MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019727	ACGGGA	2	12	3742	3753	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428303475
2	NC_019727	TTTGGG	2	12	9277	9288	0 %	50 %	50 %	0 %	428303480
3	NC_019727	GTATCA	2	12	13819	13830	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428303481
4	NC_019727	AAACTT	2	12	16309	16320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428303482
5	NC_019727	AAGCAA	2	12	21405	21416	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428303488
6	NC_019727	TAACGC	2	12	21673	21684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303488
7	NC_019727	TCAACT	2	12	22024	22035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303489
8	NC_019727	ATTAAT	2	12	22506	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	428303489
9	NC_019727	TTTATT	2	12	25534	25545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428303490
10	NC_019727	AAAACC	2	12	25684	25695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303490
11	NC_019727	AGATGA	2	12	27622	27633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019727	ATATTT	2	12	27829	27840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019727	GGTATT	2	12	28400	28411	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303493
14	NC_019727	AACCAG	2	12	31192	31203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428303498
15	NC_019727	GAACGA	2	12	31214	31225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428303498
16	NC_019727	CAACCC	2	12	31327	31338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303498
17	NC_019727	GATGTT	2	12	32064	32075	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303499
18	NC_019727	GTTTTG	2	12	32586	32597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019727	ACAATA	2	12	40382	40393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428303504
20	NC_019727	ACCTTT	2	12	40840	40851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428303505
21	NC_019727	AAAATC	2	12	43163	43174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428303506
22	NC_019727	CTTTCC	2	12	45118	45129	0 %	50 %	0 %	50 %	428303508
23	NC_019727	TTTTAT	2	12	49337	49348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019727	AAAATC	2	12	49683	49694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019727	GCGTTC	2	12	54837	54848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303515
26	NC_019727	GAAATC	2	12	58125	58136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428303517
27	NC_019727	CATATA	2	12	59374	59385	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019727	CATAGC	2	12	63186	63197	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019727	AGCTAG	2	12	64927	64938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428303520
30	NC_019727	TATTTC	2	12	66730	66741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428303521
31	NC_019727	TCTTTT	2	12	66935	66946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428303521
32	NC_019727	AATTCC	2	12	70102	70113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303523
33	NC_019727	AAATGA	2	12	70162	70173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428303523

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.