MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	CTAA	2	8	330	337	50 %	25 %	0 %	25 %	428303617
2	NC_019735	ATGT	2	8	492	499	25 %	50 %	25 %	0 %	428303617
3	NC_019735	TGTT	2	8	565	572	0 %	75 %	25 %	0 %	428303617
4	NC_019735	CTAA	2	8	697	704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019735	TCCC	2	8	1087	1094	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_019735	GCAA	2	8	1222	1229	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019735	GTAG	2	8	1471	1478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019735	AGTA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019735	ATCA	2	8	2186	2193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019735	CTAA	2	8	2751	2758	50 %	25 %	0 %	25 %	428303619
11	NC_019735	AATC	2	8	3107	3114	50 %	25 %	0 %	25 %	428303619
12	NC_019735	ATGG	2	8	3192	3199	25 %	25 %	50 %	0 %	428303619
13	NC_019735	CAGG	2	8	3908	3915	25 %	0 %	50 %	25 %	428303619
14	NC_019735	TAAT	2	8	4624	4631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019735	GAAT	2	8	4886	4893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019735	TAGA	2	8	4963	4970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019735	GGGT	2	8	5338	5345	0 %	25 %	75 %	0 %	428303620
18	NC_019735	ATTT	2	8	5537	5544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019735	CTTG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019735	CTTT	2	8	5822	5829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019735	TAAC	2	8	6233	6240	50 %	25 %	0 %	25 %	428303621
22	NC_019735	TATC	2	8	6597	6604	25 %	50 %	0 %	25 %	428303622
23	NC_019735	TTTA	2	8	6878	6885	25 %	75 %	0 %	0 %	428303622
24	NC_019735	CCGA	2	8	6988	6995	25 %	0 %	25 %	50 %	428303622
25	NC_019735	TTTG	2	8	7601	7608	0 %	75 %	25 %	0 %	428303623
26	NC_019735	TTGA	2	8	7741	7748	25 %	50 %	25 %	0 %	428303623
27	NC_019735	GGCA	2	8	8427	8434	25 %	0 %	50 %	25 %	428303623
28	NC_019735	AGTG	2	8	9599	9606	25 %	25 %	50 %	0 %	428303625
29	NC_019735	ATCT	2	8	10183	10190	25 %	50 %	0 %	25 %	428303625
30	NC_019735	ATCG	2	8	10241	10248	25 %	25 %	25 %	25 %	428303625
31	NC_019735	ATTT	2	8	10283	10290	25 %	75 %	0 %	0 %	428303625
32	NC_019735	GGAC	2	8	10727	10734	25 %	0 %	50 %	25 %	428303626
33	NC_019735	ATAA	2	8	10804	10811	75 %	25 %	0 %	0 %	428303626
34	NC_019735	GAAA	2	8	11133	11140	75 %	0 %	25 %	0 %	428303626
35	NC_019735	GGTA	2	8	11677	11684	25 %	25 %	50 %	0 %	428303627
36	NC_019735	CTGC	2	8	12138	12145	0 %	25 %	25 %	50 %	428303628
37	NC_019735	CAAT	2	8	12483	12490	50 %	25 %	0 %	25 %	428303628
38	NC_019735	TGGG	2	8	13380	13387	0 %	25 %	75 %	0 %	428303629
39	NC_019735	TGTT	2	8	13410	13417	0 %	75 %	25 %	0 %	428303629
40	NC_019735	AGCT	2	8	13475	13482	25 %	25 %	25 %	25 %	428303629
41	NC_019735	CTGC	2	8	13637	13644	0 %	25 %	25 %	50 %	428303629
42	NC_019735	CAAA	2	8	13721	13728	75 %	0 %	0 %	25 %	428303629
43	NC_019735	ATTT	2	8	13818	13825	25 %	75 %	0 %	0 %	428303629
44	NC_019735	TTGA	2	8	13879	13886	25 %	50 %	25 %	0 %	428303629
45	NC_019735	GATC	2	8	14395	14402	25 %	25 %	25 %	25 %	428303630
46	NC_019735	GATC	2	8	14795	14802	25 %	25 %	25 %	25 %	428303630
47	NC_019735	CAAA	2	8	15496	15503	75 %	0 %	0 %	25 %	428303631
48	NC_019735	CATC	2	8	15688	15695	25 %	25 %	0 %	50 %	428303631
49	NC_019735	TCCC	2	8	15791	15798	0 %	25 %	0 %	75 %	428303631
50	NC_019735	AAAT	2	8	16289	16296	75 %	25 %	0 %	0 %	428303631
51	NC_019735	TAAT	2	8	16450	16457	50 %	50 %	0 %	0 %	428303631
52	NC_019735	AATC	2	8	16915	16922	50 %	25 %	0 %	25 %	428303631
53	NC_019735	CTTA	2	8	17317	17324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019735	ATTA	2	8	17583	17590	50 %	50 %	0 %	0 %	428303632
55	NC_019735	ATCC	2	8	18891	18898	25 %	25 %	0 %	50 %	428303633
56	NC_019735	CTGA	2	8	19324	19331	25 %	25 %	25 %	25 %	428303634
57	NC_019735	ACCA	2	8	19799	19806	50 %	0 %	0 %	50 %	428303635
58	NC_019735	TTTG	2	8	19987	19994	0 %	75 %	25 %	0 %	428303636
59	NC_019735	CTTT	2	8	20233	20240	0 %	75 %	0 %	25 %	428303636
60	NC_019735	GCTG	2	8	20768	20775	0 %	25 %	50 %	25 %	428303637
61	NC_019735	CTGT	2	8	20809	20816	0 %	50 %	25 %	25 %	428303637
