MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	TC	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	428308249
2	NC_019733	AT	4	8	2016	2023	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
3	NC_019733	TG	3	6	2402	2407	0 %	50 %	50 %	0 %	428308252
4	NC_019733	AT	3	6	3426	3431	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
5	NC_019733	CT	3	6	4638	4643	0 %	50 %	0 %	50 %	428308252
6	NC_019733	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
7	NC_019733	CA	3	6	7797	7802	50 %	0 %	0 %	50 %	428308254
8	NC_019733	CA	3	6	8001	8006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019733	AT	3	6	8197	8202	50 %	50 %	0 %	0 %	428308255
10	NC_019733	TA	3	6	8527	8532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019733	AG	3	6	8566	8571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019733	GA	3	6	9537	9542	50 %	0 %	50 %	0 %	428308256
13	NC_019733	TA	3	6	10987	10992	50 %	50 %	0 %	0 %	428308258
14	NC_019733	TA	3	6	11039	11044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019733	CT	3	6	11293	11298	0 %	50 %	0 %	50 %	428308259
16	NC_019733	TC	3	6	11335	11340	0 %	50 %	0 %	50 %	428308259
17	NC_019733	TG	3	6	11420	11425	0 %	50 %	50 %	0 %	428308259
18	NC_019733	CT	3	6	12078	12083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019733	TA	3	6	12602	12607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019733	TA	3	6	12861	12866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019733	TA	3	6	12964	12969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019733	AG	3	6	13254	13259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019733	GT	3	6	15238	15243	0 %	50 %	50 %	0 %	428308261
24	NC_019733	TC	3	6	16347	16352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019733	TG	3	6	17753	17758	0 %	50 %	50 %	0 %	428308262
26	NC_019733	TA	3	6	17948	17953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019733	CG	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019733	CT	4	8	19843	19850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019733	CT	3	6	20865	20870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019733	TG	3	6	20943	20948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019733	CA	3	6	21148	21153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019733	TA	4	8	21170	21177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019733	AT	3	6	21180	21185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019733	TA	3	6	21210	21215	50 %	50 %	0 %	0 %	428308265
35	NC_019733	CG	3	6	22636	22641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019733	AC	3	6	25284	25289	50 %	0 %	0 %	50 %	428308269
37	NC_019733	GA	3	6	25344	25349	50 %	0 %	50 %	0 %	428308269
38	NC_019733	AC	3	6	25548	25553	50 %	0 %	0 %	50 %	428308269
39	NC_019733	GA	3	6	26816	26821	50 %	0 %	50 %	0 %	428308270
40	NC_019733	AT	3	6	26895	26900	50 %	50 %	0 %	0 %	428308270
41	NC_019733	GA	3	6	27352	27357	50 %	0 %	50 %	0 %	428308270
42	NC_019733	AT	3	6	27571	27576	50 %	50 %	0 %	0 %	428308270
43	NC_019733	AT	3	6	28872	28877	50 %	50 %	0 %	0 %	428308271
44	NC_019733	AG	3	6	29708	29713	50 %	0 %	50 %	0 %	428308272
45	NC_019733	CG	3	6	31012	31017	0 %	0 %	50 %	50 %	428308273
46	NC_019733	TG	3	6	32004	32009	0 %	50 %	50 %	0 %	428308274
47	NC_019733	TG	3	6	32070	32075	0 %	50 %	50 %	0 %	428308274
48	NC_019733	AT	3	6	33838	33843	50 %	50 %	0 %	0 %	428308276
49	NC_019733	TC	3	6	35533	35538	0 %	50 %	0 %	50 %	428308277
50	NC_019733	TA	3	6	37040	37045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019733	AC	3	6	37453	37458	50 %	0 %	0 %	50 %	428308279
52	NC_019733	TG	3	6	37600	37605	0 %	50 %	50 %	0 %	428308279
53	NC_019733	GC	4	8	38805	38812	0 %	0 %	50 %	50 %	428308280
54	NC_019733	AT	3	6	39234	39239	50 %	50 %	0 %	0 %	428308281
55	NC_019733	GA	3	6	39538	39543	50 %	0 %	50 %	0 %	428308281
56	NC_019733	AT	3	6	40117	40122	50 %	50 %	0 %	0 %	428308281
57	NC_019733	TG	3	6	40247	40252	0 %	50 %	50 %	0 %	428308281
58	NC_019733	TC	3	6	41171	41176	0 %	50 %	0 %	50 %	428308282
59	NC_019733	TC	3	6	41583	41588	0 %	50 %	0 %	50 %	428308283
60	NC_019733	AT	3	6	41591	41596	50 %	50 %	0 %	0 %	428308283
61	NC_019733	TA	3	6	46265	46270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019733	TC	3	6	47161	47166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019733	TC	3	6	47211	47216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019733	AT	3	6	47247	47252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019733	TG	3	6	48189	48194	0 %	50 %	50 %	0 %	428308285
66	NC_019733	AT	3	6	48339	48344	50 %	50 %	0 %	0 %	428308285
67	NC_019733	AT	3	6	48578	48583	50 %	50 %	0 %	0 %	428308285
68	NC_019733	CG	3	6	51563	51568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019733	TC	3	6	52347	52352	0 %	50 %	0 %	50 %	428308286
70	NC_019733	AT	3	6	52600	52605	50 %	50 %	0 %	0 %	428308286
71	NC_019733	TG	3	6	52619	52624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019733	TG	3	6	53029	53034	0 %	50 %	50 %	0 %	428308287
73	NC_019733	GT	3	6	53873	53878	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
74	NC_019733	TG	3	6	53897	53902	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
75	NC_019733	TG	3	6	53994	53999	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
76	NC_019733	AG	3	6	54817	54822	50 %	0 %	50 %	0 %	428308291
77	NC_019733	TA	4	8	54918	54925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.