MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019734	A	6	6	235	240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019734	G	6	6	973	978	0 %	0 %	100 %	0 %	428308293
4	NC_019734	T	6	6	1004	1009	0 %	100 %	0 %	0 %	428308293
5	NC_019734	T	7	7	2250	2256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019734	T	6	6	2356	2361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019734	A	6	6	2548	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019734	T	6	6	3860	3865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019734	T	6	6	3882	3887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019734	T	6	6	4749	4754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019734	T	9	9	5032	5040	0 %	100 %	0 %	0 %	428308296
12	NC_019734	A	7	7	5414	5420	100 %	0 %	0 %	0 %	428308296
13	NC_019734	T	6	6	7787	7792	0 %	100 %	0 %	0 %	428308298
14	NC_019734	T	9	9	8080	8088	0 %	100 %	0 %	0 %	428308298
15	NC_019734	T	6	6	8256	8261	0 %	100 %	0 %	0 %	428308299
16	NC_019734	T	7	7	8887	8893	0 %	100 %	0 %	0 %	428308299
17	NC_019734	T	6	6	9011	9016	0 %	100 %	0 %	0 %	428308299
18	NC_019734	T	6	6	9303	9308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019734	T	6	6	9713	9718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019734	A	6	6	9938	9943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019734	T	6	6	9979	9984	0 %	100 %	0 %	0 %	428308300
22	NC_019734	T	7	7	10148	10154	0 %	100 %	0 %	0 %	428308300
23	NC_019734	T	7	7	10537	10543	0 %	100 %	0 %	0 %	428308300
24	NC_019734	T	6	6	10644	10649	0 %	100 %	0 %	0 %	428308300
25	NC_019734	A	6	6	10661	10666	100 %	0 %	0 %	0 %	428308300
26	NC_019734	T	6	6	10722	10727	0 %	100 %	0 %	0 %	428308300
27	NC_019734	T	6	6	10872	10877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019734	T	7	7	11048	11054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019734	T	6	6	11694	11699	0 %	100 %	0 %	0 %	428308301
30	NC_019734	T	7	7	11786	11792	0 %	100 %	0 %	0 %	428308301
31	NC_019734	T	6	6	11962	11967	0 %	100 %	0 %	0 %	428308301
32	NC_019734	A	7	7	12083	12089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019734	T	6	6	14296	14301	0 %	100 %	0 %	0 %	428308303
34	NC_019734	T	6	6	15608	15613	0 %	100 %	0 %	0 %	428308304
35	NC_019734	T	6	6	16328	16333	0 %	100 %	0 %	0 %	428308304
36	NC_019734	A	6	6	18768	18773	100 %	0 %	0 %	0 %	428308306
37	NC_019734	T	7	7	19128	19134	0 %	100 %	0 %	0 %	428308306
38	NC_019734	T	7	7	19407	19413	0 %	100 %	0 %	0 %	428308306
39	NC_019734	A	6	6	19656	19661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019734	C	6	6	21074	21079	0 %	0 %	0 %	100 %	428308310
41	NC_019734	A	8	8	21254	21261	100 %	0 %	0 %	0 %	428308310
42	NC_019734	T	6	6	21434	21439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019734	T	6	6	21779	21784	0 %	100 %	0 %	0 %	428308312
44	NC_019734	A	7	7	21891	21897	100 %	0 %	0 %	0 %	428308312
45	NC_019734	A	6	6	24388	24393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019734	A	6	6	25266	25271	100 %	0 %	0 %	0 %	428308316
47	NC_019734	T	6	6	28055	28060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019734	T	6	6	28071	28076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019734	T	6	6	28404	28409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019734	T	6	6	28686	28691	0 %	100 %	0 %	0 %	428308317
51	NC_019734	A	7	7	29246	29252	100 %	0 %	0 %	0 %	428308319
52	NC_019734	T	9	9	29544	29552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019734	T	8	8	29695	29702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019734	T	7	7	29706	29712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019734	A	6	6	29974	29979	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
56	NC_019734	A	6	6	30415	30420	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
57	NC_019734	T	6	6	31622	31627	0 %	100 %	0 %	0 %	428308321
58	NC_019734	A	6	6	31985	31990	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
59	NC_019734	A	6	6	32876	32881	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
60	NC_019734	A	7	7	33124	33130	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
61	NC_019734	T	6	6	33719	33724	0 %	100 %	0 %	0 %	428308322
62	NC_019734	T	6	6	33865	33870	0 %	100 %	0 %	0 %	428308322
63	NC_019734	T	6	6	34568	34573	0 %	100 %	0 %	0 %	428308324
64	NC_019734	A	6	6	35881	35886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019734	A	6	6	36214	36219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019734	A	6	6	36230	36235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019734	T	6	6	39018	39023	0 %	100 %	0 %	0 %	428308327
68	NC_019734	T	6	6	39896	39901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019734	A	6	6	40111	40116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019734	A	6	6	40572	40577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019734	A	6	6	40818	40823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019734	A	6	6	41564	41569	100 %	0 %	0 %	0 %	428308331
73	NC_019734	A	6	6	42167	42172	100 %	0 %	0 %	0 %	428308332
74	NC_019734	G	6	6	42482	42487	0 %	0 %	100 %	0 %	428308333
75	NC_019734	T	8	8	42672	42679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019734	T	8	8	43897	43904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019734	A	6	6	44161	44166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019734	T	6	6	44174	44179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019734	A	6	6	45462	45467	100 %	0 %	0 %	0 %	428308336
80	NC_019734	A	7	7	46456	46462	100 %	0 %	0 %	0 %	428308338
81	NC_019734	A	6	6	46466	46471	100 %	0 %	0 %	0 %	428308338
82	NC_019734	T	6	6	46614	46619	0 %	100 %	0 %	0 %	428308338
83	NC_019734	A	7	7	47114	47120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019734	T	6	6	47131	47136	0 %	100 %	0 %	0 %	428308339
85	NC_019734	C	6	6	47446	47451	0 %	0 %	0 %	100 %	428308339
86	NC_019734	T	6	6	47676	47681	0 %	100 %	0 %	0 %	428308339
87	NC_019734	T	6	6	47896	47901	0 %	100 %	0 %	0 %	428308339
88	NC_019734	T	6	6	47974	47979	0 %	100 %	0 %	0 %	428308339
89	NC_019734	A	7	7	48454	48460	100 %	0 %	0 %	0 %	428308340
90	NC_019734	A	6	6	48503	48508	100 %	0 %	0 %	0 %	428308340
91	NC_019734	T	6	6	48523	48528	0 %	100 %	0 %	0 %	428308340
92	NC_019734	T	7	7	49004	49010	0 %	100 %	0 %	0 %	428308340
93	NC_019734	T	8	8	49086	49093	0 %	100 %	0 %	0 %	428308340
94	NC_019734	T	6	6	49268	49273	0 %	100 %	0 %	0 %	428308340
95	NC_019734	A	6	6	49472	49477	100 %	0 %	0 %	0 %	428308340
96	NC_019734	A	8	8	49792	49799	100 %	0 %	0 %	0 %	428308340
97	NC_019734	T	10	10	50038	50047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019734	T	6	6	50416	50421	0 %	100 %	0 %	0 %	428308341
99	NC_019734	T	6	6	50545	50550	0 %	100 %	0 %	0 %	428308341
100	NC_019734	T	7	7	53036	53042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.