MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	TTAC	2	8	306	313	25 %	50 %	0 %	25 %	428303568
2	NC_019728	AAAC	2	8	808	815	75 %	0 %	0 %	25 %	428303568
3	NC_019728	TTGA	2	8	937	944	25 %	50 %	25 %	0 %	428303568
4	NC_019728	ACAA	2	8	1263	1270	75 %	0 %	0 %	25 %	428303569
5	NC_019728	CCTT	2	8	1397	1404	0 %	50 %	0 %	50 %	428303569
6	NC_019728	GTAT	2	8	1412	1419	25 %	50 %	25 %	0 %	428303569
7	NC_019728	AGTG	2	8	1871	1878	25 %	25 %	50 %	0 %	428303569
8	NC_019728	AAAG	2	8	2441	2448	75 %	0 %	25 %	0 %	428303570
9	NC_019728	AGCA	2	8	2451	2458	50 %	0 %	25 %	25 %	428303570
10	NC_019728	GACT	2	8	2632	2639	25 %	25 %	25 %	25 %	428303570
11	NC_019728	GTTC	2	8	2779	2786	0 %	50 %	25 %	25 %	428303570
12	NC_019728	ATTT	2	8	3222	3229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019728	GAAT	2	8	3773	3780	50 %	25 %	25 %	0 %	428303571
14	NC_019728	TAAT	2	8	5010	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	428303572
15	NC_019728	AAAG	2	8	5077	5084	75 %	0 %	25 %	0 %	428303572
16	NC_019728	CAAT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	428303572
17	NC_019728	AAAC	2	8	5661	5668	75 %	0 %	0 %	25 %	428303572
18	NC_019728	ACAA	2	8	5706	5713	75 %	0 %	0 %	25 %	428303572
19	NC_019728	CATT	2	8	6152	6159	25 %	50 %	0 %	25 %	428303573
20	NC_019728	CTGC	2	8	6426	6433	0 %	25 %	25 %	50 %	428303573
21	NC_019728	ATTA	2	8	7354	7361	50 %	50 %	0 %	0 %	428303574
22	NC_019728	TGGC	2	8	7476	7483	0 %	25 %	50 %	25 %	428303574
23	NC_019728	ATTG	2	8	7559	7566	25 %	50 %	25 %	0 %	428303574
24	NC_019728	TAAT	2	8	10707	10714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019728	TATT	2	8	11134	11141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019728	AAAT	2	8	11274	11281	75 %	25 %	0 %	0 %	428303577
27	NC_019728	ATCA	2	8	11391	11398	50 %	25 %	0 %	25 %	428303577
28	NC_019728	TATT	2	8	11975	11982	25 %	75 %	0 %	0 %	428303578
29	NC_019728	TGTC	2	8	12032	12039	0 %	50 %	25 %	25 %	428303578
30	NC_019728	TTGT	2	8	12460	12467	0 %	75 %	25 %	0 %	428303578
31	NC_019728	TGAT	2	8	12529	12536	25 %	50 %	25 %	0 %	428303578
32	NC_019728	TGAT	2	8	12730	12737	25 %	50 %	25 %	0 %	428303578
33	NC_019728	ATTT	2	8	12876	12883	25 %	75 %	0 %	0 %	428303578
34	NC_019728	CATA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	0 %	25 %	428303578
35	NC_019728	CTTT	2	8	13170	13177	0 %	75 %	0 %	25 %	428303578
36	NC_019728	TGAC	2	8	13229	13236	25 %	25 %	25 %	25 %	428303578
37	NC_019728	ATAA	2	8	13249	13256	75 %	25 %	0 %	0 %	428303578
38	NC_019728	GACA	2	8	14025	14032	50 %	0 %	25 %	25 %	428303578
39	NC_019728	AAAT	2	8	14230	14237	75 %	25 %	0 %	0 %	428303578
40	NC_019728	TTCC	2	8	14863	14870	0 %	50 %	0 %	50 %	428303578
41	NC_019728	ACGA	2	8	15339	15346	50 %	0 %	25 %	25 %	428303578
42	NC_019728	TAGC	2	8	15444	15451	25 %	25 %	25 %	25 %	428303578
43	NC_019728	TAAA	2	8	15849	15856	75 %	25 %	0 %	0 %	428303579
44	NC_019728	GCAC	2	8	16191	16198	25 %	0 %	25 %	50 %	428303579
45	NC_019728	GAAT	2	8	16577	16584	50 %	25 %	25 %	0 %	428303579
46	NC_019728	TAAT	2	8	16841	16848	50 %	50 %	0 %	0 %	428303579
47	NC_019728	GTTC	2	8	16874	16881	0 %	50 %	25 %	25 %	428303579
48	NC_019728	AAAT	2	8	17790	17797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019728	GCTT	2	8	17908	17915	0 %	50 %	25 %	25 %	428303580
