MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	AAAGA	2	10	3627	3636	80 %	0 %	20 %	0 %	428303619
2	NC_019735	GCCAA	2	10	4272	4281	40 %	0 %	20 %	40 %	428303619
3	NC_019735	CTGAC	2	10	7685	7694	20 %	20 %	20 %	40 %	428303623
4	NC_019735	CAAGT	2	10	8972	8981	40 %	20 %	20 %	20 %	428303624
5	NC_019735	AACAA	2	10	11096	11105	80 %	0 %	0 %	20 %	428303626
6	NC_019735	TTTCC	2	10	13850	13859	0 %	60 %	0 %	40 %	428303629
7	NC_019735	GGATG	2	10	14258	14267	20 %	20 %	60 %	0 %	428303630
8	NC_019735	CCCAT	2	10	14385	14394	20 %	20 %	0 %	60 %	428303630
9	NC_019735	ATCCG	2	10	15582	15591	20 %	20 %	20 %	40 %	428303631
10	NC_019735	AATAC	2	10	16206	16215	60 %	20 %	0 %	20 %	428303631
11	NC_019735	TAAAT	2	10	16580	16589	60 %	40 %	0 %	0 %	428303631
12	NC_019735	AATAT	2	10	17055	17064	60 %	40 %	0 %	0 %	428303631
13	NC_019735	CTTTG	2	10	20134	20143	0 %	60 %	20 %	20 %	428303636
14	NC_019735	TTTCC	2	10	21934	21943	0 %	60 %	0 %	40 %	428303640
15	NC_019735	CAAAT	2	10	21946	21955	60 %	20 %	0 %	20 %	428303640
16	NC_019735	CAGGA	2	10	22827	22836	40 %	0 %	40 %	20 %	428303641
17	NC_019735	CACAA	2	10	26503	26512	60 %	0 %	0 %	40 %	428303642
18	NC_019735	CAAAT	2	10	28312	28321	60 %	20 %	0 %	20 %	428303645
19	NC_019735	AAATT	2	10	32271	32280	60 %	40 %	0 %	0 %	428303648
20	NC_019735	ATGGC	2	10	32941	32950	20 %	20 %	40 %	20 %	428303648
21	NC_019735	ACGAA	2	10	33308	33317	60 %	0 %	20 %	20 %	428303648
22	NC_019735	ACAAA	2	10	38296	38305	80 %	0 %	0 %	20 %	428303652
23	NC_019735	GGTGA	2	10	39296	39305	20 %	20 %	60 %	0 %	428303653
24	NC_019735	AAAAT	2	10	41081	41090	80 %	20 %	0 %	0 %	428303654

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.