MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	TTAC	2	8	306	313	25 %	50 %	0 %	25 %	428303568
2	NC_019728	AAAC	2	8	808	815	75 %	0 %	0 %	25 %	428303568
3	NC_019728	TTGA	2	8	937	944	25 %	50 %	25 %	0 %	428303568
4	NC_019728	ACAA	2	8	1263	1270	75 %	0 %	0 %	25 %	428303569
5	NC_019728	CCTT	2	8	1397	1404	0 %	50 %	0 %	50 %	428303569
6	NC_019728	GTAT	2	8	1412	1419	25 %	50 %	25 %	0 %	428303569
7	NC_019728	AGTG	2	8	1871	1878	25 %	25 %	50 %	0 %	428303569
8	NC_019728	AAAG	2	8	2441	2448	75 %	0 %	25 %	0 %	428303570
9	NC_019728	AGCA	2	8	2451	2458	50 %	0 %	25 %	25 %	428303570
10	NC_019728	GACT	2	8	2632	2639	25 %	25 %	25 %	25 %	428303570
11	NC_019728	GTTC	2	8	2779	2786	0 %	50 %	25 %	25 %	428303570
12	NC_019728	GAAT	2	8	3773	3780	50 %	25 %	25 %	0 %	428303571
13	NC_019728	TAAT	2	8	5010	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	428303572
14	NC_019728	AAAG	2	8	5077	5084	75 %	0 %	25 %	0 %	428303572
15	NC_019728	CAAT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	428303572
16	NC_019728	AAAC	2	8	5661	5668	75 %	0 %	0 %	25 %	428303572
17	NC_019728	ACAA	2	8	5706	5713	75 %	0 %	0 %	25 %	428303572
18	NC_019728	CATT	2	8	6152	6159	25 %	50 %	0 %	25 %	428303573
19	NC_019728	CTGC	2	8	6426	6433	0 %	25 %	25 %	50 %	428303573
20	NC_019728	ATTA	2	8	7354	7361	50 %	50 %	0 %	0 %	428303574
21	NC_019728	TGGC	2	8	7476	7483	0 %	25 %	50 %	25 %	428303574
22	NC_019728	ATTG	2	8	7559	7566	25 %	50 %	25 %	0 %	428303574
23	NC_019728	AAAT	2	8	11274	11281	75 %	25 %	0 %	0 %	428303577
24	NC_019728	ATCA	2	8	11391	11398	50 %	25 %	0 %	25 %	428303577
25	NC_019728	TATT	2	8	11975	11982	25 %	75 %	0 %	0 %	428303578
26	NC_019728	TGTC	2	8	12032	12039	0 %	50 %	25 %	25 %	428303578
27	NC_019728	TTGT	2	8	12460	12467	0 %	75 %	25 %	0 %	428303578
28	NC_019728	TGAT	2	8	12529	12536	25 %	50 %	25 %	0 %	428303578
29	NC_019728	TGAT	2	8	12730	12737	25 %	50 %	25 %	0 %	428303578
30	NC_019728	ATTT	2	8	12876	12883	25 %	75 %	0 %	0 %	428303578
31	NC_019728	CATA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	0 %	25 %	428303578
32	NC_019728	CTTT	2	8	13170	13177	0 %	75 %	0 %	25 %	428303578
33	NC_019728	TGAC	2	8	13229	13236	25 %	25 %	25 %	25 %	428303578
34	NC_019728	ATAA	2	8	13249	13256	75 %	25 %	0 %	0 %	428303578
35	NC_019728	GACA	2	8	14025	14032	50 %	0 %	25 %	25 %	428303578
36	NC_019728	AAAT	2	8	14230	14237	75 %	25 %	0 %	0 %	428303578
37	NC_019728	TTCC	2	8	14863	14870	0 %	50 %	0 %	50 %	428303578
38	NC_019728	ACGA	2	8	15339	15346	50 %	0 %	25 %	25 %	428303578
39	NC_019728	TAGC	2	8	15444	15451	25 %	25 %	25 %	25 %	428303578
40	NC_019728	TAAA	2	8	15849	15856	75 %	25 %	0 %	0 %	428303579
41	NC_019728	GCAC	2	8	16191	16198	25 %	0 %	25 %	50 %	428303579
42	NC_019728	GAAT	2	8	16577	16584	50 %	25 %	25 %	0 %	428303579
43	NC_019728	TAAT	2	8	16841	16848	50 %	50 %	0 %	0 %	428303579
44	NC_019728	GTTC	2	8	16874	16881	0 %	50 %	25 %	25 %	428303579
