MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	TC	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	428308249
2	NC_019733	AT	4	8	2016	2023	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
3	NC_019733	TG	3	6	2402	2407	0 %	50 %	50 %	0 %	428308252
4	NC_019733	AT	3	6	3426	3431	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
5	NC_019733	CT	3	6	4638	4643	0 %	50 %	0 %	50 %	428308252
6	NC_019733	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
7	NC_019733	CA	3	6	7797	7802	50 %	0 %	0 %	50 %	428308254
8	NC_019733	AT	3	6	8197	8202	50 %	50 %	0 %	0 %	428308255
9	NC_019733	GA	3	6	9537	9542	50 %	0 %	50 %	0 %	428308256
10	NC_019733	TA	3	6	10987	10992	50 %	50 %	0 %	0 %	428308258
11	NC_019733	CT	3	6	11293	11298	0 %	50 %	0 %	50 %	428308259
12	NC_019733	TC	3	6	11335	11340	0 %	50 %	0 %	50 %	428308259
13	NC_019733	TG	3	6	11420	11425	0 %	50 %	50 %	0 %	428308259
14	NC_019733	GT	3	6	15238	15243	0 %	50 %	50 %	0 %	428308261
15	NC_019733	TG	3	6	17753	17758	0 %	50 %	50 %	0 %	428308262
16	NC_019733	TA	3	6	21210	21215	50 %	50 %	0 %	0 %	428308265
17	NC_019733	AC	3	6	25284	25289	50 %	0 %	0 %	50 %	428308269
18	NC_019733	GA	3	6	25344	25349	50 %	0 %	50 %	0 %	428308269
19	NC_019733	AC	3	6	25548	25553	50 %	0 %	0 %	50 %	428308269
20	NC_019733	GA	3	6	26816	26821	50 %	0 %	50 %	0 %	428308270
21	NC_019733	AT	3	6	26895	26900	50 %	50 %	0 %	0 %	428308270
22	NC_019733	GA	3	6	27352	27357	50 %	0 %	50 %	0 %	428308270
23	NC_019733	AT	3	6	27571	27576	50 %	50 %	0 %	0 %	428308270
24	NC_019733	AT	3	6	28872	28877	50 %	50 %	0 %	0 %	428308271
25	NC_019733	AG	3	6	29708	29713	50 %	0 %	50 %	0 %	428308272
26	NC_019733	CG	3	6	31012	31017	0 %	0 %	50 %	50 %	428308273
27	NC_019733	TG	3	6	32004	32009	0 %	50 %	50 %	0 %	428308274
28	NC_019733	TG	3	6	32070	32075	0 %	50 %	50 %	0 %	428308274
29	NC_019733	AT	3	6	33838	33843	50 %	50 %	0 %	0 %	428308276
30	NC_019733	TC	3	6	35533	35538	0 %	50 %	0 %	50 %	428308277
31	NC_019733	AC	3	6	37453	37458	50 %	0 %	0 %	50 %	428308279
32	NC_019733	TG	3	6	37600	37605	0 %	50 %	50 %	0 %	428308279
33	NC_019733	GC	4	8	38805	38812	0 %	0 %	50 %	50 %	428308280
34	NC_019733	AT	3	6	39234	39239	50 %	50 %	0 %	0 %	428308281
35	NC_019733	GA	3	6	39538	39543	50 %	0 %	50 %	0 %	428308281
36	NC_019733	AT	3	6	40117	40122	50 %	50 %	0 %	0 %	428308281
37	NC_019733	TG	3	6	40247	40252	0 %	50 %	50 %	0 %	428308281
38	NC_019733	TC	3	6	41171	41176	0 %	50 %	0 %	50 %	428308282
39	NC_019733	TC	3	6	41583	41588	0 %	50 %	0 %	50 %	428308283
40	NC_019733	AT	3	6	41591	41596	50 %	50 %	0 %	0 %	428308283
41	NC_019733	TG	3	6	48189	48194	0 %	50 %	50 %	0 %	428308285
42	NC_019733	AT	3	6	48339	48344	50 %	50 %	0 %	0 %	428308285
43	NC_019733	AT	3	6	48578	48583	50 %	50 %	0 %	0 %	428308285
44	NC_019733	TC	3	6	52347	52352	0 %	50 %	0 %	50 %	428308286
45	NC_019733	AT	3	6	52600	52605	50 %	50 %	0 %	0 %	428308286
46	NC_019733	TG	3	6	53029	53034	0 %	50 %	50 %	0 %	428308287
47	NC_019733	GT	3	6	53873	53878	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
48	NC_019733	TG	3	6	53897	53902	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
49	NC_019733	TG	3	6	53994	53999	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
50	NC_019733	AG	3	6	54817	54822	50 %	0 %	50 %	0 %	428308291

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.