MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	A	6	6	176	181	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
2	NC_019728	G	7	7	359	365	0 %	0 %	100 %	0 %	428303568
3	NC_019728	T	6	6	443	448	0 %	100 %	0 %	0 %	428303568
4	NC_019728	A	6	6	483	488	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
5	NC_019728	A	6	6	528	533	100 %	0 %	0 %	0 %	428303568
6	NC_019728	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	428303571
7	NC_019728	A	7	7	3919	3925	100 %	0 %	0 %	0 %	428303571
8	NC_019728	T	6	6	4165	4170	0 %	100 %	0 %	0 %	428303571
9	NC_019728	A	6	6	4535	4540	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
10	NC_019728	A	8	8	4861	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
11	NC_019728	A	8	8	5443	5450	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
12	NC_019728	A	6	6	5552	5557	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
13	NC_019728	A	6	6	5561	5566	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
14	NC_019728	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	428303572
15	NC_019728	T	6	6	6046	6051	0 %	100 %	0 %	0 %	428303573
16	NC_019728	T	6	6	7120	7125	0 %	100 %	0 %	0 %	428303574
17	NC_019728	T	6	6	8238	8243	0 %	100 %	0 %	0 %	428303574
18	NC_019728	T	7	7	8865	8871	0 %	100 %	0 %	0 %	428303574
19	NC_019728	T	7	7	9226	9232	0 %	100 %	0 %	0 %	428303575
20	NC_019728	T	6	6	9721	9726	0 %	100 %	0 %	0 %	428303575
21	NC_019728	T	6	6	9764	9769	0 %	100 %	0 %	0 %	428303575
22	NC_019728	A	6	6	10860	10865	100 %	0 %	0 %	0 %	428303576
23	NC_019728	A	6	6	11308	11313	100 %	0 %	0 %	0 %	428303577
24	NC_019728	T	7	7	11903	11909	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
25	NC_019728	T	7	7	12211	12217	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
26	NC_019728	T	6	6	12601	12606	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
27	NC_019728	A	6	6	13238	13243	100 %	0 %	0 %	0 %	428303578
28	NC_019728	T	7	7	13338	13344	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
29	NC_019728	T	6	6	14095	14100	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
30	NC_019728	T	7	7	14610	14616	0 %	100 %	0 %	0 %	428303578
31	NC_019728	A	6	6	15622	15627	100 %	0 %	0 %	0 %	428303578
32	NC_019728	T	7	7	16548	16554	0 %	100 %	0 %	0 %	428303579
33	NC_019728	A	6	6	16603	16608	100 %	0 %	0 %	0 %	428303579
34	NC_019728	A	6	6	17029	17034	100 %	0 %	0 %	0 %	428303579
35	NC_019728	T	6	6	17843	17848	0 %	100 %	0 %	0 %	428303580
36	NC_019728	T	7	7	18807	18813	0 %	100 %	0 %	0 %	428303580
37	NC_019728	T	6	6	18834	18839	0 %	100 %	0 %	0 %	428303580
38	NC_019728	T	7	7	19171	19177	0 %	100 %	0 %	0 %	428303581
39	NC_019728	T	6	6	19578	19583	0 %	100 %	0 %	0 %	428303581
40	NC_019728	T	7	7	19812	19818	0 %	100 %	0 %	0 %	428303581
41	NC_019728	T	7	7	22556	22562	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
42	NC_019728	A	6	6	22670	22675	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
43	NC_019728	A	6	6	22857	22862	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
44	NC_019728	T	6	6	23144	23149	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
45	NC_019728	T	6	6	23223	23228	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
46	NC_019728	T	6	6	23319	23324	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
47	NC_019728	T	6	6	23383	23388	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
48	NC_019728	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
49	NC_019728	A	7	7	23468	23474	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
50	NC_019728	T	7	7	23509	23515	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
51	NC_019728	T	7	7	23987	23993	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
52	NC_019728	T	8	8	24067	24074	0 %	100 %	0 %	0 %	428303582
53	NC_019728	A	6	6	24267	24272	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
54	NC_019728	A	6	6	24386	24391	100 %	0 %	0 %	0 %	428303582
55	NC_019728	A	6	6	24808	24813	100 %	0 %	0 %	0 %	428303583
56	NC_019728	T	6	6	25239	25244	0 %	100 %	0 %	0 %	428303583
57	NC_019728	C	6	6	26238	26243	0 %	0 %	0 %	100 %	428303585
58	NC_019728	C	7	7	26444	26450	0 %	0 %	0 %	100 %	428303585
59	NC_019728	A	6	6	26562	26567	100 %	0 %	0 %	0 %	428303585
60	NC_019728	A	6	6	28494	28499	100 %	0 %	0 %	0 %	428303587
61	NC_019728	T	8	8	28722	28729	0 %	100 %	0 %	0 %	428303587
62	NC_019728	T	6	6	29635	29640	0 %	100 %	0 %	0 %	428303589
63	NC_019728	A	6	6	29662	29667	100 %	0 %	0 %	0 %	428303589
64	NC_019728	A	6	6	30046	30051	100 %	0 %	0 %	0 %	428303590
65	NC_019728	A	6	6	31557	31562	100 %	0 %	0 %	0 %	428303592
66	NC_019728	T	6	6	32013	32018	0 %	100 %	0 %	0 %	428303593
67	NC_019728	A	7	7	32031	32037	100 %	0 %	0 %	0 %	428303593
68	NC_019728	T	8	8	32109	32116	0 %	100 %	0 %	0 %	428303593
69	NC_019728	T	6	6	34825	34830	0 %	100 %	0 %	0 %	428303595
70	NC_019728	T	6	6	35138	35143	0 %	100 %	0 %	0 %	428303596
71	NC_019728	T	7	7	35328	35334	0 %	100 %	0 %	0 %	428303596
72	NC_019728	T	6	6	36266	36271	0 %	100 %	0 %	0 %	428303597
73	NC_019728	T	7	7	37193	37199	0 %	100 %	0 %	0 %	428303598
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76	NC_019728	T	6	6	39101	39106	0 %	100 %	0 %	0 %	428303601
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78	NC_019728	A	8	8	42686	42693	100 %	0 %	0 %	0 %	428303603
79	NC_019728	A	6	6	43012	43017	100 %	0 %	0 %	0 %	428303603
80	NC_019728	A	7	7	46146	46152	100 %	0 %	0 %	0 %	428303607
81	NC_019728	A	6	6	47632	47637	100 %	0 %	0 %	0 %	428303608
82	NC_019728	A	6	6	48301	48306	100 %	0 %	0 %	0 %	428303609
83	NC_019728	A	6	6	48529	48534	100 %	0 %	0 %	0 %	428303609
84	NC_019728	A	6	6	49774	49779	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
85	NC_019728	A	6	6	50115	50120	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
86	NC_019728	A	6	6	50556	50561	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
87	NC_019728	A	6	6	50648	50653	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
88	NC_019728	A	6	6	50662	50667	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
89	NC_019728	A	6	6	50678	50683	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
90	NC_019728	A	6	6	50892	50897	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
91	NC_019728	A	6	6	51000	51005	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
92	NC_019728	A	6	6	52248	52253	100 %	0 %	0 %	0 %	428303612
93	NC_019728	A	7	7	52443	52449	100 %	0 %	0 %	0 %	428303612
94	NC_019728	A	6	6	54582	54587	100 %	0 %	0 %	0 %	428303614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.