MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	CTGGG	2	10	672	681	0 %	20 %	60 %	20 %	428308293
2	NC_019734	GTTTG	2	10	3747	3756	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019734	AGAAT	2	10	4082	4091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019734	GTTTA	2	10	4273	4282	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019734	GAAGA	2	10	4288	4297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019734	AGTTT	2	10	4640	4649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019734	AATAT	2	10	5216	5225	60 %	40 %	0 %	0 %	428308296
8	NC_019734	AAGCC	2	10	7112	7121	40 %	0 %	20 %	40 %	428308297
9	NC_019734	TCCCA	2	10	8387	8396	20 %	20 %	0 %	60 %	428308299
10	NC_019734	AGTAA	2	10	8677	8686	60 %	20 %	20 %	0 %	428308299
11	NC_019734	TCAAA	2	10	8850	8859	60 %	20 %	0 %	20 %	428308299
12	NC_019734	GTTGT	2	10	12571	12580	0 %	60 %	40 %	0 %	428308302
13	NC_019734	CCAAT	2	10	14144	14153	40 %	20 %	0 %	40 %	428308303
14	NC_019734	TGTTT	2	10	14488	14497	0 %	80 %	20 %	0 %	428308303
15	NC_019734	ACCTT	2	10	16455	16464	20 %	40 %	0 %	40 %	428308304
16	NC_019734	CAGTT	2	10	17387	17396	20 %	40 %	20 %	20 %	428308304
17	NC_019734	CTTTT	2	10	18781	18790	0 %	80 %	0 %	20 %	428308306
18	NC_019734	GTAAT	2	10	19393	19402	40 %	40 %	20 %	0 %	428308306
19	NC_019734	GAAAG	2	10	19561	19570	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019734	AATCA	2	10	23399	23408	60 %	20 %	0 %	20 %	428308314
21	NC_019734	CGTTC	2	10	24087	24096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019734	CCCCT	2	10	24291	24300	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_019734	AAGTC	2	10	26420	26429	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019734	ACAAT	2	10	28976	28985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019734	GTCTT	2	10	29641	29650	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019734	AAACA	2	10	31123	31132	80 %	0 %	0 %	20 %	428308321
27	NC_019734	GGTTG	2	10	31390	31399	0 %	40 %	60 %	0 %	428308321
28	NC_019734	CGTTC	2	10	35697	35706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019734	GATAC	2	10	35715	35724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019734	GACTT	2	10	37860	37869	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019734	AGTTT	2	10	40423	40432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019734	GCAAC	2	10	41232	41241	40 %	0 %	20 %	40 %	428308330
33	NC_019734	GCGTT	2	10	42069	42078	0 %	40 %	40 %	20 %	428308332
34	NC_019734	GTGAG	2	10	42226	42235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019734	TGCAA	2	10	44272	44281	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019734	AGTGC	2	10	44296	44305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019734	TCAAA	2	10	44611	44620	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019734	GGCGT	2	10	45485	45494	0 %	20 %	60 %	20 %	428308336
39	NC_019734	AACCC	2	10	47238	47247	40 %	0 %	0 %	60 %	428308339
40	NC_019734	GTAAA	2	10	48309	48318	60 %	20 %	20 %	0 %	428308340
41	NC_019734	TCTGG	2	10	49451	49460	0 %	40 %	40 %	20 %	428308340
42	NC_019734	ATGCA	2	10	49570	49579	40 %	20 %	20 %	20 %	428308340
43	NC_019734	AAATT	2	10	49878	49887	60 %	40 %	0 %	0 %	428308340
44	NC_019734	GATTT	2	10	50093	50102	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019734	TAATT	2	10	51849	51858	40 %	60 %	0 %	0 %	428308342
46	NC_019734	AGGCT	2	10	52293	52302	20 %	20 %	40 %	20 %	428308342
47	NC_019734	TGGTA	2	10	52915	52924	20 %	40 %	40 %	0 %	428308342
48	NC_019734	ACTGC	2	10	52998	53007	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019734	TAGTG	2	10	53199	53208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.