MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	T	6	6	329	334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019733	T	6	6	1365	1370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019733	A	6	6	2779	2784	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
4	NC_019733	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
5	NC_019733	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
6	NC_019733	A	6	6	3051	3056	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
7	NC_019733	A	6	6	3601	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
8	NC_019733	A	6	6	3655	3660	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
9	NC_019733	A	6	6	4624	4629	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
10	NC_019733	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
11	NC_019733	A	6	6	5820	5825	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
12	NC_019733	A	6	6	5880	5885	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
13	NC_019733	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
14	NC_019733	T	6	6	6789	6794	0 %	100 %	0 %	0 %	428308254
15	NC_019733	A	6	6	6849	6854	100 %	0 %	0 %	0 %	428308254
16	NC_019733	T	6	6	8687	8692	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
17	NC_019733	T	6	6	8801	8806	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
18	NC_019733	T	6	6	9142	9147	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
19	NC_019733	T	6	6	9445	9450	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
20	NC_019733	A	6	6	9585	9590	100 %	0 %	0 %	0 %	428308256
21	NC_019733	T	6	6	9628	9633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019733	T	8	8	10461	10468	0 %	100 %	0 %	0 %	428308258
23	NC_019733	T	6	6	10950	10955	0 %	100 %	0 %	0 %	428308258
24	NC_019733	A	6	6	11149	11154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019733	C	6	6	11856	11861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_019733	A	8	8	12253	12260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019733	A	6	6	14047	14052	100 %	0 %	0 %	0 %	428308261
28	NC_019733	A	7	7	16404	16410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019733	A	6	6	19146	19151	100 %	0 %	0 %	0 %	428308263
30	NC_019733	A	6	6	23078	23083	100 %	0 %	0 %	0 %	428308267
31	NC_019733	T	6	6	24659	24664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019733	T	6	6	24735	24740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019733	A	6	6	24929	24934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019733	A	6	6	25148	25153	100 %	0 %	0 %	0 %	428308269
35	NC_019733	T	6	6	25381	25386	0 %	100 %	0 %	0 %	428308269
36	NC_019733	T	7	7	25777	25783	0 %	100 %	0 %	0 %	428308269
37	NC_019733	T	6	6	26463	26468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019733	T	6	6	26810	26815	0 %	100 %	0 %	0 %	428308270
39	NC_019733	A	6	6	27386	27391	100 %	0 %	0 %	0 %	428308270
40	NC_019733	C	6	6	27482	27487	0 %	0 %	0 %	100 %	428308270
41	NC_019733	C	6	6	27562	27567	0 %	0 %	0 %	100 %	428308270
42	NC_019733	A	6	6	27885	27890	100 %	0 %	0 %	0 %	428308270
43	NC_019733	T	6	6	28801	28806	0 %	100 %	0 %	0 %	428308271
44	NC_019733	T	6	6	28855	28860	0 %	100 %	0 %	0 %	428308271
45	NC_019733	A	6	6	29604	29609	100 %	0 %	0 %	0 %	428308271
46	NC_019733	T	6	6	30636	30641	0 %	100 %	0 %	0 %	428308273
47	NC_019733	T	7	7	30961	30967	0 %	100 %	0 %	0 %	428308273
48	NC_019733	T	6	6	31178	31183	0 %	100 %	0 %	0 %	428308274
49	NC_019733	T	7	7	31544	31550	0 %	100 %	0 %	0 %	428308274
50	NC_019733	A	6	6	31987	31992	100 %	0 %	0 %	0 %	428308274
51	NC_019733	A	6	6	32025	32030	100 %	0 %	0 %	0 %	428308274
52	NC_019733	T	8	8	32325	32332	0 %	100 %	0 %	0 %	428308274
53	NC_019733	A	6	6	32449	32454	100 %	0 %	0 %	0 %	428308274
54	NC_019733	A	6	6	32525	32530	100 %	0 %	0 %	0 %	428308274
55	NC_019733	T	7	7	32819	32825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019733	A	6	6	32832	32837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019733	A	6	6	32861	32866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019733	A	7	7	32954	32960	100 %	0 %	0 %	0 %	428308275
59	NC_019733	T	6	6	32989	32994	0 %	100 %	0 %	0 %	428308275
60	NC_019733	T	6	6	33591	33596	0 %	100 %	0 %	0 %	428308275
61	NC_019733	T	7	7	34544	34550	0 %	100 %	0 %	0 %	428308276
62	NC_019733	A	6	6	35181	35186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019733	T	7	7	35592	35598	0 %	100 %	0 %	0 %	428308277
64	NC_019733	A	7	7	36408	36414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019733	T	7	7	36732	36738	0 %	100 %	0 %	0 %	428308278
66	NC_019733	A	6	6	36740	36745	100 %	0 %	0 %	0 %	428308278
67	NC_019733	T	6	6	36886	36891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019733	T	6	6	36907	36912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019733	T	7	7	38191	38197	0 %	100 %	0 %	0 %	428308280
70	NC_019733	T	6	6	39068	39073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019733	T	7	7	41094	41100	0 %	100 %	0 %	0 %	428308282
72	NC_019733	T	6	6	41374	41379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019733	T	6	6	41437	41442	0 %	100 %	0 %	0 %	428308283
74	NC_019733	T	9	9	41627	41635	0 %	100 %	0 %	0 %	428308283
75	NC_019733	T	6	6	41768	41773	0 %	100 %	0 %	0 %	428308283
76	NC_019733	A	6	6	42238	42243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019733	T	6	6	42364	42369	0 %	100 %	0 %	0 %	428308284
78	NC_019733	T	7	7	42730	42736	0 %	100 %	0 %	0 %	428308284
79	NC_019733	T	7	7	43739	43745	0 %	100 %	0 %	0 %	428308284
80	NC_019733	A	6	6	45023	45028	100 %	0 %	0 %	0 %	428308284
81	NC_019733	A	7	7	45233	45239	100 %	0 %	0 %	0 %	428308284
82	NC_019733	T	6	6	45519	45524	0 %	100 %	0 %	0 %	428308284
83	NC_019733	T	8	8	45691	45698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019733	T	6	6	46366	46371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019733	T	6	6	46380	46385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019733	T	6	6	46535	46540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019733	T	6	6	46830	46835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019733	A	6	6	47100	47105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019733	A	7	7	47444	47450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019733	A	9	9	47468	47476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019733	A	6	6	47487	47492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019733	T	6	6	51370	51375	0 %	100 %	0 %	0 %	428308285
93	NC_019733	A	6	6	52215	52220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.