50	NC_019728	TTGC	2	8	17919	17926	0 %	50 %	25 %	25 %	428303580
51	NC_019728	AATT	2	8	18000	18007	50 %	50 %	0 %	0 %	428303580
52	NC_019728	CAAT	2	8	19530	19537	50 %	25 %	0 %	25 %	428303581
53	NC_019728	CTTA	2	8	20036	20043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019728	AGCA	2	8	21002	21009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019728	AGCA	2	8	21527	21534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019728	AATT	2	8	21537	21544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019728	ATTA	2	8	21984	21991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019728	GGTA	2	8	22227	22234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019728	CTCG	2	8	22447	22454	0 %	25 %	25 %	50 %	428303582
60	NC_019728	ATTT	2	8	22522	22529	25 %	75 %	0 %	0 %	428303582
61	NC_019728	CATT	2	8	22623	22630	25 %	50 %	0 %	25 %	428303582
62	NC_019728	TTTA	2	8	22769	22776	25 %	75 %	0 %	0 %	428303582
63	NC_019728	TTCC	2	8	23009	23016	0 %	50 %	0 %	50 %	428303582
64	NC_019728	TAAA	2	8	23438	23445	75 %	25 %	0 %	0 %	428303582
65	NC_019728	ATTA	2	8	23570	23577	50 %	50 %	0 %	0 %	428303582
66	NC_019728	TATT	2	8	23614	23621	25 %	75 %	0 %	0 %	428303582
67	NC_019728	TCTA	2	8	23813	23820	25 %	50 %	0 %	25 %	428303582
68	NC_019728	CATC	2	8	23904	23911	25 %	25 %	0 %	50 %	428303582
69	NC_019728	AGAA	2	8	24256	24263	75 %	0 %	25 %	0 %	428303582
70	NC_019728	TTCA	2	8	24545	24552	25 %	50 %	0 %	25 %	428303582
71	NC_019728	AATT	2	8	24639	24646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019728	TTTC	2	8	24875	24882	0 %	75 %	0 %	25 %	428303583
73	NC_019728	ATTT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019728	AGCT	2	8	25431	25438	25 %	25 %	25 %	25 %	428303584
75	NC_019728	TCCA	2	8	25570	25577	25 %	25 %	0 %	50 %	428303584
76	NC_019728	ACCA	2	8	26430	26437	50 %	0 %	0 %	50 %	428303585
77	NC_019728	TAAT	2	8	26898	26905	50 %	50 %	0 %	0 %	428303585
78	NC_019728	TTTA	2	8	26996	27003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019728	TATT	2	8	27293	27300	25 %	75 %	0 %	0 %	428303586
80	NC_019728	AAGA	2	8	27712	27719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019728	AAGC	2	8	27966	27973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019728	CTAT	2	8	28161	28168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019728	ATAA	2	8	28508	28515	75 %	25 %	0 %	0 %	428303587
84	NC_019728	AAGT	2	8	28582	28589	50 %	25 %	25 %	0 %	428303587
85	NC_019728	GACC	2	8	28829	28836	25 %	0 %	25 %	50 %	428303588
86	NC_019728	AAGA	2	8	28837	28844	75 %	0 %	25 %	0 %	428303588
87	NC_019728	AATT	2	8	28849	28856	50 %	50 %	0 %	0 %	428303588
88	NC_019728	TCCA	2	8	29589	29596	25 %	25 %	0 %	50 %	428303589
89	NC_019728	GTAG	2	8	29605	29612	25 %	25 %	50 %	0 %	428303589
90	NC_019728	TCGC	2	8	29763	29770	0 %	25 %	25 %	50 %	428303590
91	NC_019728	TTCG	2	8	29783	29790	0 %	50 %	25 %	25 %	428303590
92	NC_019728	AAAT	2	8	29797	29804	75 %	25 %	0 %	0 %	428303590
93	NC_019728	TTAA	2	8	29958	29965	50 %	50 %	0 %	0 %	428303590
94	NC_019728	AAGA	2	8	30317	30324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019728	AATG	2	8	30557	30564	50 %	25 %	25 %	0 %	428303591
96	NC_019728	CCTA	2	8	30582	30589	25 %	25 %	0 %	50 %	428303591
97	NC_019728	GTAA	2	8	31025	31032	50 %	25 %	25 %	0 %	428303591
