MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	CGACT	2	10	1341	1350	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019735	GGAAC	2	10	2200	2209	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019735	AAAGA	2	10	3627	3636	80 %	0 %	20 %	0 %	428303619
4	NC_019735	GCCAA	2	10	4272	4281	40 %	0 %	20 %	40 %	428303619
5	NC_019735	CTGAC	2	10	7685	7694	20 %	20 %	20 %	40 %	428303623
6	NC_019735	CAAGT	2	10	8972	8981	40 %	20 %	20 %	20 %	428303624
7	NC_019735	ATATT	2	10	9420	9429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019735	AACAA	2	10	11096	11105	80 %	0 %	0 %	20 %	428303626
9	NC_019735	TTTCC	2	10	13850	13859	0 %	60 %	0 %	40 %	428303629
10	NC_019735	GGATG	2	10	14258	14267	20 %	20 %	60 %	0 %	428303630
11	NC_019735	CCCAT	2	10	14385	14394	20 %	20 %	0 %	60 %	428303630
12	NC_019735	ATCCG	2	10	15582	15591	20 %	20 %	20 %	40 %	428303631
13	NC_019735	AATAC	2	10	16206	16215	60 %	20 %	0 %	20 %	428303631
14	NC_019735	TAAAT	2	10	16580	16589	60 %	40 %	0 %	0 %	428303631
15	NC_019735	AATAT	2	10	17055	17064	60 %	40 %	0 %	0 %	428303631
16	NC_019735	CTTTG	2	10	20134	20143	0 %	60 %	20 %	20 %	428303636
17	NC_019735	GTACT	2	10	21349	21358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019735	ATTTA	2	10	21735	21744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019735	TTTCC	2	10	21934	21943	0 %	60 %	0 %	40 %	428303640
20	NC_019735	CAAAT	2	10	21946	21955	60 %	20 %	0 %	20 %	428303640
21	NC_019735	TGTTA	2	10	22212	22221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019735	CAGGA	2	10	22827	22836	40 %	0 %	40 %	20 %	428303641
23	NC_019735	CACAA	2	10	26503	26512	60 %	0 %	0 %	40 %	428303642
24	NC_019735	CAAAT	2	10	28312	28321	60 %	20 %	0 %	20 %	428303645
25	NC_019735	AAATT	2	10	32271	32280	60 %	40 %	0 %	0 %	428303648
26	NC_019735	ATGGC	2	10	32941	32950	20 %	20 %	40 %	20 %	428303648
27	NC_019735	ACGAA	2	10	33308	33317	60 %	0 %	20 %	20 %	428303648
28	NC_019735	ACTTT	2	10	33940	33949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019735	ACTGC	2	10	36472	36481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019735	GCAGA	2	10	37129	37138	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019735	ACAAA	2	10	38296	38305	80 %	0 %	0 %	20 %	428303652
32	NC_019735	GGTGA	2	10	39296	39305	20 %	20 %	60 %	0 %	428303653
33	NC_019735	ATTTG	2	10	40479	40488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019735	AAAAT	2	10	41081	41090	80 %	20 %	0 %	0 %	428303654
35	NC_019735	ACTGC	2	10	42105	42114	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019735	ACACT	2	10	44031	44040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.