MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	CAAA	2	8	781	788	75 %	0 %	0 %	25 %	428308345
2	NC_019736	AAAG	2	8	1065	1072	75 %	0 %	25 %	0 %	428308346
3	NC_019736	TATT	2	8	1523	1530	25 %	75 %	0 %	0 %	428308347
4	NC_019736	TACA	2	8	1575	1582	50 %	25 %	0 %	25 %	428308347
5	NC_019736	ATCA	2	8	1972	1979	50 %	25 %	0 %	25 %	428308348
6	NC_019736	TCTA	2	8	2465	2472	25 %	50 %	0 %	25 %	428308349
7	NC_019736	TCAC	2	8	2482	2489	25 %	25 %	0 %	50 %	428308349
8	NC_019736	TAAT	2	8	2866	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019736	TAGA	2	8	3101	3108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019736	CGAG	2	8	3156	3163	25 %	0 %	50 %	25 %	428308350
11	NC_019736	CCAG	2	8	3420	3427	25 %	0 %	25 %	50 %	428308350
12	NC_019736	TAGT	2	8	4052	4059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019736	ATTT	2	8	4354	4361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019736	AGGA	2	8	5611	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019736	GACC	2	8	5919	5926	25 %	0 %	25 %	50 %	428308351
16	NC_019736	TAAT	2	8	6148	6155	50 %	50 %	0 %	0 %	428308351
17	NC_019736	ATCT	2	8	6978	6985	25 %	50 %	0 %	25 %	428308353
18	NC_019736	AATT	2	8	7465	7472	50 %	50 %	0 %	0 %	428308354
19	NC_019736	TTTA	2	8	7664	7671	25 %	75 %	0 %	0 %	428308354
20	NC_019736	ATTA	2	8	8309	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	428308354
21	NC_019736	GCGG	2	8	8930	8937	0 %	0 %	75 %	25 %	428308354
22	NC_019736	TCAT	2	8	9373	9380	25 %	50 %	0 %	25 %	428308354
23	NC_019736	TGAG	2	8	9838	9845	25 %	25 %	50 %	0 %	428308354
24	NC_019736	AATA	2	8	9991	9998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019736	TGTT	2	8	10142	10149	0 %	75 %	25 %	0 %	428308355
26	NC_019736	CAAA	2	8	10184	10191	75 %	0 %	0 %	25 %	428308355
27	NC_019736	AAAC	2	8	10731	10738	75 %	0 %	0 %	25 %	428308355
28	NC_019736	TGGA	2	8	10819	10826	25 %	25 %	50 %	0 %	428308355
29	NC_019736	TCAA	2	8	10868	10875	50 %	25 %	0 %	25 %	428308355
30	NC_019736	CTGA	2	8	10908	10915	25 %	25 %	25 %	25 %	428308355
31	NC_019736	TATT	2	8	10943	10950	25 %	75 %	0 %	0 %	428308355
32	NC_019736	GATG	2	8	11211	11218	25 %	25 %	50 %	0 %	428308355
33	NC_019736	GATT	2	8	11351	11358	25 %	50 %	25 %	0 %	428308355
34	NC_019736	ACTT	2	8	11891	11898	25 %	50 %	0 %	25 %	428308355
35	NC_019736	TAAT	2	8	12010	12017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019736	TCAC	2	8	12512	12519	25 %	25 %	0 %	50 %	428308356
37	NC_019736	AATA	2	8	12578	12585	75 %	25 %	0 %	0 %	428308356
38	NC_019736	CTGG	2	8	12592	12599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019736	GATT	2	8	12638	12645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019736	TAGA	2	8	12666	12673	50 %	25 %	25 %	0 %	428308357
41	NC_019736	ACTA	2	8	13061	13068	50 %	25 %	0 %	25 %	428308358
42	NC_019736	TTAA	2	8	13291	13298	50 %	50 %	0 %	0 %	428308358
43	NC_019736	TCAA	2	8	13612	13619	50 %	25 %	0 %	25 %	428308358
44	NC_019736	CTTC	2	8	13736	13743	0 %	50 %	0 %	50 %	428308358
45	NC_019736	ATAA	2	8	13949	13956	75 %	25 %	0 %	0 %	428308358
46	NC_019736	TCAT	2	8	14041	14048	25 %	50 %	0 %	25 %	428308358
47	NC_019736	AAGT	2	8	14124	14131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019736	AATT	2	8	14175	14182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019736	AATC	2	8	14187	14194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019736	TCGT	2	8	14707	14714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019736	AAGA	2	8	14773	14780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019736	CACC	2	8	14835	14842	25 %	0 %	0 %	75 %	428308359
53	NC_019736	ATTT	2	8	15357	15364	25 %	75 %	0 %	0 %	428308360
54	NC_019736	TTGA	2	8	15680	15687	25 %	50 %	25 %	0 %	428308360
55	NC_019736	TTAC	2	8	16317	16324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019736	CAAT	2	8	16579	16586	50 %	25 %	0 %	25 %	428308361
