MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	ATG	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019736	CAA	2	6	170	175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308344
3	NC_019736	CAG	3	9	188	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308344
4	NC_019736	AAC	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308345
5	NC_019736	GCT	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308345
6	NC_019736	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308345
7	NC_019736	TGG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308345
8	NC_019736	TAA	2	6	811	816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308345
9	NC_019736	ACT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
10	NC_019736	TGG	2	6	873	878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308346
11	NC_019736	ACG	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
12	NC_019736	CTA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
13	NC_019736	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
14	NC_019736	GTA	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308346
15	NC_019736	TAA	2	6	1023	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308346
16	NC_019736	ACA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308346
17	NC_019736	CAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
18	NC_019736	GCT	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
19	NC_019736	TAC	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019736	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308347
21	NC_019736	GGT	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308347
22	NC_019736	GTT	2	6	1510	1515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308347
23	NC_019736	GAC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308347
24	NC_019736	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308347
25	NC_019736	TCG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308348
26	NC_019736	GTA	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308348
27	NC_019736	TGG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308348
28	NC_019736	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308348
29	NC_019736	CAG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
30	NC_019736	CAC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308348
31	NC_019736	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308348
32	NC_019736	AAC	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308348
33	NC_019736	CAG	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
34	NC_019736	ATT	2	6	2336	2341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019736	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
36	NC_019736	AAC	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
37	NC_019736	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
38	NC_019736	ACA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
39	NC_019736	TCA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
40	NC_019736	TTA	2	6	2683	2688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019736	TAG	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019736	GTA	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019736	AAT	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019736	ATA	3	9	3047	3055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019736	TAC	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019736	GCA	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019736	ATA	2	6	3120	3125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019736	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
49	NC_019736	GAC	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
50	NC_019736	AGA	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
51	NC_019736	AGC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
52	NC_019736	GTT	2	6	3380	3385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308350
53	NC_019736	TGA	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308350
54	NC_019736	GCG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308350
55	NC_019736	GCC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308350
56	NC_019736	CAC	3	9	3692	3700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019736	CTG	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019736	ACA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019736	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019736	TGC	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019736	GAA	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019736	TAG	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019736	AAT	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019736	TGC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019736	CTA	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019736	CTA	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019736	CGG	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019736	AGT	2	6	4320	4325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019736	GCA	2	6	4434	4439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019736	ACC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019736	ACA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019736	GCC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019736	CTG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019736	CGG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019736	GTC	3	9	5227	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019736	ATG	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019736	TCC	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019736	CTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019736	TGG	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019736	ACT	2	6	5465	5470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019736	CCT	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019736	GCT	2	6	5526	5531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019736	GAC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019736	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
85	NC_019736	AGC	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
86	NC_019736	GCA	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
87	NC_019736	ACC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
88	NC_019736	GTA	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
89	NC_019736	CCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
90	NC_019736	CAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308351
91	NC_019736	TGC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308351
92	NC_019736	GCA	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
93	NC_019736	AAG	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308351
94	NC_019736	CAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
95	NC_019736	TAA	2	6	6349	6354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019736	CTA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019736	ATT	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019736	TGT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
99	NC_019736	GTA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308352
100	NC_019736	TCA	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308352
101	NC_019736	TGT	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
102	NC_019736	CTC	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019736	GTT	2	6	6736	6741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019736	ATT	2	6	6759	6764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019736	TAA	2	6	6826	6831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019736	ATT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308353
107	NC_019736	GAT	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308353
108	NC_019736	ATT	2	6	6936	6941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308353
109	NC_019736	AGA	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308353
110	NC_019736	CTA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308353
111	NC_019736	CTG	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308353
112	NC_019736	TGA	2	6	7200	7205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019736	CAA	2	6	7359	7364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019736	AAC	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
115	NC_019736	GTA	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
116	NC_019736	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
117	NC_019736	TTG	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
118	NC_019736	AGT	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
119	NC_019736	GAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
120	NC_019736	TGG	2	6	7715	7720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308354
121	NC_019736	ATT	2	6	7745	7750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
122	NC_019736	CAG	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
123	NC_019736	AAT	2	6	7787	7792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
124	NC_019736	TGA	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
125	NC_019736	GAA	2	6	7910	7915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
126	NC_019736	TTG	2	6	7930	7935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
127	NC_019736	AAT	2	6	8106	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
128	NC_019736	GCT	2	6	8175	8180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308354
129	NC_019736	TCA	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308354
130	NC_019736	GAT	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
131	NC_019736	TGA	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
132	NC_019736	ACA	2	6	8650	8655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
133	NC_019736	AAC	2	6	8669	8674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
134	NC_019736	AGT	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
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260	NC_019736	GTT	2	6	16522	16527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308361
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263	NC_019736	CTG	2	6	17091	17096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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