62	NC_019735	TAAT	2	8	21376	21383	50 %	50 %	0 %	0 %	428303639
63	NC_019735	TTAC	2	8	21447	21454	25 %	50 %	0 %	25 %	428303639
64	NC_019735	GATT	2	8	21613	21620	25 %	50 %	25 %	0 %	428303639
65	NC_019735	ATTA	2	8	21832	21839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019735	CCCG	2	8	21990	21997	0 %	0 %	25 %	75 %	428303640
67	NC_019735	ATTT	2	8	22170	22177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019735	TGTA	2	8	22240	22247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019735	ACCA	2	8	22276	22283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019735	AGCA	2	8	22659	22666	50 %	0 %	25 %	25 %	428303641
71	NC_019735	AAAC	2	8	23501	23508	75 %	0 %	0 %	25 %	428303641
72	NC_019735	AAAG	2	8	23798	23805	75 %	0 %	25 %	0 %	428303641
73	NC_019735	TGAT	2	8	24660	24667	25 %	50 %	25 %	0 %	428303641
74	NC_019735	ACCG	2	8	24762	24769	25 %	0 %	25 %	50 %	428303641
75	NC_019735	TGAT	2	8	24861	24868	25 %	50 %	25 %	0 %	428303641
76	NC_019735	GGAT	2	8	25021	25028	25 %	25 %	50 %	0 %	428303641
77	NC_019735	TTGA	2	8	25649	25656	25 %	50 %	25 %	0 %	428303641
78	NC_019735	AACA	2	8	26114	26121	75 %	0 %	0 %	25 %	428303641
79	NC_019735	ACCA	2	8	27985	27992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019735	TCAT	2	8	28444	28451	25 %	50 %	0 %	25 %	428303645
81	NC_019735	AAAC	2	8	28481	28488	75 %	0 %	0 %	25 %	428303646
82	NC_019735	ATCA	2	8	28496	28503	50 %	25 %	0 %	25 %	428303646
83	NC_019735	CTTC	2	8	29157	29164	0 %	50 %	0 %	50 %	428303646
84	NC_019735	TATT	2	8	30265	30272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019735	TAAA	2	8	30449	30456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019735	TAAT	2	8	30508	30515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019735	CGTT	2	8	30871	30878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019735	ACTG	2	8	30907	30914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019735	TACT	2	8	31172	31179	25 %	50 %	0 %	25 %	428303647
90	NC_019735	AATT	2	8	31193	31200	50 %	50 %	0 %	0 %	428303647
91	NC_019735	TCTA	2	8	31486	31493	25 %	50 %	0 %	25 %	428303648
92	NC_019735	GATA	2	8	31586	31593	50 %	25 %	25 %	0 %	428303648
93	NC_019735	AGAC	2	8	31700	31707	50 %	0 %	25 %	25 %	428303648
94	NC_019735	TTTG	2	8	32507	32514	0 %	75 %	25 %	0 %	428303648
95	NC_019735	TAAC	2	8	33759	33766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019735	TTAA	2	8	33826	33833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019735	CCCA	2	8	34508	34515	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_019735	ATTT	2	8	34800	34807	25 %	75 %	0 %	0 %	428303649
99	NC_019735	GATG	2	8	35435	35442	25 %	25 %	50 %	0 %	428303649
100	NC_019735	TTAC	2	8	35535	35542	25 %	50 %	0 %	25 %	428303649
101	NC_019735	TTAT	2	8	35728	35735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019735	CATA	2	8	36114	36121	50 %	25 %	0 %	25 %	428303650
103	NC_019735	TACT	2	8	36881	36888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019735	TTGG	2	8	38356	38363	0 %	50 %	50 %	0 %	428303652
105	NC_019735	TAAA	2	8	38477	38484	75 %	25 %	0 %	0 %	428303652
106	NC_019735	AAAT	2	8	39404	39411	75 %	25 %	0 %	0 %	428303653
107	NC_019735	CTTC	2	8	39494	39501	0 %	50 %	0 %	50 %	428303653
108	NC_019735	ATCA	2	8	39738	39745	50 %	25 %	0 %	25 %	428303653
109	NC_019735	TATG	2	8	40102	40109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019735	CATT	2	8	40114	40121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019735	CTTA	2	8	40705	40712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019735	TGTA	2	8	40988	40995	25 %	50 %	25 %	0 %	428303654
113	NC_019735	GAAT	2	8	41040	41047	50 %	25 %	25 %	0 %	428303654
114	NC_019735	GAAA	2	8	41652	41659	75 %	0 %	25 %	0 %	428303654
115	NC_019735	GATT	2	8	41697	41704	25 %	50 %	25 %	0 %	428303654
116	NC_019735	CAGT	2	8	42530	42537	25 %	25 %	25 %	25 %	428303656
117	NC_019735	GAGG	2	8	43409	43416	25 %	0 %	75 %	0 %	428303658
118	NC_019735	AAGG	2	8	43641	43648	50 %	0 %	50 %	0 %	428303658
119	NC_019735	TGTT	2	8	44072	44079	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.