MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	TGCT	2	8	3	10	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019733	GTGG	2	8	99	106	0 %	25 %	75 %	0 %	428308249
3	NC_019733	ATTA	2	8	318	325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019733	AGAA	2	8	447	454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019733	GTTT	2	8	697	704	0 %	75 %	25 %	0 %	428308250
6	NC_019733	TTAA	2	8	1226	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	428308250
7	NC_019733	TAAA	2	8	1486	1493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019733	TCTG	2	8	2368	2375	0 %	50 %	25 %	25 %	428308252
9	NC_019733	AAGC	2	8	2437	2444	50 %	0 %	25 %	25 %	428308252
10	NC_019733	TCAA	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	428308252
11	NC_019733	ATTT	2	8	3218	3225	25 %	75 %	0 %	0 %	428308252
12	NC_019733	ATGG	2	8	3915	3922	25 %	25 %	50 %	0 %	428308252
13	NC_019733	TTAA	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
14	NC_019733	AGGG	2	8	4741	4748	25 %	0 %	75 %	0 %	428308252
15	NC_019733	ATCA	2	8	4768	4775	50 %	25 %	0 %	25 %	428308252
16	NC_019733	CCAA	2	8	5075	5082	50 %	0 %	0 %	50 %	428308252
17	NC_019733	TAAG	2	8	5249	5256	50 %	25 %	25 %	0 %	428308252
18	NC_019733	TTGG	2	8	5390	5397	0 %	50 %	50 %	0 %	428308252
19	NC_019733	TGAT	2	8	6162	6169	25 %	50 %	25 %	0 %	428308253
20	NC_019733	ATTA	2	8	6199	6206	50 %	50 %	0 %	0 %	428308253
21	NC_019733	CAAT	2	8	6341	6348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019733	GAGC	2	8	6581	6588	25 %	0 %	50 %	25 %	428308254
23	NC_019733	ACTT	2	8	6657	6664	25 %	50 %	0 %	25 %	428308254
24	NC_019733	AACT	2	8	6692	6699	50 %	25 %	0 %	25 %	428308254
25	NC_019733	AATG	2	8	8555	8562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019733	ATTA	2	8	8660	8667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019733	TTTC	2	8	8738	8745	0 %	75 %	0 %	25 %	428308256
28	NC_019733	GCTT	2	8	8860	8867	0 %	50 %	25 %	25 %	428308256
29	NC_019733	AATT	2	8	9086	9093	50 %	50 %	0 %	0 %	428308256
30	NC_019733	TTGA	2	8	9222	9229	25 %	50 %	25 %	0 %	428308256
31	NC_019733	TTGA	2	8	9327	9334	25 %	50 %	25 %	0 %	428308256
32	NC_019733	TAGG	2	8	9741	9748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019733	AAAG	2	8	9971	9978	75 %	0 %	25 %	0 %	428308257
34	NC_019733	AATT	2	8	10029	10036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019733	CCAA	2	8	10082	10089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019733	ACTC	2	8	10211	10218	25 %	25 %	0 %	50 %	428308258
37	NC_019733	CTTT	2	8	10397	10404	0 %	75 %	0 %	25 %	428308258
38	NC_019733	TACC	2	8	11312	11319	25 %	25 %	0 %	50 %	428308259
39	NC_019733	CTTT	2	8	11504	11511	0 %	75 %	0 %	25 %	428308259
40	NC_019733	AAAC	2	8	11750	11757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019733	TCTA	2	8	12611	12618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019733	ATTA	3	12	12882	12893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019733	TTTA	2	8	13085	13092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019733	TAAA	2	8	13853	13860	75 %	25 %	0 %	0 %	428308261
45	NC_019733	ATGA	2	8	13891	13898	50 %	25 %	25 %	0 %	428308261
46	NC_019733	CAAT	2	8	13914	13921	50 %	25 %	0 %	25 %	428308261
47	NC_019733	TGCT	2	8	14135	14142	0 %	50 %	25 %	25 %	428308261
48	NC_019733	TTTG	2	8	14910	14917	0 %	75 %	25 %	0 %	428308261
49	NC_019733	GATG	2	8	15193	15200	25 %	25 %	50 %	0 %	428308261
