MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	AAACT	2	10	154	163	60 %	20 %	0 %	20 %	428308249
2	NC_019733	CTTTC	2	10	419	428	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019733	ATTAC	2	10	587	596	40 %	40 %	0 %	20 %	428308250
4	NC_019733	TCCCA	2	10	7275	7284	20 %	20 %	0 %	60 %	428308254
5	NC_019733	CACAA	2	10	8158	8167	60 %	0 %	0 %	40 %	428308255
6	NC_019733	TGACT	2	10	9267	9276	20 %	40 %	20 %	20 %	428308256
7	NC_019733	TGACT	2	10	9372	9381	20 %	40 %	20 %	20 %	428308256
8	NC_019733	CAAAC	2	10	9681	9690	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019733	GAGAG	2	10	9838	9847	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019733	CGCCA	2	10	10012	10021	20 %	0 %	20 %	60 %	428308257
11	NC_019733	GTAAA	2	10	11739	11748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019733	TACAC	2	10	13122	13131	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019733	AAATT	2	10	14674	14683	60 %	40 %	0 %	0 %	428308261
14	NC_019733	CTTTC	2	10	16369	16378	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019733	ACTGC	2	10	16514	16523	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019733	TCAAC	2	10	17265	17274	40 %	20 %	0 %	40 %	428308262
17	NC_019733	AATCA	2	10	17928	17937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019733	ATTTG	2	10	18040	18049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019733	CGCGG	2	10	21663	21672	0 %	0 %	60 %	40 %	428308266
20	NC_019733	CGATG	2	10	22029	22038	20 %	20 %	40 %	20 %	428308266
21	NC_019733	TAAAA	2	10	23833	23842	80 %	20 %	0 %	0 %	428308267
22	NC_019733	AAAAT	2	10	26271	26280	80 %	20 %	0 %	0 %	428308269
23	NC_019733	GCTTG	2	10	26766	26775	0 %	40 %	40 %	20 %	428308270
24	NC_019733	CAATC	2	10	26969	26978	40 %	20 %	0 %	40 %	428308270
25	NC_019733	CTCCA	2	10	27214	27223	20 %	20 %	0 %	60 %	428308270
26	NC_019733	GGCAT	2	10	30586	30595	20 %	20 %	40 %	20 %	428308272
27	NC_019733	AGAAT	2	10	31063	31072	60 %	20 %	20 %	0 %	428308273
28	NC_019733	ATTTT	2	10	32882	32891	20 %	80 %	0 %	0 %	428308275
29	NC_019733	CTGAC	2	10	36308	36317	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019733	ACTAG	2	10	37140	37149	40 %	20 %	20 %	20 %	428308279
31	NC_019733	GCATC	2	10	38279	38288	20 %	20 %	20 %	40 %	428308280
32	NC_019733	CCAAT	2	10	41226	41235	40 %	20 %	0 %	40 %	428308282
33	NC_019733	TCCCA	2	10	43815	43824	20 %	20 %	0 %	60 %	428308284
34	NC_019733	ATATT	2	10	45778	45787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019733	CATTT	2	10	46528	46537	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019733	ACTTA	2	10	46865	46874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019733	AGAGA	2	10	48707	48716	60 %	0 %	40 %	0 %	428308285
38	NC_019733	GACCC	2	10	51018	51027	20 %	0 %	20 %	60 %	428308285
39	NC_019733	GACCC	2	10	51231	51240	20 %	0 %	20 %	60 %	428308285
40	NC_019733	TTGAT	2	10	53089	53098	20 %	60 %	20 %	0 %	428308287
41	NC_019733	TTGAT	2	10	54154	54163	20 %	60 %	20 %	0 %	428308290

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.