MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	TA	3	6	808	813	50 %	50 %	0 %	0 %	428308293
2	NC_019734	TA	3	6	1256	1261	50 %	50 %	0 %	0 %	428308293
3	NC_019734	AG	4	8	1365	1372	50 %	0 %	50 %	0 %	428308293
4	NC_019734	AG	3	6	2350	2355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019734	GA	3	6	2437	2442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019734	TC	3	6	3740	3745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019734	AT	4	8	4367	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019734	TG	3	6	4455	4460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019734	CA	3	6	4853	4858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019734	AT	3	6	7873	7878	50 %	50 %	0 %	0 %	428308298
11	NC_019734	TA	3	6	8069	8074	50 %	50 %	0 %	0 %	428308298
12	NC_019734	AT	3	6	8119	8124	50 %	50 %	0 %	0 %	428308298
13	NC_019734	AT	3	6	10855	10860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019734	TA	3	6	10903	10908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019734	AT	3	6	11081	11086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019734	TC	3	6	11758	11763	0 %	50 %	0 %	50 %	428308301
17	NC_019734	TA	3	6	12536	12541	50 %	50 %	0 %	0 %	428308302
18	NC_019734	CA	3	6	13508	13513	50 %	0 %	0 %	50 %	428308303
19	NC_019734	GT	3	6	14082	14087	0 %	50 %	50 %	0 %	428308303
20	NC_019734	GT	3	6	14585	14590	0 %	50 %	50 %	0 %	428308303
21	NC_019734	CA	3	6	18187	18192	50 %	0 %	0 %	50 %	428308304
22	NC_019734	TG	3	6	18459	18464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019734	CT	3	6	18902	18907	0 %	50 %	0 %	50 %	428308306
24	NC_019734	AG	3	6	19337	19342	50 %	0 %	50 %	0 %	428308306
25	NC_019734	AC	3	6	21204	21209	50 %	0 %	0 %	50 %	428308310
26	NC_019734	CA	3	6	21210	21215	50 %	0 %	0 %	50 %	428308310
27	NC_019734	CT	3	6	24285	24290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019734	CT	3	6	27682	27687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019734	AT	3	6	27986	27991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019734	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	428308317
31	NC_019734	CT	3	6	29765	29770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019734	TA	5	10	29828	29837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019734	AC	4	8	29926	29933	50 %	0 %	0 %	50 %	428308321
34	NC_019734	AC	3	6	30228	30233	50 %	0 %	0 %	50 %	428308321
35	NC_019734	GA	4	8	33566	33573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019734	TC	3	6	33970	33975	0 %	50 %	0 %	50 %	428308322
37	NC_019734	GA	3	6	35812	35817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019734	AT	3	6	36299	36304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019734	GA	3	6	36601	36606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019734	TA	3	6	40008	40013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019734	GA	3	6	40470	40475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019734	AT	3	6	40517	40522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019734	TA	3	6	41198	41203	50 %	50 %	0 %	0 %	428308330
44	NC_019734	AT	3	6	41442	41447	50 %	50 %	0 %	0 %	428308330
45	NC_019734	TA	3	6	41462	41467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019734	TA	3	6	41491	41496	50 %	50 %	0 %	0 %	428308331
47	NC_019734	TA	4	8	41500	41507	50 %	50 %	0 %	0 %	428308331
48	NC_019734	GA	3	6	43508	43513	50 %	0 %	50 %	0 %	428308335
49	NC_019734	GT	3	6	43892	43897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019734	GT	4	8	44191	44198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019734	CG	3	6	44384	44389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019734	CG	3	6	44409	44414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019734	TC	3	6	44971	44976	0 %	50 %	0 %	50 %	428308336
54	NC_019734	AG	3	6	45948	45953	50 %	0 %	50 %	0 %	428308337
55	NC_019734	AC	3	6	46526	46531	50 %	0 %	0 %	50 %	428308338
56	NC_019734	CT	3	6	47202	47207	0 %	50 %	0 %	50 %	428308339
57	NC_019734	TA	3	6	48122	48127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019734	AT	3	6	48487	48492	50 %	50 %	0 %	0 %	428308340
59	NC_019734	TA	4	8	48925	48932	50 %	50 %	0 %	0 %	428308340
60	NC_019734	AT	3	6	48988	48993	50 %	50 %	0 %	0 %	428308340
61	NC_019734	AT	3	6	49151	49156	50 %	50 %	0 %	0 %	428308340
62	NC_019734	TA	3	6	49414	49419	50 %	50 %	0 %	0 %	428308340
63	NC_019734	AT	3	6	49512	49517	50 %	50 %	0 %	0 %	428308340
64	NC_019734	TA	3	6	50610	50615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019734	AT	3	6	51139	51144	50 %	50 %	0 %	0 %	428308342
66	NC_019734	AG	3	6	51774	51779	50 %	0 %	50 %	0 %	428308342
67	NC_019734	CT	3	6	52200	52205	0 %	50 %	0 %	50 %	428308342

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.