MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	TTC	2	6	2	7	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019734	CTC	2	6	67	72	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019734	CTG	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019734	TAA	2	6	153	158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019734	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019734	TGT	2	6	256	261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019734	GTA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019734	TAA	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019734	ATT	2	6	500	505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019734	GGC	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308293
11	NC_019734	AAC	2	6	595	600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308293
12	NC_019734	TTG	2	6	609	614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308293
13	NC_019734	CCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308293
14	NC_019734	AAC	2	6	700	705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308293
15	NC_019734	AGT	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308293
16	NC_019734	AAC	2	6	937	942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308293
17	NC_019734	GGA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308293
18	NC_019734	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308293
19	NC_019734	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308293
20	NC_019734	AAT	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308293
21	NC_019734	GAC	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308293
22	NC_019734	ATT	2	6	1417	1422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308293
23	NC_019734	TGA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308293
24	NC_019734	ATT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308293
25	NC_019734	TTC	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308293
26	NC_019734	AAG	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308293
27	NC_019734	TGT	2	6	1839	1844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308294
28	NC_019734	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308294
29	NC_019734	CTG	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308294
30	NC_019734	TGA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308294
31	NC_019734	AGA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308294
32	NC_019734	CAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308294
33	NC_019734	TAG	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308294
34	NC_019734	ACT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019734	ATT	2	6	2304	2309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019734	TAG	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019734	TAA	2	6	2515	2520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019734	GGT	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308295
39	NC_019734	ATG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308295
40	NC_019734	TCA	2	6	2853	2858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308295
41	NC_019734	CAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308295
42	NC_019734	CAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308295
43	NC_019734	AGA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308295
44	NC_019734	TAT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308295
45	NC_019734	ACG	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308295
46	NC_019734	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308295
47	NC_019734	TTG	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308295
48	NC_019734	GCA	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308295
49	NC_019734	TGG	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019734	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019734	CTG	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019734	TGA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019734	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019734	CAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019734	TAT	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019734	CTA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019734	GTA	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019734	AGA	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019734	TGG	2	6	4464	4469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019734	AGA	3	9	4581	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019734	TTC	2	6	4619	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019734	TAA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019734	CTG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019734	AGC	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019734	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019734	AGG	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019734	ATT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
68	NC_019734	CAA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308296
69	NC_019734	TTA	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
70	NC_019734	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
71	NC_019734	TTA	2	6	5188	5193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
72	NC_019734	TCT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308296
73	NC_019734	TAA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308296
74	NC_019734	TCA	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308296
75	NC_019734	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308296
76	NC_019734	CTG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308296
77	NC_019734	GTT	2	6	5665	5670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308296
78	NC_019734	CGT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308296
79	NC_019734	CAG	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308296
80	NC_019734	CAA	2	6	5786	5791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308296
81	NC_019734	TCA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308296
82	NC_019734	TGG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308296
83	NC_019734	GTA	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308296
84	NC_019734	GTA	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308297
85	NC_019734	TGG	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308297
86	NC_019734	TAT	2	6	6177	6182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308297
87	NC_019734	TTC	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308297
88	NC_019734	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308297
89	NC_019734	TCC	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308297
90	NC_019734	GAG	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308297
91	NC_019734	TGT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308297
92	NC_019734	CAG	2	6	6507	6512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
93	NC_019734	AGC	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
94	NC_019734	ACG	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
95	NC_019734	CTC	3	9	6907	6915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308297
96	NC_019734	ATC	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308297
97	NC_019734	CTT	2	6	7092	7097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308297
98	NC_019734	GAC	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
99	NC_019734	ACG	3	9	7171	7179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
100	NC_019734	TTG	2	6	7306	7311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
101	NC_019734	CAG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308298
102	NC_019734	TAA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308298
103	NC_019734	TTG	2	6	7429	7434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
104	NC_019734	TGT	2	6	7474	7479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
105	NC_019734	TTC	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308298
106	NC_019734	TAC	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308298
107	NC_019734	TGT	2	6	7805	7810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
108	NC_019734	CAT	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308298
109	NC_019734	CAT	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308298
110	NC_019734	TGG	2	6	7898	7903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308298
111	NC_019734	TCT	2	6	7918	7923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308298
112	NC_019734	TTC	2	6	8139	8144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308298
113	NC_019734	AGA	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308298
114	NC_019734	GTT	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308299
115	NC_019734	CTG	2	6	8244	8249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308299
116	NC_019734	AGA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308299
117	NC_019734	CAA	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308299
118	NC_019734	TTG	2	6	8534	8539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308299
119	NC_019734	TAA	2	6	8649	8654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308299
120	NC_019734	TAA	2	6	8872	8877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308299
121	NC_019734	AGA	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308299
122	NC_019734	TTA	2	6	9093	9098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308299
123	NC_019734	CAT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308299
124	NC_019734	GAG	2	6	9328	9333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019734	ATG	2	6	9385	9390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019734	TTA	2	6	9776	9781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019734	TTC	2	6	9868	9873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019734	ATA	2	6	9884	9889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019734	CAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019734	ATT	2	6	9968	9973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308300
131	NC_019734	TCA	2	6	10138	10143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308300
132	NC_019734	TTC	2	6	10167	10172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308300
133	NC_019734	CTG	2	6	10186	10191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308300
134	NC_019734	GGA	2	6	10234	10239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308300
135	NC_019734	CCT	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308300
136	NC_019734	CTT	2	6	10280	10285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308300
137	NC_019734	ATC	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308300
138	NC_019734	TAA	2	6	10634	10639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308300
139	NC_019734	CTC	2	6	10673	10678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308300
140	NC_019734	TCC	2	6	10770	10775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308300
141	NC_019734	TAA	2	6	10892	10897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019734	TAA	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019734	CTT	2	6	11204	11209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308301
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259	NC_019734	TCA	2	6	21449	21454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308311
260	NC_019734	GGT	2	6	21475	21480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308311
261	NC_019734	GTT	2	6	21574	21579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308311
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263	NC_019734	AAG	2	6	21751	21756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308312
264	NC_019734	ATG	2	6	21880	21885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308312
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279	NC_019734	TTA	2	6	23221	23226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019734	TAT	2	6	23907	23912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_019734	ACC	2	6	24136	24141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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387	NC_019734	TGG	2	6	32733	32738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308321
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