MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	TTGG	2	8	710	717	0 %	50 %	50 %	0 %	428308293
2	NC_019734	GCTG	2	8	818	825	0 %	25 %	50 %	25 %	428308293
3	NC_019734	ATTT	2	8	1125	1132	25 %	75 %	0 %	0 %	428308293
4	NC_019734	TCAA	2	8	1326	1333	50 %	25 %	0 %	25 %	428308293
5	NC_019734	CTAC	2	8	1455	1462	25 %	25 %	0 %	50 %	428308293
6	NC_019734	GTTT	2	8	2045	2052	0 %	75 %	25 %	0 %	428308294
7	NC_019734	TAAA	2	8	2597	2604	75 %	25 %	0 %	0 %	428308295
8	NC_019734	ATCC	2	8	4932	4939	25 %	25 %	0 %	50 %	428308296
9	NC_019734	TTCA	2	8	4973	4980	25 %	50 %	0 %	25 %	428308296
10	NC_019734	TTGC	2	8	4989	4996	0 %	50 %	25 %	25 %	428308296
11	NC_019734	GCTC	2	8	5446	5453	0 %	25 %	25 %	50 %	428308296
12	NC_019734	TGGC	2	8	5592	5599	0 %	25 %	50 %	25 %	428308296
13	NC_019734	GCTC	2	8	5673	5680	0 %	25 %	25 %	50 %	428308296
14	NC_019734	GTGA	2	8	5704	5711	25 %	25 %	50 %	0 %	428308296
15	NC_019734	AGAA	2	8	5904	5911	75 %	0 %	25 %	0 %	428308296
16	NC_019734	CTGC	2	8	6551	6558	0 %	25 %	25 %	50 %	428308297
17	NC_019734	ATAA	2	8	7065	7072	75 %	25 %	0 %	0 %	428308297
18	NC_019734	TCGC	2	8	7748	7755	0 %	25 %	25 %	50 %	428308298
19	NC_019734	GTAA	2	8	8054	8061	50 %	25 %	25 %	0 %	428308298
20	NC_019734	TAAT	2	8	8838	8845	50 %	50 %	0 %	0 %	428308299
21	NC_019734	TTTG	2	8	10051	10058	0 %	75 %	25 %	0 %	428308300
22	NC_019734	TACC	2	8	10378	10385	25 %	25 %	0 %	50 %	428308300
23	NC_019734	TAAA	2	8	10421	10428	75 %	25 %	0 %	0 %	428308300
24	NC_019734	TTTA	2	8	10443	10450	25 %	75 %	0 %	0 %	428308300
25	NC_019734	TAAT	2	8	10708	10715	50 %	50 %	0 %	0 %	428308300
26	NC_019734	AATT	2	8	10755	10762	50 %	50 %	0 %	0 %	428308300
27	NC_019734	CCAT	2	8	11178	11185	25 %	25 %	0 %	50 %	428308301
28	NC_019734	TAAA	2	8	11321	11328	75 %	25 %	0 %	0 %	428308301
29	NC_019734	TTTA	2	8	11389	11396	25 %	75 %	0 %	0 %	428308301
30	NC_019734	TATT	2	8	11424	11431	25 %	75 %	0 %	0 %	428308301
31	NC_019734	ATTT	2	8	11491	11498	25 %	75 %	0 %	0 %	428308301
32	NC_019734	TTGT	2	8	11643	11650	0 %	75 %	25 %	0 %	428308301
33	NC_019734	AATT	2	8	11989	11996	50 %	50 %	0 %	0 %	428308301
34	NC_019734	AAGC	2	8	13594	13601	50 %	0 %	25 %	25 %	428308303
35	NC_019734	GGTA	2	8	14820	14827	25 %	25 %	50 %	0 %	428308304
36	NC_019734	GCTT	2	8	15912	15919	0 %	50 %	25 %	25 %	428308304
37	NC_019734	TCTT	2	8	16251	16258	0 %	75 %	0 %	25 %	428308304
38	NC_019734	CTGC	2	8	17433	17440	0 %	25 %	25 %	50 %	428308304
39	NC_019734	TTGC	2	8	17993	18000	0 %	50 %	25 %	25 %	428308304
40	NC_019734	CCAT	2	8	18227	18234	25 %	25 %	0 %	50 %	428308304
41	NC_019734	TTTC	2	8	18703	18710	0 %	75 %	0 %	25 %	428308306
42	NC_019734	TTTA	2	8	18935	18942	25 %	75 %	0 %	0 %	428308306
43	NC_019734	GGAT	2	8	19072	19079	25 %	25 %	50 %	0 %	428308306
44	NC_019734	CTGA	2	8	20794	20801	25 %	25 %	25 %	25 %	428308309
45	NC_019734	CAAA	2	8	20848	20855	75 %	0 %	0 %	25 %	428308309
46	NC_019734	AAAG	2	8	21129	21136	75 %	0 %	25 %	0 %	428308310
47	NC_019734	TCAG	2	8	22506	22513	25 %	25 %	25 %	25 %	428308313
