MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	AGT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308249
2	NC_019733	GTT	2	6	207	212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308249
3	NC_019733	TTG	2	6	216	221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308249
4	NC_019733	ACA	2	6	248	253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308249
5	NC_019733	CAC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308249
6	NC_019733	CTC	2	6	597	602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308250
7	NC_019733	GTA	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308250
8	NC_019733	ACT	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308250
9	NC_019733	AAG	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308250
10	NC_019733	GCA	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308250
11	NC_019733	TGA	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308250
12	NC_019733	TAA	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308250
13	NC_019733	GCA	3	9	1576	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308251
14	NC_019733	TCA	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308251
15	NC_019733	GCA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308251
16	NC_019733	AGC	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
17	NC_019733	TCA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
18	NC_019733	GCT	2	6	1965	1970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
19	NC_019733	GAG	2	6	1978	1983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
20	NC_019733	AGC	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
21	NC_019733	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
22	NC_019733	TTA	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
23	NC_019733	ATT	3	9	2178	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
24	NC_019733	TGA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
25	NC_019733	TAG	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
26	NC_019733	CTG	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
27	NC_019733	ACA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
28	NC_019733	ACC	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308252
29	NC_019733	GCA	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
30	NC_019733	ACA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
31	NC_019733	CGA	2	6	2607	2612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
32	NC_019733	GCT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
33	NC_019733	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
34	NC_019733	ATT	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
35	NC_019733	TAC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
36	NC_019733	TAG	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
37	NC_019733	CAT	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
38	NC_019733	CAA	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
39	NC_019733	ATA	2	6	3118	3123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308252
40	NC_019733	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
41	NC_019733	AAG	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308252
42	NC_019733	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
43	NC_019733	ATG	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
44	NC_019733	ATC	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
45	NC_019733	AGC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
46	NC_019733	ATC	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
47	NC_019733	ACT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
48	NC_019733	ACC	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308252
49	NC_019733	TGC	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
50	NC_019733	CTC	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308252
51	NC_019733	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
52	NC_019733	ACA	2	6	3955	3960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
53	NC_019733	CAT	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
54	NC_019733	TTA	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
55	NC_019733	TGA	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
56	NC_019733	ATT	2	6	4659	4664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
57	NC_019733	GAG	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
58	NC_019733	AGG	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
59	NC_019733	GGA	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
60	NC_019733	GCA	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
61	NC_019733	GCT	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
62	NC_019733	ACT	3	9	5143	5151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
63	NC_019733	GGT	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308252
64	NC_019733	ATT	2	6	5232	5237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
65	NC_019733	TAA	2	6	5271	5276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308252
66	NC_019733	TGA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
67	NC_019733	TAG	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
68	NC_019733	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
69	NC_019733	CTA	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
70	NC_019733	GAA	2	6	5540	5545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308252
71	NC_019733	AGA	2	6	5775	5780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308253
72	NC_019733	GTC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308253
73	NC_019733	TTG	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308253
74	NC_019733	TAA	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308253
75	NC_019733	TCC	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308254
76	NC_019733	GTT	2	6	6669	6674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308254
77	NC_019733	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
78	NC_019733	CAA	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
79	NC_019733	GGA	2	6	6897	6902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308254
80	NC_019733	AGC	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308254
81	NC_019733	GAT	2	6	7005	7010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308254
82	NC_019733	AAG	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
83	NC_019733	CTA	2	6	7157	7162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308254
84	NC_019733	AAG	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
85	NC_019733	CAA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
86	NC_019733	CTG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308254
87	NC_019733	ATT	2	6	7352	7357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308254
88	NC_019733	TTA	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308254
89	NC_019733	TTG	2	6	7468	7473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308254
90	NC_019733	GTA	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308254
91	NC_019733	ACC	2	6	7565	7570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308254
92	NC_019733	GAA	2	6	7652	7657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
93	NC_019733	CAA	2	6	7770	7775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
94	NC_019733	TAA	2	6	7804	7809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308254
95	NC_019733	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
96	NC_019733	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
97	NC_019733	TGT	2	6	7841	7846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308254
98	NC_019733	ATC	2	6	7921	7926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308254
99	NC_019733	GAA	2	6	8336	8341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308255
100	NC_019733	GCA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308255
101	NC_019733	TGT	2	6	8767	8772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308256
102	NC_019733	TAA	2	6	8880	8885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308256
103	NC_019733	TCT	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308256
104	NC_019733	TCT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308256
105	NC_019733	TGA	2	6	9030	9035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308256
106	NC_019733	TTA	2	6	9187	9192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
107	NC_019733	TTA	2	6	9292	9297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
108	NC_019733	AGT	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308256
109	NC_019733	GTA	2	6	9385	9390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308256
110	NC_019733	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
111	NC_019733	TTA	3	9	9496	9504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
112	NC_019733	TGT	2	6	9558	9563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308256
113	NC_019733	CTA	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308258
114	NC_019733	TAA	2	6	10320	10325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308258
115	NC_019733	TAA	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308258
116	NC_019733	TGA	2	6	10637	10642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308258
117	NC_019733	ATC	2	6	10802	10807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308258
118	NC_019733	TTA	2	6	10932	10937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308258
119	NC_019733	ATA	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308258
120	NC_019733	CCT	2	6	11300	11305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308259
121	NC_019733	TCA	2	6	11408	11413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308259
122	NC_019733	CTG	2	6	11469	11474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308259
123	NC_019733	TCA	2	6	11518	11523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308259
124	NC_019733	AGA	2	6	11595	11600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308259
125	NC_019733	CTT	2	6	11688	11693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308259
126	NC_019733	TTA	2	6	11710	11715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308259
127	NC_019733	CAA	2	6	13333	13338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308260
128	NC_019733	CAA	2	6	13495	13500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308260
129	NC_019733	CAA	2	6	13568	13573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308260
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500	NC_019733	TCG	2	6	50507	50512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285

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