50	NC_019733	AAGA	2	8	15622	15629	75 %	0 %	25 %	0 %	428308261
51	NC_019733	TGCG	2	8	16079	16086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019733	TAAC	2	8	16337	16344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019733	CATT	2	8	17463	17470	25 %	50 %	0 %	25 %	428308262
54	NC_019733	TTGG	2	8	18744	18751	0 %	50 %	50 %	0 %	428308263
55	NC_019733	CCAG	2	8	19964	19971	25 %	0 %	25 %	50 %	428308264
56	NC_019733	ATTA	2	8	20174	20181	50 %	50 %	0 %	0 %	428308264
57	NC_019733	GTTA	2	8	20561	20568	25 %	50 %	25 %	0 %	428308264
58	NC_019733	CCTG	2	8	20712	20719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019733	AAAC	2	8	20792	20799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019733	TCTT	2	8	20846	20853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019733	TTAA	2	8	21116	21123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019733	AAAT	2	8	21348	21355	75 %	25 %	0 %	0 %	428308265
63	NC_019733	AGAA	2	8	21421	21428	75 %	0 %	25 %	0 %	428308265
64	NC_019733	GTGC	2	8	21920	21927	0 %	25 %	50 %	25 %	428308266
65	NC_019733	GCGT	2	8	22020	22027	0 %	25 %	50 %	25 %	428308266
66	NC_019733	CTTA	2	8	22317	22324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019733	CTTA	2	8	23008	23015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019733	CTTT	2	8	23190	23197	0 %	75 %	0 %	25 %	428308267
69	NC_019733	ACTC	2	8	24049	24056	25 %	25 %	0 %	50 %	428308268
70	NC_019733	TAGA	2	8	24132	24139	50 %	25 %	25 %	0 %	428308268
71	NC_019733	CAAC	2	8	24443	24450	50 %	0 %	0 %	50 %	428308268
72	NC_019733	ATAC	2	8	24970	24977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019733	TTGG	2	8	25356	25363	0 %	50 %	50 %	0 %	428308269
74	NC_019733	ATGA	2	8	26983	26990	50 %	25 %	25 %	0 %	428308270
75	NC_019733	GACA	2	8	27551	27558	50 %	0 %	25 %	25 %	428308270
76	NC_019733	AACC	2	8	27877	27884	50 %	0 %	0 %	50 %	428308270
77	NC_019733	ACAA	2	8	28302	28309	75 %	0 %	0 %	25 %	428308270
78	NC_019733	CTTT	2	8	28456	28463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019733	AGAT	2	8	28757	28764	50 %	25 %	25 %	0 %	428308271
80	NC_019733	CAAT	2	8	29262	29269	50 %	25 %	0 %	25 %	428308271
81	NC_019733	GGAC	2	8	29286	29293	25 %	0 %	50 %	25 %	428308271
82	NC_019733	CAAG	2	8	29616	29623	50 %	0 %	25 %	25 %	428308271
83	NC_019733	GGCA	2	8	29781	29788	25 %	0 %	50 %	25 %	428308272
84	NC_019733	TTCC	2	8	30187	30194	0 %	50 %	0 %	50 %	428308272
85	NC_019733	CAAA	2	8	30528	30535	75 %	0 %	0 %	25 %	428308272
86	NC_019733	GTTT	2	8	30849	30856	0 %	75 %	25 %	0 %	428308273
87	NC_019733	CATT	2	8	31520	31527	25 %	50 %	0 %	25 %	428308274
88	NC_019733	GGCA	2	8	31612	31619	25 %	0 %	50 %	25 %	428308274
89	NC_019733	TAAA	2	8	32178	32185	75 %	25 %	0 %	0 %	428308274
90	NC_019733	TTCC	2	8	33520	33527	0 %	50 %	0 %	50 %	428308275
91	NC_019733	CTGG	2	8	33550	33557	0 %	25 %	50 %	25 %	428308275
92	NC_019733	CTTG	2	8	33597	33604	0 %	50 %	25 %	25 %	428308275
93	NC_019733	CCAG	2	8	33627	33634	25 %	0 %	25 %	50 %	428308275
94	NC_019733	GCCA	2	8	34500	34507	25 %	0 %	25 %	50 %	428308276
95	NC_019733	TCAA	2	8	34625	34632	50 %	25 %	0 %	25 %	428308276
96	NC_019733	CTTG	2	8	35009	35016	0 %	50 %	25 %	25 %	428308276
97	NC_019733	GAAA	2	8	36001	36008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019733	ACTA	2	8	36084	36091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019733	TAAA	2	8	36189	36196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019733	GCAG	2	8	36582	36589	25 %	0 %	50 %	25 %	428308278