57	NC_019736	TTCT	2	8	17186	17193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019736	AGGT	2	8	17247	17254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019736	TTGA	2	8	19128	19135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019736	AAAT	2	8	19854	19861	75 %	25 %	0 %	0 %	428308364
61	NC_019736	TTCT	2	8	19929	19936	0 %	75 %	0 %	25 %	428308364
62	NC_019736	ATTT	2	8	20022	20029	25 %	75 %	0 %	0 %	428308364
63	NC_019736	GAGC	2	8	20274	20281	25 %	0 %	50 %	25 %	428308364
64	NC_019736	TTGC	2	8	20307	20314	0 %	50 %	25 %	25 %	428308364
65	NC_019736	CATT	2	8	22214	22221	25 %	50 %	0 %	25 %	428308364
66	NC_019736	TGAC	2	8	22222	22229	25 %	25 %	25 %	25 %	428308364
67	NC_019736	TACC	2	8	22361	22368	25 %	25 %	0 %	50 %	428308364
68	NC_019736	CCAA	2	8	22417	22424	50 %	0 %	0 %	50 %	428308364
69	NC_019736	CTTT	2	8	22511	22518	0 %	75 %	0 %	25 %	428308364
70	NC_019736	AAAG	2	8	22921	22928	75 %	0 %	25 %	0 %	428308364
71	NC_019736	ATAG	2	8	22984	22991	50 %	25 %	25 %	0 %	428308364
72	NC_019736	TAAA	2	8	23206	23213	75 %	25 %	0 %	0 %	428308364
73	NC_019736	GATT	2	8	24547	24554	25 %	50 %	25 %	0 %	428308365
74	NC_019736	TCTA	2	8	24699	24706	25 %	50 %	0 %	25 %	428308365
75	NC_019736	CATC	2	8	24710	24717	25 %	25 %	0 %	50 %	428308365
76	NC_019736	GATC	2	8	25190	25197	25 %	25 %	25 %	25 %	428308365
77	NC_019736	GCTA	2	8	25911	25918	25 %	25 %	25 %	25 %	428308366
78	NC_019736	GATT	2	8	26157	26164	25 %	50 %	25 %	0 %	428308366
79	NC_019736	GAAG	2	8	26250	26257	50 %	0 %	50 %	0 %	428308366
80	NC_019736	AAAG	2	8	26511	26518	75 %	0 %	25 %	0 %	428308366
81	NC_019736	ATTA	2	8	27108	27115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019736	AATT	2	8	27326	27333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019736	TGAC	2	8	27628	27635	25 %	25 %	25 %	25 %	428308367
84	NC_019736	GTTT	2	8	27690	27697	0 %	75 %	25 %	0 %	428308367
85	NC_019736	CATT	2	8	28208	28215	25 %	50 %	0 %	25 %	428308367
86	NC_019736	GTCC	2	8	28886	28893	0 %	25 %	25 %	50 %	428308367
87	NC_019736	TGCT	2	8	29589	29596	0 %	50 %	25 %	25 %	428308367
88	NC_019736	TTAT	2	8	29672	29679	25 %	75 %	0 %	0 %	428308367
89	NC_019736	TTCT	2	8	30067	30074	0 %	75 %	0 %	25 %	428308367
90	NC_019736	TTGA	2	8	30626	30633	25 %	50 %	25 %	0 %	428308368
91	NC_019736	AGTA	2	8	30914	30921	50 %	25 %	25 %	0 %	428308368
92	NC_019736	CAAA	2	8	31084	31091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019736	AATA	2	8	31104	31111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019736	AGTA	2	8	31421	31428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019736	TTGA	2	8	31835	31842	25 %	50 %	25 %	0 %	428308369
96	NC_019736	TGAG	2	8	32885	32892	25 %	25 %	50 %	0 %	428308370
97	NC_019736	ACTA	2	8	33315	33322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019736	TAGT	2	8	33347	33354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019736	AATT	2	8	33357	33364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019736	AATT	2	8	34934	34941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019736	TTAC	2	8	35498	35505	25 %	50 %	0 %	25 %	428308374
102	NC_019736	TTCT	2	8	35541	35548	0 %	75 %	0 %	25 %	428308374
103	NC_019736	TTGA	2	8	36775	36782	25 %	50 %	25 %	0 %	428308374
104	NC_019736	AGCA	2	8	37118	37125	50 %	0 %	25 %	25 %	428308374
105	NC_019736	TAAT	2	8	38022	38029	50 %	50 %	0 %	0 %	428308374
106	NC_019736	TTCC	2	8	38059	38066	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
107	NC_019736	TGAT	2	8	38299	38306	25 %	50 %	25 %	0 %	428308374
108	NC_019736	TTTG	2	8	38316	38323	0 %	75 %	25 %	0 %	428308374
109	NC_019736	CTGG	2	8	38602	38609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019736	GGTT	2	8	38782	38789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019736	CCTT	2	8	38807	38814	0 %	50 %	0 %	50 %	428308376

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.