MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	A	6	6	176	181	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
2	NC_019728	G	7	7	359	365	0 %	0 %	100 %	0 %	428303568
3	NC_019728	T	6	6	443	448	0 %	100 %	0 %	0 %	428303568
4	NC_019728	A	6	6	483	488	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
5	NC_019728	A	6	6	528	533	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
6	NC_019728	T	7	7	3227	3233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019728	A	8	8	3244	3251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019728	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	428303571
9	NC_019728	A	7	7	3919	3925	100 %	0 %	0 %	0 %	428303571
10	NC_019728	T	6	6	4165	4170	0 %	100 %	0 %	0 %	428303571
11	NC_019728	A	6	6	4535	4540	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
12	NC_019728	A	8	8	4861	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
13	NC_019728	A	8	8	5443	5450	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
14	NC_019728	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
15	NC_019728	A	6	6	5561	5566	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
16	NC_019728	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
17	NC_019728	T	6	6	6046	6051	0 %	100 %	0 %	0 %	428303573
18	NC_019728	T	6	6	7120	7125	0 %	100 %	0 %	0 %	428303574
19	NC_019728	T	6	6	8238	8243	0 %	100 %	0 %	0 %	428303574
20	NC_019728	T	7	7	8865	8871	0 %	100 %	0 %	0 %	428303574
21	NC_019728	T	7	7	9226	9232	0 %	100 %	0 %	0 %	428303575
22	NC_019728	T	6	6	9721	9726	0 %	100 %	0 %	0 %	428303575
23	NC_019728	T	6	6	9764	9769	0 %	100 %	0 %	0 %	428303575
24	NC_019728	A	6	6	10860	10865	100 %	0 %	0 %	0 %	428303576
25	NC_019728	T	6	6	11140	11145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019728	A	6	6	11308	11313	100 %	0 %	0 %	0 %	428303577
27	NC_019728	T	7	7	11903	11909	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
28	NC_019728	T	7	7	12211	12217	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
29	NC_019728	T	6	6	12601	12606	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
30	NC_019728	A	6	6	13238	13243	100 %	0 %	0 %	0 %	428303578
31	NC_019728	T	7	7	13338	13344	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
32	NC_019728	T	6	6	14095	14100	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
33	NC_019728	T	7	7	14610	14616	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
34	NC_019728	A	6	6	15622	15627	100 %	0 %	0 %	0 %	428303578
35	NC_019728	T	7	7	16548	16554	0 %	100 %	0 %	0 %	428303579
36	NC_019728	A	6	6	16603	16608	100 %	0 %	0 %	0 %	428303579
37	NC_019728	A	6	6	17029	17034	100 %	0 %	0 %	0 %	428303579
38	NC_019728	A	7	7	17586	17592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019728	T	6	6	17843	17848	0 %	100 %	0 %	0 %	428303580
40	NC_019728	T	7	7	18807	18813	0 %	100 %	0 %	0 %	428303580
41	NC_019728	T	6	6	18834	18839	0 %	100 %	0 %	0 %	428303580
42	NC_019728	T	7	7	19171	19177	0 %	100 %	0 %	0 %	428303581
43	NC_019728	T	6	6	19578	19583	0 %	100 %	0 %	0 %	428303581
44	NC_019728	T	7	7	19812	19818	0 %	100 %	0 %	0 %	428303581
45	NC_019728	T	6	6	20761	20766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019728	A	6	6	22043	22048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019728	T	7	7	22556	22562	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
48	NC_019728	A	6	6	22670	22675	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
49	NC_019728	A	6	6	22857	22862	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
50	NC_019728	T	6	6	23144	23149	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
51	NC_019728	T	6	6	23223	23228	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
52	NC_019728	T	6	6	23319	23324	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
53	NC_019728	T	6	6	23383	23388	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
54	NC_019728	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
55	NC_019728	A	7	7	23468	23474	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
56	NC_019728	T	7	7	23509	23515	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
57	NC_019728	T	7	7	23987	23993	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
58	NC_019728	T	8	8	24067	24074	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
59	NC_019728	A	6	6	24267	24272	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
60	NC_019728	A	6	6	24386	24391	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
61	NC_019728	A	6	6	24808	24813	100 %	0 %	0 %	0 %	428303583
62	NC_019728	T	6	6	25239	25244	0 %	100 %	0 %	0 %	428303583
63	NC_019728	A	6	6	25632	25637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019728	A	7	7	25657	25663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019728	T	6	6	25784	25789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019728	T	6	6	25805	25810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019728	A	6	6	25872	25877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019728	C	6	6	26238	26243	0 %	0 %	0 %	100 %	428303585
69	NC_019728	C	7	7	26444	26450	0 %	0 %	0 %	100 %	428303585
70	NC_019728	A	6	6	26562	26567	100 %	0 %	0 %	0 %	428303585
71	NC_019728	A	6	6	26976	26981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019728	T	6	6	27831	27836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019728	A	6	6	28494	28499	100 %	0 %	0 %	0 %	428303587
74	NC_019728	T	8	8	28722	28729	0 %	100 %	0 %	0 %	428303587
75	NC_019728	T	6	6	29209	29214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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77	NC_019728	A	6	6	29662	29667	100 %	0 %	0 %	0 %	428303589
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81	NC_019728	A	7	7	32031	32037	100 %	0 %	0 %	0 %	428303593
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83	NC_019728	T	6	6	32692	32697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019728	T	6	6	33043	33048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019728	A	6	6	33123	33128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019728	A	8	8	33159	33166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_019728	T	8	8	37761	37768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019728	A	6	6	37972	37977	100 %	0 %	0 %	0 %	428303600
95	NC_019728	A	7	7	38340	38346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019728	A	6	6	38999	39004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019728	T	6	6	39101	39106	0 %	100 %	0 %	0 %	428303601
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99	NC_019728	A	8	8	39495	39502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019728	T	6	6	39615	39620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_019728	A	6	6	43012	43017	100 %	0 %	0 %	0 %	428303603
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105	NC_019728	T	6	6	45691	45696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019728	A	6	6	45698	45703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019728	A	8	8	45754	45761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019728	A	7	7	45856	45862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019728	A	7	7	46146	46152	100 %	0 %	0 %	0 %	428303607
110	NC_019728	A	6	6	46902	46907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019728	A	6	6	47632	47637	100 %	0 %	0 %	0 %	428303608
112	NC_019728	T	6	6	47916	47921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019728	T	6	6	47997	48002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019728	T	6	6	48015	48020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019728	A	6	6	48301	48306	100 %	0 %	0 %	0 %	428303609
116	NC_019728	A	6	6	48529	48534	100 %	0 %	0 %	0 %	428303609
117	NC_019728	T	6	6	49117	49122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019728	A	7	7	49225	49231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019728	A	6	6	49774	49779	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
120	NC_019728	A	6	6	50115	50120	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
121	NC_019728	A	6	6	50556	50561	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
122	NC_019728	A	6	6	50648	50653	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
123	NC_019728	A	6	6	50662	50667	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
124	NC_019728	A	6	6	50678	50683	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
125	NC_019728	A	6	6	50892	50897	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
126	NC_019728	A	6	6	51000	51005	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
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128	NC_019728	T	7	7	51664	51670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019728	A	6	6	51836	51841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019728	A	6	6	52248	52253	100 %	0 %	0 %	0 %	428303612
131	NC_019728	A	7	7	52443	52449	100 %	0 %	0 %	0 %	428303612
132	NC_019728	T	7	7	52678	52684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019728	G	6	6	53287	53292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019728	A	6	6	54582	54587	100 %	0 %	0 %	0 %	428303614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.