101	NC_019733	ATCT	2	8	36590	36597	25 %	50 %	0 %	25 %	428308278
102	NC_019733	TTCT	2	8	36676	36683	0 %	75 %	0 %	25 %	428308278
103	NC_019733	AAAT	2	8	36988	36995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019733	CAAA	2	8	37474	37481	75 %	0 %	0 %	25 %	428308279
105	NC_019733	AGCC	2	8	38046	38053	25 %	0 %	25 %	50 %	428308280
106	NC_019733	GATC	2	8	38121	38128	25 %	25 %	25 %	25 %	428308280
107	NC_019733	CTAG	2	8	39352	39359	25 %	25 %	25 %	25 %	428308281
108	NC_019733	CCCA	2	8	39450	39457	25 %	0 %	0 %	75 %	428308281
109	NC_019733	CTAC	2	8	39523	39530	25 %	25 %	0 %	50 %	428308281
110	NC_019733	TGTA	2	8	39707	39714	25 %	50 %	25 %	0 %	428308281
111	NC_019733	ACAA	2	8	39742	39749	75 %	0 %	0 %	25 %	428308281
112	NC_019733	CCAC	2	8	39897	39904	25 %	0 %	0 %	75 %	428308281
113	NC_019733	TTAA	2	8	40991	40998	50 %	50 %	0 %	0 %	428308282
114	NC_019733	AATT	2	8	41380	41387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019733	CCAG	2	8	41471	41478	25 %	0 %	25 %	50 %	428308283
116	NC_019733	CTAT	2	8	41679	41686	25 %	50 %	0 %	25 %	428308283
117	NC_019733	TCAA	2	8	41901	41908	50 %	25 %	0 %	25 %	428308283
118	NC_019733	ATCA	2	8	42185	42192	50 %	25 %	0 %	25 %	428308283
119	NC_019733	AAGT	2	8	42320	42327	50 %	25 %	25 %	0 %	428308284
120	NC_019733	TATT	2	8	42613	42620	25 %	75 %	0 %	0 %	428308284
121	NC_019733	TACA	2	8	42923	42930	50 %	25 %	0 %	25 %	428308284
122	NC_019733	TGCT	2	8	43352	43359	0 %	50 %	25 %	25 %	428308284
123	NC_019733	CAAA	2	8	43657	43664	75 %	0 %	0 %	25 %	428308284
124	NC_019733	ATAA	2	8	43718	43725	75 %	25 %	0 %	0 %	428308284
125	NC_019733	TTTC	2	8	44290	44297	0 %	75 %	0 %	25 %	428308284
126	NC_019733	TTAA	2	8	44373	44380	50 %	50 %	0 %	0 %	428308284
127	NC_019733	CGCT	2	8	44392	44399	0 %	25 %	25 %	50 %	428308284
128	NC_019733	AACC	2	8	44431	44438	50 %	0 %	0 %	50 %	428308284
129	NC_019733	TAAC	2	8	44541	44548	50 %	25 %	0 %	25 %	428308284
130	NC_019733	TGCT	2	8	44594	44601	0 %	50 %	25 %	25 %	428308284
131	NC_019733	ATCT	2	8	45130	45137	25 %	50 %	0 %	25 %	428308284
132	NC_019733	AACT	2	8	45169	45176	50 %	25 %	0 %	25 %	428308284
133	NC_019733	AATT	2	8	45639	45646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019733	TAGT	2	8	45762	45769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019733	TTGA	2	8	45801	45808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019733	GAAC	2	8	45963	45970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019733	CAGT	2	8	45972	45979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019733	AAGT	2	8	46033	46040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019733	GATA	2	8	46103	46110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019733	AATT	2	8	46549	46556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019733	CTTT	2	8	46639	46646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019733	TTTG	2	8	46786	46793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019733	TCAT	2	8	47133	47140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019733	TGGC	2	8	47239	47246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019733	AAAG	2	8	47383	47390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019733	TTTG	2	8	47544	47551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.