MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	AACTAA	2	12	362	373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428303617
2	NC_019735	TGATGT	2	12	578	589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303617
3	NC_019735	CTAAAA	2	12	4741	4752	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019735	GCTGAT	2	12	7068	7079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428303622
5	NC_019735	GCATCA	2	12	8277	8288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303623
6	NC_019735	CAAGTG	2	12	13955	13966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428303629
7	NC_019735	CCTCTG	2	12	15670	15681	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428303631
8	NC_019735	AAACTT	2	12	17686	17697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428303632
9	NC_019735	TCGCTA	2	12	19080	19091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428303634
10	NC_019735	ATGATT	2	12	21777	21788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019735	TGAAGA	2	12	23860	23871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428303641
12	NC_019735	TTCAGG	2	12	28089	28100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428303645
13	NC_019735	TTGTGC	2	12	28113	28124	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428303645
14	NC_019735	AACGCT	2	12	28509	28520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303646
15	NC_019735	AAGGTA	2	12	30279	30290	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019735	TAGCAA	2	12	30362	30373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019735	AATCTA	2	12	39542	39553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428303653
18	NC_019735	AGTTTG	2	12	41916	41927	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.