	20 %	20 %	428308364
19	NC_019736	GTCAA	2	10	23828	23837	40 %	20 %	20 %	20 %	428308364
20	NC_019736	AGGGA	2	10	26651	26660	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019736	TTTCT	2	10	28492	28501	0 %	80 %	0 %	20 %	428308367
22	NC_019736	TGCTG	2	10	29140	29149	0 %	40 %	40 %	20 %	428308367
23	NC_019736	TTGAA	2	10	31451	31460	40 %	40 %	20 %	0 %	428308369
24	NC_019736	TGGCG	2	10	33372	33381	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019736	GTTTT	2	10	34283	34292	0 %	80 %	20 %	0 %	428308373
26	NC_019736	GGGTT	2	10	35287	35296	0 %	40 %	60 %	0 %	428308374

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.