MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	TTC	2	6	2	7	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019734	CTC	2	6	67	72	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019734	CTG	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019734	TAA	2	6	153	158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019734	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019734	TGT	2	6	256	261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019734	GTA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019734	TAA	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019734	ATT	2	6	500	505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019734	ACT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019734	ATT	2	6	2304	2309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019734	TAG	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019734	TAA	2	6	2515	2520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019734	TGG	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019734	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019734	CTG	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019734	TGA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019734	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019734	CAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019734	TAT	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019734	CTA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019734	GTA	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019734	AGA	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019734	TGG	2	6	4464	4469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019734	AGA	3	9	4581	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019734	TTC	2	6	4619	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019734	TAA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019734	CTG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019734	AGC	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019734	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019734	AGG	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019734	GAG	2	6	9328	9333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019734	ATG	2	6	9385	9390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019734	TTA	2	6	9776	9781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019734	TTC	2	6	9868	9873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019734	ATA	2	6	9884	9889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019734	CAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019734	TAA	2	6	10892	10897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019734	TAA	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019734	GTG	2	6	12073	12078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019734	CAA	2	6	12132	12137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019734	TGA	2	6	12152	12157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019734	TGC	2	6	18546	18551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019734	GTC	2	6	18660	18665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019734	ATT	2	6	18683	18688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019734	ACT	2	6	19494	19499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019734	TAT	2	6	19504	19509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019734	GGT	2	6	19596	19601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019734	ATG	2	6	20092	20097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019734	CAA	2	6	22904	22909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019734	TTA	2	6	23127	23132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019734	ATT	2	6	23133	23138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019734	GTA	2	6	23188	23193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019734	GTA	2	6	23207	23212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019734	TTA	2	6	23221	23226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019734	TAT	2	6	23907	23912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019734	ACC	2	6	24136	24141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019734	TGC	2	6	24175	24180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019734	GGT	2	6	24190	24195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019734	TAA	2	6	24933	24938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019734	TTA	2	6	24944	24949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019734	CCA	2	6	24959	24964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_019734	CAA	2	6	26064	26069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019734	AGA	2	6	26071	26076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019734	TTA	2	6	26269	26274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019734	CAA	2	6	26276	26281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019734	TGG	2	6	26450	26455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019734	GCA	2	6	26471	26476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019734	ACA	2	6	26497	26502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019734	CGT	2	6	26649	26654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019734	CGA	2	6	26706	26711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019734	TGG	2	6	26713	26718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019734	AAC	2	6	26851	26856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019734	TTC	2	6	26876	26881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019734	TGG	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019734	CCG	2	6	26917	26922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019734	CAA	2	6	26949	26954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019734	GAC	2	6	27233	27238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019734	CGT	2	6	27327	27332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019734	CTG	2	6	27340	27345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019734	AGC	2	6	27356	27361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019734	CTT	2	6	27403	27408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019734	GCG	3	9	27429	27437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019734	GTA	2	6	27442	27447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019734	TGG	2	6	27506	27511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019734	ATC	2	6	27520	27525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019734	TTA	2	6	27562	27567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019734	GTG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019734	TAG	2	6	28144	28149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019734	GCA	2	6	28196	28201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019734	TGG	2	6	28294	28299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019734	CCG	2	6	28314	28319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019734	TAA	2	6	29010	29015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019734	AGG	2	6	29296	29301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019734	AGG	2	6	29469	29474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019734	AAC	2	6	29483	29488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019734	ACC	2	6	29607	29612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019734	TAT	2	6	29652	29657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019734	GGT	2	6	29838	29843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019734	CTG	2	6	33656	33661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019734	AAT	2	6	33686	33691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019734	ACA	2	6	33702	33707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019734	AAT	2	6	34469	34474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019734	TAT	2	6	35517	35522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019734	TGA	2	6	35681	35686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019734	TGC	2	6	35785	35790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019734	CGG	2	6	35971	35976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019734	CCA	2	6	35991	35996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019734	CTG	2	6	36088	36093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019734	CTA	2	6	36141	36146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019734	CAA	2	6	36307	36312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019734	ACA	2	6	36431	36436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019734	TAA	2	6	36722	36727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019734	ATG	2	6	36762	36767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019734	CCA	2	6	36778	36783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019734	TAC	2	6	36842	36847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019734	CCG	3	9	36851	36859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019734	CAA	2	6	36877	36882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019734	TGC	2	6	36927	36932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019734	CAG	2	6	36944	36949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019734	GAC	2	6	36956	36961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019734	GTC	2	6	37051	37056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019734	TTG	2	6	37335	37340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019734	CGG	2	6	37367	37372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019734	TTC	2	6	37395	37400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019734	AGA	2	6	37407	37412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019734	GTT	2	6	37433	37438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019734	ACC	2	6	37570	37575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019734	TCG	2	6	37578	37583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019734	ACG	2	6	37635	37640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019734	TGT	2	6	37787	37792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019734	CTG	2	6	37812	37817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019734	ACC	2	6	37833	37838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019734	TTG	2	6	38008	38013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019734	ATA	2	6	38014	38019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019734	TCT	2	6	38213	38218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019734	GTT	2	6	38219	38224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019734	TGG	2	6	39325	39330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019734	ATT	2	6	39333	39338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019734	TAA	2	6	39340	39345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019734	TTA	2	6	39351	39356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.