MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	TA	4	8	11	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019735	AT	3	6	21	26	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019735	TA	3	6	70	75	50 %	50 %	0 %	0 %	428303617
4	NC_019735	AT	3	6	314	319	50 %	50 %	0 %	0 %	428303617
5	NC_019735	CA	3	6	1115	1120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019735	CT	3	6	1446	1451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019735	CA	3	6	3486	3491	50 %	0 %	0 %	50 %	428303619
8	NC_019735	TA	3	6	4921	4926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019735	AC	3	6	6835	6840	50 %	0 %	0 %	50 %	428303622
10	NC_019735	GT	3	6	7011	7016	0 %	50 %	50 %	0 %	428303622
11	NC_019735	GA	3	6	9313	9318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019735	TG	3	6	9752	9757	0 %	50 %	50 %	0 %	428303625
13	NC_019735	AC	3	6	10642	10647	50 %	0 %	0 %	50 %	428303626
14	NC_019735	AC	3	6	12111	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	428303628
15	NC_019735	TC	3	6	12842	12847	0 %	50 %	0 %	50 %	428303629
16	NC_019735	CT	3	6	13170	13175	0 %	50 %	0 %	50 %	428303629
17	NC_019735	TA	3	6	14271	14276	50 %	50 %	0 %	0 %	428303630
18	NC_019735	AG	3	6	14974	14979	50 %	0 %	50 %	0 %	428303630
19	NC_019735	GA	4	8	16763	16770	50 %	0 %	50 %	0 %	428303631
20	NC_019735	GT	3	6	20153	20158	0 %	50 %	50 %	0 %	428303636
21	NC_019735	GT	3	6	20160	20165	0 %	50 %	50 %	0 %	428303636
22	NC_019735	CT	3	6	20733	20738	0 %	50 %	0 %	50 %	428303637
23	NC_019735	CT	3	6	20859	20864	0 %	50 %	0 %	50 %	428303637
24	NC_019735	CA	4	8	21003	21010	50 %	0 %	0 %	50 %	428303638
25	NC_019735	AT	4	8	21247	21254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019735	TG	3	6	21258	21263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019735	TA	3	6	21743	21748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019735	AC	3	6	22023	22028	50 %	0 %	0 %	50 %	428303640
29	NC_019735	TA	3	6	25861	25866	50 %	50 %	0 %	0 %	428303641
30	NC_019735	CA	3	6	25994	25999	50 %	0 %	0 %	50 %	428303641
31	NC_019735	AG	3	6	26854	26859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019735	AT	3	6	27660	27665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019735	TC	3	6	28054	28059	0 %	50 %	0 %	50 %	428303645
34	NC_019735	CT	3	6	29887	29892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019735	CA	3	6	30107	30112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019735	TA	3	6	30404	30409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019735	TA	3	6	30413	30418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019735	AG	3	6	30863	30868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019735	AC	3	6	31043	31048	50 %	0 %	0 %	50 %	428303647
40	NC_019735	TC	3	6	31414	31419	0 %	50 %	0 %	50 %	428303648
41	NC_019735	CG	3	6	31739	31744	0 %	0 %	50 %	50 %	428303648
42	NC_019735	TA	4	8	33200	33207	50 %	50 %	0 %	0 %	428303648
43	NC_019735	TG	3	6	34285	34290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019735	GT	3	6	35264	35269	0 %	50 %	50 %	0 %	428303649
45	NC_019735	AG	3	6	35624	35629	50 %	0 %	50 %	0 %	428303649
46	NC_019735	AT	3	6	35749	35754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019735	AC	3	6	35847	35852	50 %	0 %	0 %	50 %	428303650
48	NC_019735	AG	3	6	36085	36090	50 %	0 %	50 %	0 %	428303650
49	NC_019735	TG	3	6	36951	36956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019735	AT	3	6	37339	37344	50 %	50 %	0 %	0 %	428303651
51	NC_019735	AT	3	6	38221	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	428303651
52	NC_019735	CT	3	6	38504	38509	0 %	50 %	0 %	50 %	428303652
53	NC_019735	TC	3	6	39158	39163	0 %	50 %	0 %	50 %	428303653
54	NC_019735	AG	3	6	40229	40234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019735	GT	3	6	40313	40318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019735	GT	3	6	40609	40614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019735	TA	3	6	41104	41109	50 %	50 %	0 %	0 %	428303654
58	NC_019735	CG	3	6	41980	41985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019735	TC	3	6	43162	43167	0 %	50 %	0 %	50 %	428303657

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.