MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	ACA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303617
2	NC_019735	AAC	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303617
3	NC_019735	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303617
4	NC_019735	GAT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303617
5	NC_019735	GAA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303617
6	NC_019735	TAA	2	6	611	616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303617
7	NC_019735	TAT	2	6	619	624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303617
8	NC_019735	TAA	2	6	644	649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303617
9	NC_019735	GTG	2	6	776	781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303618
10	NC_019735	CAT	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303618
11	NC_019735	AGA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303618
12	NC_019735	ATG	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303619
13	NC_019735	TTA	2	6	3255	3260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303619
14	NC_019735	GAA	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
15	NC_019735	TTA	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303619
16	NC_019735	TCA	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303619
17	NC_019735	ATA	2	6	3666	3671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303619
18	NC_019735	AGC	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303619
19	NC_019735	TAT	2	6	3744	3749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303619
20	NC_019735	GTT	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303619
21	NC_019735	CGC	2	6	3825	3830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303619
22	NC_019735	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
23	NC_019735	AAG	2	6	4299	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
24	NC_019735	GAA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303619
25	NC_019735	CTT	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303620
26	NC_019735	GGT	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303620
27	NC_019735	TAG	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303620
28	NC_019735	CTC	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303621
29	NC_019735	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303621
30	NC_019735	TAC	3	9	6001	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303621
31	NC_019735	TGA	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303621
32	NC_019735	AAC	2	6	6208	6213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303621
33	NC_019735	TAC	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303622
34	NC_019735	AAC	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303622
35	NC_019735	TGC	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303622
36	NC_019735	AAC	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303622
37	NC_019735	TCA	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303622
38	NC_019735	GCA	2	6	7176	7181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303622
39	NC_019735	GAA	2	6	7465	7470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303623
40	NC_019735	GCT	3	9	7485	7493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303623
41	NC_019735	AGA	2	6	7497	7502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303623
42	NC_019735	CTT	2	6	7512	7517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303623
43	NC_019735	AGC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303623
44	NC_019735	ATT	2	6	7571	7576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303623
45	NC_019735	TGG	2	6	7969	7974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303623
46	NC_019735	GAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303623
47	NC_019735	ACA	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303623
48	NC_019735	AAT	2	6	8233	8238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303623
49	NC_019735	GCA	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303623
50	NC_019735	TAA	2	6	8671	8676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303624
51	NC_019735	CTT	2	6	8725	8730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303624
52	NC_019735	AGC	2	6	8740	8745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303624
53	NC_019735	AGT	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303624
54	NC_019735	ATG	2	6	8820	8825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303624
55	NC_019735	AAC	2	6	8835	8840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303624
56	NC_019735	TAA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303624
57	NC_019735	AAG	2	6	8991	8996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303624
58	NC_019735	TGC	2	6	9085	9090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303624
59	NC_019735	TGA	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303624
60	NC_019735	GAT	2	6	9702	9707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303625
61	NC_019735	GTT	2	6	10029	10034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303625
62	NC_019735	AAT	2	6	10442	10447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303626
63	NC_019735	GCG	2	6	10474	10479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303626
64	NC_019735	CAA	2	6	10582	10587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303626
65	NC_019735	CAA	2	6	10668	10673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303626
66	NC_019735	GCT	2	6	10835	10840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303626
67	NC_019735	CTG	2	6	10871	10876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303626
68	NC_019735	GCA	2	6	10913	10918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303626
69	NC_019735	CGC	2	6	10938	10943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303626
70	NC_019735	AAG	2	6	11064	11069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303626
71	NC_019735	GAA	2	6	11166	11171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303627
72	NC_019735	ACA	2	6	11283	11288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303627
73	NC_019735	ATG	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303627
74	NC_019735	GGA	2	6	11386	11391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303627
75	NC_019735	AGC	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303627
76	NC_019735	TTG	2	6	11498	11503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303627
77	NC_019735	CCA	2	6	11572	11577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303627
78	NC_019735	CAT	2	6	11728	11733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303627
79	NC_019735	AAT	2	6	11822	11827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303627
80	NC_019735	TAA	2	6	11833	11838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303627
81	NC_019735	CTC	2	6	12018	12023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303628
82	NC_019735	ATC	2	6	12241	12246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303628
83	NC_019735	TGC	2	6	12311	12316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303628
84	NC_019735	CGG	2	6	12334	12339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303628
85	NC_019735	ATG	2	6	12523	12528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303628
86	NC_019735	AGC	2	6	12559	12564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303628
87	NC_019735	CTT	2	6	12917	12922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303629
88	NC_019735	TCT	2	6	12949	12954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303629
89	NC_019735	AGT	2	6	12991	12996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303629
90	NC_019735	ATA	2	6	13021	13026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303629
91	NC_019735	ATA	2	6	13076	13081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303629
92	NC_019735	ATC	2	6	13083	13088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303629
93	NC_019735	ATC	2	6	13095	13100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303629
94	NC_019735	TCA	2	6	13141	13146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303629
95	NC_019735	ACC	2	6	13298	13303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303629
96	NC_019735	ATT	2	6	13591	13596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303629
97	NC_019735	TTC	2	6	13602	13607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303629
98	NC_019735	GAT	2	6	13787	13792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303629
99	NC_019735	ATA	2	6	13923	13928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303629
100	NC_019735	GTT	2	6	14003	14008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303629
101	NC_019735	CTG	2	6	14028	14033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303629
102	NC_019735	TAA	2	6	14166	14171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303629
103	NC_019735	AAT	2	6	14308	14313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303630
104	NC_019735	CAC	2	6	14431	14436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303630
105	NC_019735	TCG	2	6	14509	14514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303630
106	NC_019735	TCA	2	6	14528	14533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303630
107	NC_019735	AAT	2	6	14602	14607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303630
108	NC_019735	AGA	2	6	14625	14630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303630
109	NC_019735	GTT	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303630
110	NC_019735	CTT	2	6	14884	14889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303630
111	NC_019735	GTA	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303630
112	NC_019735	TGC	2	6	15129	15134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303630
113	NC_019735	GTC	2	6	15466	15471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303630
114	NC_019735	CTG	2	6	15659	15664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303631
115	NC_019735	TCG	2	6	15700	15705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303631
116	NC_019735	TCA	2	6	15708	15713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303631
117	NC_019735	CAC	2	6	15716	15721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303631
118	NC_019735	TTC	2	6	15785	15790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303631
119	NC_019735	GTG	2	6	16171	16176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303631
120	NC_019735	TAA	3	9	16432	16440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303631
121	NC_019735	AGT	2	6	16508	16513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303631
122	NC_019735	TGC	2	6	16539	16544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303631
123	NC_019735	TAA	2	6	16564	16569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303631
124	NC_019735	ATA	2	6	16735	16740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303631
125	NC_019735	TGA	2	6	16747	16752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303631
126	NC_019735	GTT	2	6	16980	16985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303631
127	NC_019735	CAA	2	6	17021	17026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303631
128	NC_019735	CAA	2	6	17116	17121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303631
129	NC_019735	TAA	2	6	17128	17133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303631
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136	NC_019735	AGT	2	6	18557	18562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303633
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247	NC_019735	TCT	2	6	28381	28386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303645
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.