MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	TGCAAA	2	12	558	569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308250
2	NC_019733	CCAAAA	3	18	3286	3303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
3	NC_019733	CAAAAA	2	12	5983	5994	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428308253
4	NC_019733	AGAACC	2	12	8203	8214	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428308255
5	NC_019733	CAGGTT	2	12	11354	11365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428308259
6	NC_019733	TTGTGC	2	12	11382	11393	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428308259
7	NC_019733	AACGCT	2	12	11781	11792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019733	AAGGTA	2	12	12627	12638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019733	CACATT	2	12	13957	13968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308261
10	NC_019733	GCAGAA	2	12	15682	15693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428308261
11	NC_019733	ACTTCA	2	12	18407	18418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019733	GGGAAA	2	12	18448	18459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019733	TAGAAG	2	12	23691	23702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428308267
14	NC_019733	ACTGAA	2	12	23789	23800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308267
15	NC_019733	GTAAAA	2	12	25140	25151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428308269
16	NC_019733	CCAAAT	2	12	27462	27473	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428308270
17	NC_019733	AAACCA	2	12	28269	28280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308270
18	NC_019733	AAAGGA	2	12	30121	30132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308272
19	NC_019733	ATGGGT	2	12	30374	30385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428308272
20	NC_019733	AAAACT	2	12	33698	33709	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019733	CCATCC	2	12	35436	35447	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428308277
22	NC_019733	CTGGCG	2	12	39333	39344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428308281
23	NC_019733	TTTAAA	2	12	41410	41421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019733	TAATGC	2	12	42304	42315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428308284
25	NC_019733	AAATCA	2	12	42639	42650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308284
26	NC_019733	GTTTCT	2	12	42651	42662	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428308284
27	NC_019733	CTCTTC	2	12	46597	46608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.