MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	TTTTGA	2	12	2676	2687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428308295
2	NC_019734	TTCTGG	2	12	5351	5362	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428308296
3	NC_019734	AAATTC	2	12	5861	5872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428308296
4	NC_019734	AATTGA	2	12	9227	9238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428308299
5	NC_019734	TTTCTT	2	12	16402	16413	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428308304
6	NC_019734	GTTTTG	2	12	17038	17049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308304
7	NC_019734	ACTTCT	2	12	17205	17216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428308304
8	NC_019734	CAGCGA	2	12	17948	17959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308304
9	NC_019734	TTTGCA	2	12	19420	19431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428308306
10	NC_019734	AATTAC	2	12	21675	21686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428308311
11	NC_019734	ATTCTT	2	12	23417	23428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428308314
12	NC_019734	TTCTTG	2	12	24843	24854	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428308315
13	NC_019734	TAACAA	3	18	31011	31028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308321
14	NC_019734	ATAACA	2	12	31046	31057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308321
15	NC_019734	CAAGAA	2	12	39435	39446	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308328
16	NC_019734	CGAGAA	2	12	43653	43664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428308335
17	NC_019734	CTAGGG	2	12	45265	45276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428308336
18	NC_019734	GCTCTT	2	12	50770	50781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428308342
19	NC_019734	TCATCG	3	18	52014	52031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308342
20	NC_019734	CAGTTG	2	12	52045	52056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428308342
21	NC_019734	CTGCTC	2	12	52694	52705	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428308342

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.