MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	CTGGG	2	10	672	681	0 %	20 %	60 %	20 %	428308293
2	NC_019734	AATAT	2	10	5216	5225	60 %	40 %	0 %	0 %	428308296
3	NC_019734	AAGCC	2	10	7112	7121	40 %	0 %	20 %	40 %	428308297
4	NC_019734	TCCCA	2	10	8387	8396	20 %	20 %	0 %	60 %	428308299
5	NC_019734	AGTAA	2	10	8677	8686	60 %	20 %	20 %	0 %	428308299
6	NC_019734	TCAAA	2	10	8850	8859	60 %	20 %	0 %	20 %	428308299
7	NC_019734	GTTGT	2	10	12571	12580	0 %	60 %	40 %	0 %	428308302
8	NC_019734	CCAAT	2	10	14144	14153	40 %	20 %	0 %	40 %	428308303
9	NC_019734	TGTTT	2	10	14488	14497	0 %	80 %	20 %	0 %	428308303
10	NC_019734	ACCTT	2	10	16455	16464	20 %	40 %	0 %	40 %	428308304
11	NC_019734	CAGTT	2	10	17387	17396	20 %	40 %	20 %	20 %	428308304
12	NC_019734	CTTTT	2	10	18781	18790	0 %	80 %	0 %	20 %	428308306
13	NC_019734	GTAAT	2	10	19393	19402	40 %	40 %	20 %	0 %	428308306
14	NC_019734	AATCA	2	10	23399	23408	60 %	20 %	0 %	20 %	428308314
15	NC_019734	AAACA	2	10	31123	31132	80 %	0 %	0 %	20 %	428308321
16	NC_019734	GGTTG	2	10	31390	31399	0 %	40 %	60 %	0 %	428308321
17	NC_019734	GCAAC	2	10	41232	41241	40 %	0 %	20 %	40 %	428308330
18	NC_019734	GCGTT	2	10	42069	42078	0 %	40 %	40 %	20 %	428308332
19	NC_019734	GGCGT	2	10	45485	45494	0 %	20 %	60 %	20 %	428308336
20	NC_019734	AACCC	2	10	47238	47247	40 %	0 %	0 %	60 %	428308339
21	NC_019734	GTAAA	2	10	48309	48318	60 %	20 %	20 %	0 %	428308340
22	NC_019734	TCTGG	2	10	49451	49460	0 %	40 %	40 %	20 %	428308340
23	NC_019734	ATGCA	2	10	49570	49579	40 %	20 %	20 %	20 %	428308340
24	NC_019734	AAATT	2	10	49878	49887	60 %	40 %	0 %	0 %	428308340
25	NC_019734	TAATT	2	10	51849	51858	40 %	60 %	0 %	0 %	428308342
26	NC_019734	AGGCT	2	10	52293	52302	20 %	20 %	40 %	20 %	428308342
27	NC_019734	TGGTA	2	10	52915	52924	20 %	40 %	40 %	0 %	428308342

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.