48	NC_019734	ATCA	2	8	22548	22555	50 %	25 %	0 %	25 %	428308313
49	NC_019734	GCAC	2	8	24811	24818	25 %	0 %	25 %	50 %	428308315
50	NC_019734	TGGT	2	8	25462	25469	0 %	50 %	50 %	0 %	428308316
51	NC_019734	AATT	2	8	25645	25652	50 %	50 %	0 %	0 %	428308316
52	NC_019734	AGCT	2	8	25666	25673	25 %	25 %	25 %	25 %	428308316
53	NC_019734	ACAT	2	8	25697	25704	50 %	25 %	0 %	25 %	428308316
54	NC_019734	ATGG	2	8	29094	29101	25 %	25 %	50 %	0 %	428308319
55	NC_019734	TCGC	2	8	30074	30081	0 %	25 %	25 %	50 %	428308321
56	NC_019734	GATT	2	8	30369	30376	25 %	50 %	25 %	0 %	428308321
57	NC_019734	CAAA	2	8	30428	30435	75 %	0 %	0 %	25 %	428308321
58	NC_019734	CCAC	2	8	32206	32213	25 %	0 %	0 %	75 %	428308321
59	NC_019734	AAAC	2	8	32899	32906	75 %	0 %	0 %	25 %	428308321
60	NC_019734	TCAA	2	8	32991	32998	50 %	25 %	0 %	25 %	428308321
61	NC_019734	ATAA	2	8	34025	34032	75 %	25 %	0 %	0 %	428308322
62	NC_019734	CTAA	2	8	34170	34177	50 %	25 %	0 %	25 %	428308323
63	NC_019734	AATT	2	8	34501	34508	50 %	50 %	0 %	0 %	428308324
64	NC_019734	AATA	2	8	34657	34664	75 %	25 %	0 %	0 %	428308325
65	NC_019734	CTTT	2	8	35133	35140	0 %	75 %	0 %	25 %	428308326
66	NC_019734	ATGT	2	8	38585	38592	25 %	50 %	25 %	0 %	428308327
67	NC_019734	AGCT	2	8	38616	38623	25 %	25 %	25 %	25 %	428308327
68	NC_019734	TAAT	2	8	38636	38643	50 %	50 %	0 %	0 %	428308327
69	NC_019734	ACCA	2	8	38820	38827	50 %	0 %	0 %	50 %	428308327
70	NC_019734	GTGC	2	8	39471	39478	0 %	25 %	50 %	25 %	428308328
71	NC_019734	CAAA	2	8	40944	40951	75 %	0 %	0 %	25 %	428308330
72	NC_019734	ACAT	2	8	41019	41026	50 %	25 %	0 %	25 %	428308330
73	NC_019734	TTAG	2	8	41181	41188	25 %	50 %	25 %	0 %	428308330
74	NC_019734	GAAT	2	8	41932	41939	50 %	25 %	25 %	0 %	428308332
75	NC_019734	TGCT	2	8	41940	41947	0 %	50 %	25 %	25 %	428308332
76	NC_019734	CCTT	2	8	43027	43034	0 %	50 %	0 %	50 %	428308334
77	NC_019734	ACGA	2	8	45213	45220	50 %	0 %	25 %	25 %	428308336
78	NC_019734	TTTG	2	8	45344	45351	0 %	75 %	25 %	0 %	428308336
79	NC_019734	AATG	2	8	45578	45585	50 %	25 %	25 %	0 %	428308336
80	NC_019734	ATTT	2	8	46090	46097	25 %	75 %	0 %	0 %	428308337
81	NC_019734	AAAC	2	8	46148	46155	75 %	0 %	0 %	25 %	428308337
82	NC_019734	TGGC	2	8	47219	47226	0 %	25 %	50 %	25 %	428308339
83	NC_019734	TAAT	2	8	47315	47322	50 %	50 %	0 %	0 %	428308339
84	NC_019734	AAAT	2	8	47578	47585	75 %	25 %	0 %	0 %	428308339
85	NC_019734	GCAA	2	8	47878	47885	50 %	0 %	25 %	25 %	428308339
86	NC_019734	ATGG	2	8	48192	48199	25 %	25 %	50 %	0 %	428308340
87	NC_019734	ATAA	2	8	48470	48477	75 %	25 %	0 %	0 %	428308340
88	NC_019734	TAAA	2	8	49044	49051	75 %	25 %	0 %	0 %	428308340
89	NC_019734	TAAA	2	8	49375	49382	75 %	25 %	0 %	0 %	428308340
90	NC_019734	TACA	2	8	49434	49441	50 %	25 %	0 %	25 %	428308340
91	NC_019734	AGTT	2	8	51508	51515	25 %	50 %	25 %	0 %	428308342
92	NC_019734	ACTA	2	8	52628	52635	50 %	25 %	0 %	25 %	428308342

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.