45	NC_019728	GCTT	2	8	17908	17915	0 %	50 %	25 %	25 %	428303580
46	NC_019728	TTGC	2	8	17919	17926	0 %	50 %	25 %	25 %	428303580
47	NC_019728	AATT	2	8	18000	18007	50 %	50 %	0 %	0 %	428303580
48	NC_019728	CAAT	2	8	19530	19537	50 %	25 %	0 %	25 %	428303581
49	NC_019728	CTCG	2	8	22447	22454	0 %	25 %	25 %	50 %	428303582
50	NC_019728	ATTT	2	8	22522	22529	25 %	75 %	0 %	0 %	428303582
51	NC_019728	CATT	2	8	22623	22630	25 %	50 %	0 %	25 %	428303582
52	NC_019728	TTTA	2	8	22769	22776	25 %	75 %	0 %	0 %	428303582
53	NC_019728	TTCC	2	8	23009	23016	0 %	50 %	0 %	50 %	428303582
54	NC_019728	TAAA	2	8	23438	23445	75 %	25 %	0 %	0 %	428303582
55	NC_019728	ATTA	2	8	23570	23577	50 %	50 %	0 %	0 %	428303582
56	NC_019728	TATT	2	8	23614	23621	25 %	75 %	0 %	0 %	428303582
57	NC_019728	TCTA	2	8	23813	23820	25 %	50 %	0 %	25 %	428303582
58	NC_019728	CATC	2	8	23904	23911	25 %	25 %	0 %	50 %	428303582
59	NC_019728	AGAA	2	8	24256	24263	75 %	0 %	25 %	0 %	428303582
60	NC_019728	TTCA	2	8	24545	24552	25 %	50 %	0 %	25 %	428303582
61	NC_019728	TTTC	2	8	24875	24882	0 %	75 %	0 %	25 %	428303583
62	NC_019728	AGCT	2	8	25431	25438	25 %	25 %	25 %	25 %	428303584
63	NC_019728	TCCA	2	8	25570	25577	25 %	25 %	0 %	50 %	428303584
64	NC_019728	ACCA	2	8	26430	26437	50 %	0 %	0 %	50 %	428303585
65	NC_019728	TAAT	2	8	26898	26905	50 %	50 %	0 %	0 %	428303585
66	NC_019728	TATT	2	8	27293	27300	25 %	75 %	0 %	0 %	428303586
67	NC_019728	ATAA	2	8	28508	28515	75 %	25 %	0 %	0 %	428303587
68	NC_019728	AAGT	2	8	28582	28589	50 %	25 %	25 %	0 %	428303587
69	NC_019728	GACC	2	8	28829	28836	25 %	0 %	25 %	50 %	428303588
70	NC_019728	AAGA	2	8	28837	28844	75 %	0 %	25 %	0 %	428303588
71	NC_019728	AATT	2	8	28849	28856	50 %	50 %	0 %	0 %	428303588
72	NC_019728	TCCA	2	8	29589	29596	25 %	25 %	0 %	50 %	428303589
73	NC_019728	GTAG	2	8	29605	29612	25 %	25 %	50 %	0 %	428303589
74	NC_019728	TCGC	2	8	29763	29770	0 %	25 %	25 %	50 %	428303590
75	NC_019728	TTCG	2	8	29783	29790	0 %	50 %	25 %	25 %	428303590
76	NC_019728	AAAT	2	8	29797	29804	75 %	25 %	0 %	0 %	428303590
77	NC_019728	TTAA	2	8	29958	29965	50 %	50 %	0 %	0 %	428303590
78	NC_019728	AATG	2	8	30557	30564	50 %	25 %	25 %	0 %	428303591
79	NC_019728	CCTA	2	8	30582	30589	25 %	25 %	0 %	50 %	428303591
80	NC_019728	GTAA	2	8	31025	31032	50 %	25 %	25 %	0 %	428303591
81	NC_019728	TACT	2	8	32288	32295	25 %	50 %	0 %	25 %	428303594
82	NC_019728	CAAT	2	8	33382	33389	50 %	25 %	0 %	25 %	428303595
83	NC_019728	TTGA	2	8	34352	34359	25 %	50 %	25 %	0 %	428303595
84	NC_019728	TAAA	2	8	34768	34775	75 %	25 %	0 %	0 %	428303595
85	NC_019728	GTTT	2	8	34945	34952	0 %	75 %	25 %	0 %	428303596
86	NC_019728	GTTT	2	8	35010	35017	0 %	75 %	25 %	0 %	428303596
87	NC_019728	GTTA	2	8	35174	35181	25 %	50 %	25 %	0 %	428303596
88	NC_019728	ATTA	2	8	35186	35193	50 %	50 %	0 %	0 %	428303596
89	NC_019728	AACT	2	8	35284	35291	50 %	25 %	0 %	25 %	428303596
