MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	CCAACC	2	12	271	282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303568
2	NC_019728	TCTTTG	2	12	7436	7447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428303574
3	NC_019728	CAATTT	2	12	9832	9843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428303575
4	NC_019728	TTCCTG	2	12	10484	10495	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428303575
5	NC_019728	AAATAC	2	12	14424	14435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428303578
6	NC_019728	GATAAA	2	12	14951	14962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428303578
7	NC_019728	AGCATT	2	12	16107	16118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428303579
8	NC_019728	CCATCA	2	12	17185	17196	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428303579
9	NC_019728	GATTTG	2	12	19381	19392	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303581
10	NC_019728	AAACTA	2	12	22632	22643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428303582
11	NC_019728	TTTATT	2	12	25308	25319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019728	GGAAAG	2	12	28696	28707	50 %	0 %	50 %	0 %	428303587
13	NC_019728	ATAAAA	2	12	28810	28821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428303587
14	NC_019728	ATCAAT	2	12	29069	29080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428303588
15	NC_019728	CAATCA	2	12	34933	34944	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428303596
16	NC_019728	AATATG	2	12	44728	44739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428303605
17	NC_019728	AGGGAA	2	12	44861	44872	50 %	0 %	50 %	0 %	428303605
18	NC_019728	ATTAGT	2	12	47175	47186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428303608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.