98	NC_019728	TGCT	2	8	31057	31064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019728	CTTT	2	8	31074	31081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019728	TAAT	2	8	31710	31717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019728	GTCT	2	8	31736	31743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019728	GCAA	2	8	32223	32230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019728	TACT	2	8	32288	32295	25 %	50 %	0 %	25 %	428303594
104	NC_019728	CTGG	2	8	32738	32745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019728	ATTA	2	8	32753	32760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019728	GGCT	2	8	33282	33289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019728	CAAT	2	8	33382	33389	50 %	25 %	0 %	25 %	428303595
108	NC_019728	TTGA	2	8	34352	34359	25 %	50 %	25 %	0 %	428303595
109	NC_019728	TAAA	2	8	34768	34775	75 %	25 %	0 %	0 %	428303595
110	NC_019728	GTTT	2	8	34945	34952	0 %	75 %	25 %	0 %	428303596
111	NC_019728	GTTT	2	8	35010	35017	0 %	75 %	25 %	0 %	428303596
112	NC_019728	GTTA	2	8	35174	35181	25 %	50 %	25 %	0 %	428303596
113	NC_019728	ATTA	2	8	35186	35193	50 %	50 %	0 %	0 %	428303596
114	NC_019728	AACT	2	8	35284	35291	50 %	25 %	0 %	25 %	428303596
115	NC_019728	TTCT	2	8	35957	35964	0 %	75 %	0 %	25 %	428303597
116	NC_019728	TTGA	2	8	36620	36627	25 %	50 %	25 %	0 %	428303598
117	NC_019728	ACTG	2	8	36738	36745	25 %	25 %	25 %	25 %	428303598
118	NC_019728	TGCT	2	8	37280	37287	0 %	50 %	25 %	25 %	428303599
119	NC_019728	ACCC	2	8	37368	37375	25 %	0 %	0 %	75 %	428303599
120	NC_019728	AAAT	2	8	39375	39382	75 %	25 %	0 %	0 %	428303601
121	NC_019728	AGAT	2	8	39480	39487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019728	AAAG	2	8	40364	40371	75 %	0 %	25 %	0 %	428303602
123	NC_019728	GCTT	2	8	40608	40615	0 %	50 %	25 %	25 %	428303602
124	NC_019728	TATG	2	8	40616	40623	25 %	50 %	25 %	0 %	428303602
125	NC_019728	ATCG	2	8	41081	41088	25 %	25 %	25 %	25 %	428303602
126	NC_019728	TGGA	2	8	41754	41761	25 %	25 %	50 %	0 %	428303602
127	NC_019728	GCTG	2	8	42599	42606	0 %	25 %	50 %	25 %	428303603
128	NC_019728	CTTA	2	8	42679	42686	25 %	50 %	0 %	25 %	428303603
129	NC_019728	TATG	2	8	42840	42847	25 %	50 %	25 %	0 %	428303603
130	NC_019728	GATG	2	8	43520	43527	25 %	25 %	50 %	0 %	428303604
131	NC_019728	GCTT	2	8	43746	43753	0 %	50 %	25 %	25 %	428303605
132	NC_019728	ATTG	2	8	44775	44782	25 %	50 %	25 %	0 %	428303605
133	NC_019728	TCGT	2	8	45048	45055	0 %	50 %	25 %	25 %	428303605
134	NC_019728	GAAT	2	8	45128	45135	50 %	25 %	25 %	0 %	428303605
135	NC_019728	AGCC	2	8	45421	45428	25 %	0 %	25 %	50 %	428303606
136	NC_019728	TGGC	2	8	45475	45482	0 %	25 %	50 %	25 %	428303606
137	NC_019728	TTAA	2	8	45840	45847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019728	AAAT	2	8	46478	46485	75 %	25 %	0 %	0 %	428303607
139	NC_019728	CTTT	2	8	46792	46799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019728	AATG	2	8	46845	46852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019728	GCAA	2	8	47028	47035	50 %	0 %	25 %	25 %	428303608
142	NC_019728	ACAA	2	8	47039	47046	75 %	0 %	0 %	25 %	428303608
143	NC_019728	AAAC	2	8	47086	47093	75 %	0 %	0 %	25 %	428303608
144	NC_019728	GTAA	2	8	47794	47801	50 %	25 %	25 %	0 %	428303608
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.