90	NC_019728	TTCT	2	8	35957	35964	0 %	75 %	0 %	25 %	428303597
91	NC_019728	TTGA	2	8	36620	36627	25 %	50 %	25 %	0 %	428303598
92	NC_019728	ACTG	2	8	36738	36745	25 %	25 %	25 %	25 %	428303598
93	NC_019728	TGCT	2	8	37280	37287	0 %	50 %	25 %	25 %	428303599
94	NC_019728	ACCC	2	8	37368	37375	25 %	0 %	0 %	75 %	428303599
95	NC_019728	AAAT	2	8	39375	39382	75 %	25 %	0 %	0 %	428303601
96	NC_019728	AAAG	2	8	40364	40371	75 %	0 %	25 %	0 %	428303602
97	NC_019728	GCTT	2	8	40608	40615	0 %	50 %	25 %	25 %	428303602
98	NC_019728	TATG	2	8	40616	40623	25 %	50 %	25 %	0 %	428303602
99	NC_019728	ATCG	2	8	41081	41088	25 %	25 %	25 %	25 %	428303602
100	NC_019728	TGGA	2	8	41754	41761	25 %	25 %	50 %	0 %	428303602
101	NC_019728	GCTG	2	8	42599	42606	0 %	25 %	50 %	25 %	428303603
102	NC_019728	CTTA	2	8	42679	42686	25 %	50 %	0 %	25 %	428303603
103	NC_019728	TATG	2	8	42840	42847	25 %	50 %	25 %	0 %	428303603
104	NC_019728	GATG	2	8	43520	43527	25 %	25 %	50 %	0 %	428303604
105	NC_019728	GCTT	2	8	43746	43753	0 %	50 %	25 %	25 %	428303605
106	NC_019728	ATTG	2	8	44775	44782	25 %	50 %	25 %	0 %	428303605
107	NC_019728	TCGT	2	8	45048	45055	0 %	50 %	25 %	25 %	428303605
108	NC_019728	GAAT	2	8	45128	45135	50 %	25 %	25 %	0 %	428303605
109	NC_019728	AGCC	2	8	45421	45428	25 %	0 %	25 %	50 %	428303606
110	NC_019728	TGGC	2	8	45475	45482	0 %	25 %	50 %	25 %	428303606
111	NC_019728	AAAT	2	8	46478	46485	75 %	25 %	0 %	0 %	428303607
112	NC_019728	GCAA	2	8	47028	47035	50 %	0 %	25 %	25 %	428303608
113	NC_019728	ACAA	2	8	47039	47046	75 %	0 %	0 %	25 %	428303608
114	NC_019728	AAAC	2	8	47086	47093	75 %	0 %	0 %	25 %	428303608
115	NC_019728	GTAA	2	8	47794	47801	50 %	25 %	25 %	0 %	428303608
116	NC_019728	CTAT	2	8	48073	48080	25 %	50 %	0 %	25 %	428303609
117	NC_019728	GAAG	2	8	48207	48214	50 %	0 %	50 %	0 %	428303609
118	NC_019728	GGTT	2	8	49659	49666	0 %	50 %	50 %	0 %	428303610
119	NC_019728	AATG	2	8	49794	49801	50 %	25 %	25 %	0 %	428303610
120	NC_019728	AAAT	2	8	50348	50355	75 %	25 %	0 %	0 %	428303610
121	NC_019728	AAGA	2	8	52313	52320	75 %	0 %	25 %	0 %	428303612
122	NC_019728	TTAT	2	8	53550	53557	25 %	75 %	0 %	0 %	428303613
123	NC_019728	CAAC	2	8	53596	53603	50 %	0 %	0 %	50 %	428303613
124	NC_019728	AGTC	2	8	53758	53765	25 %	25 %	25 %	25 %	428303613
125	NC_019728	AATT	2	8	53925	53932	50 %	50 %	0 %	0 %	428303613
126	NC_019728	TTGG	2	8	54124	54131	0 %	50 %	50 %	0 %	428303613
127	NC_019728	CAAC	2	8	54233	54240	50 %	0 %	0 %	50 %	428303614
128	NC_019728	ATCT	2	8	54466	54473	25 %	50 %	0 %	25 %	428303614
129	NC_019728	GCAA	2	8	54479	54486	50 %	0 %	25 %	25 %	428303614
130	NC_019728	ACCA	2	8	54557	54564	50 %	0 %	0 %	50 %	428303614
131	NC_019728	CAAT	2	8	54653	54660	50 %	25 %	0 %	25 %	428303614
132	NC_019728	TTTG	2	8	55917	55924	0 %	75 %	25 %	0 %	428303615
133	NC_019728	TGGT	2	8	56289	56296	0 %	50 %	50 %	0 %	428303615

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.