MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	ATG	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019728	ACA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303568
3	NC_019728	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303568
4	NC_019728	CAG	2	6	421	426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303568
5	NC_019728	GTT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303568
6	NC_019728	ATG	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303568
7	NC_019728	TGG	2	6	825	830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303568
8	NC_019728	GAA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303568
9	NC_019728	AAG	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303568
10	NC_019728	AAC	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019728	ATG	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
12	NC_019728	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303569
13	NC_019728	TGG	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303569
14	NC_019728	ATG	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
15	NC_019728	AAG	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303569
16	NC_019728	CTG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303569
17	NC_019728	AGA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303569
18	NC_019728	TGA	3	9	1580	1588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
19	NC_019728	ATT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303569
20	NC_019728	CTG	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303569
21	NC_019728	TAA	3	9	1640	1648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303569
22	NC_019728	AGT	2	6	1677	1682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
23	NC_019728	GCA	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303569
24	NC_019728	CTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303569
25	NC_019728	ACT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303569
26	NC_019728	GGA	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303569
27	NC_019728	TCT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303569
28	NC_019728	CTT	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303569
29	NC_019728	AAT	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303569
30	NC_019728	GAT	3	9	2127	2135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303569
31	NC_019728	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303570
32	NC_019728	ACT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303570
33	NC_019728	CAA	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303570
34	NC_019728	CAG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
35	NC_019728	CAG	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
36	NC_019728	GCA	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
37	NC_019728	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303570
38	NC_019728	AGC	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
39	NC_019728	TGG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303570
40	NC_019728	AGC	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303570
41	NC_019728	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303570
42	NC_019728	ATT	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303570
43	NC_019728	GAA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
44	NC_019728	AAG	2	6	3716	3721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
45	NC_019728	TGA	2	6	3909	3914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303571
46	NC_019728	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303571
47	NC_019728	TGT	2	6	4052	4057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303571
48	NC_019728	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
49	NC_019728	CGA	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303571
50	NC_019728	GTC	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303571
51	NC_019728	ATC	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303571
52	NC_019728	TTA	2	6	4252	4257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303571
53	NC_019728	CAA	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303571
54	NC_019728	GAA	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303571
55	NC_019728	TGA	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
56	NC_019728	TAT	2	6	4455	4460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303572
57	NC_019728	AAC	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303572
58	NC_019728	AGA	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
59	NC_019728	CTG	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303572
60	NC_019728	GCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303572
61	NC_019728	AGA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
62	NC_019728	CAA	2	6	4956	4961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303572
63	NC_019728	CAA	2	6	4996	5001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303572
64	NC_019728	TGC	2	6	5032	5037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303572
65	NC_019728	TGA	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
66	NC_019728	AAG	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
67	NC_019728	AGA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
68	NC_019728	TGA	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
69	NC_019728	AGA	2	6	5215	5220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
70	NC_019728	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
71	NC_019728	TAA	2	6	5392	5397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303572
72	NC_019728	ATA	2	6	5411	5416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303572
73	NC_019728	TGA	2	6	5584	5589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303572
74	NC_019728	GAA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
75	NC_019728	GAA	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303572
76	NC_019728	TCG	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303572
77	NC_019728	TAA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019728	TTA	2	6	5784	5789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019728	CAT	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303573
80	NC_019728	TGT	2	6	6017	6022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303573
81	NC_019728	AGA	2	6	6062	6067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303573
82	NC_019728	TGT	3	9	6074	6082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303573
83	NC_019728	ATA	2	6	6279	6284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303573
84	NC_019728	ATT	2	6	6310	6315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303573
85	NC_019728	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303573
86	NC_019728	TCT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303573
87	NC_019728	TCA	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303573
88	NC_019728	TTA	2	6	6812	6817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303574
89	NC_019728	CAT	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303574
90	NC_019728	TCA	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303574
91	NC_019728	TTC	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303574
92	NC_019728	GTT	2	6	7247	7252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303574
93	NC_019728	ACA	2	6	7278	7283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303574
94	NC_019728	TTG	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303574
95	NC_019728	ATC	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303574
96	NC_019728	AAG	2	6	7511	7516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303574
97	NC_019728	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303574
98	NC_019728	TGA	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303574
99	NC_019728	TTC	2	6	7714	7719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303574
100	NC_019728	CTT	2	6	7743	7748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303574
101	NC_019728	CGC	2	6	7757	7762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303574
102	NC_019728	AAT	2	6	7816	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303574
103	NC_019728	TCG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303574
104	NC_019728	CCA	2	6	8001	8006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303574
105	NC_019728	CAA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303574
106	NC_019728	CGC	2	6	8039	8044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303574
107	NC_019728	GAG	2	6	8136	8141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303574
108	NC_019728	TGC	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303574
109	NC_019728	CTT	2	6	8211	8216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303574
110	NC_019728	CAG	2	6	8524	8529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303574
111	NC_019728	TTC	2	6	8569	8574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303574
112	NC_019728	ATT	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303574
113	NC_019728	AAT	2	6	8650	8655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303574
114	NC_019728	TTG	2	6	8671	8676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303574
115	NC_019728	TCA	2	6	8781	8786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303574
116	NC_019728	GAG	3	9	8799	8807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303574
117	NC_019728	CAG	2	6	8820	8825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303574
118	NC_019728	CAT	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303574
119	NC_019728	GGT	2	6	8915	8920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303574
120	NC_019728	CGA	2	6	8939	8944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303574
121	NC_019728	AGC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303574
122	NC_019728	AGA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303574
123	NC_019728	GCA	3	9	9066	9074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303574
124	NC_019728	ATG	2	6	9119	9124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303574
125	NC_019728	TGT	3	9	9237	9245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303575
126	NC_019728	ATC	2	6	9506	9511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303575
127	NC_019728	TCT	2	6	9645	9650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303575
128	NC_019728	CTG	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303575
129	NC_019728	CGT	2	6	9701	9706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303575
130	NC_019728	GAC	2	6	9711	9716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303575
131	NC_019728	AAT	2	6	9787	9792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303575
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