MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	ATTT	2	8	3222	3229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019728	TAAT	2	8	10707	10714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019728	TATT	2	8	11134	11141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019728	AAAT	2	8	17790	17797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019728	CTTA	2	8	20036	20043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019728	AGCA	2	8	21002	21009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019728	AGCA	2	8	21527	21534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019728	AATT	2	8	21537	21544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019728	ATTA	2	8	21984	21991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019728	GGTA	2	8	22227	22234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019728	AATT	2	8	24639	24646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019728	ATTT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019728	TTTA	2	8	26996	27003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019728	AAGA	2	8	27712	27719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019728	AAGC	2	8	27966	27973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019728	CTAT	2	8	28161	28168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019728	AAGA	2	8	30317	30324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019728	TGCT	2	8	31057	31064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019728	CTTT	2	8	31074	31081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019728	TAAT	2	8	31710	31717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019728	GTCT	2	8	31736	31743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019728	GCAA	2	8	32223	32230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019728	CTGG	2	8	32738	32745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019728	ATTA	2	8	32753	32760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019728	GGCT	2	8	33282	33289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019728	AGAT	2	8	39480	39487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019728	TTAA	2	8	45840	45847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019728	CTTT	2	8	46792	46799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019728	AATG	2	8	46845	46852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019728	TTTA	2	8	47950	47957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019728	TGCT	2	8	49371	49378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019728	CTTT	2	8	51810	51817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019728	AAAT	2	8	51934	51941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019728	AAGC	2	8	52996	53003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019728	AAAT	2	8	53169	53176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019728	CAAA	2	8	53354	53361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019728	TCCA	2	8	55654	55661	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.