MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019727	TGCT	2	8	653	660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019727	CAAC	2	8	863	870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019727	ACAA	2	8	1007	1014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019727	GGTT	2	8	4468	4475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019727	ACTT	2	8	5081	5088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019727	CATT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019727	AAGA	2	8	5983	5990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019727	CGAT	2	8	7231	7238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019727	GTGG	2	8	7275	7282	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019727	AATT	2	8	10605	10612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019727	ATTA	2	8	15604	15611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019727	TAGC	2	8	15825	15832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019727	GGCT	2	8	18169	18176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019727	ATTT	2	8	18934	18941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019727	GCAG	2	8	23001	23008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019727	TACT	2	8	23075	23082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019727	GGAG	2	8	26731	26738	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019727	TCGG	2	8	26973	26980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019727	GCTT	2	8	27268	27275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019727	AAGG	2	8	27375	27382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019727	ATAC	2	8	27424	27431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019727	TTTG	2	8	27500	27507	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019727	TAGT	2	8	27579	27586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019727	TCCT	2	8	31634	31641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019727	AAAC	2	8	35457	35464	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019727	GTTA	2	8	35575	35582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019727	TGTT	2	8	42723	42730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019727	ATGA	2	8	42844	42851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019727	TATC	2	8	44914	44921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019727	TCAC	2	8	44966	44973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019727	CGTC	2	8	45913	45920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019727	TGGC	2	8	50146	50153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019727	CTCC	2	8	50276	50283	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019727	ATTT	2	8	50314	50321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019727	TATT	2	8	50340	50347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019727	GTTT	2	8	50428	50435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019727	CTTG	2	8	50493	50500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019727	TATC	2	8	50617	50624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019727	TTTA	2	8	50693	50700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019727	TAAA	2	8	53050	53057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019727	TTGA	2	8	56013	56020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019727	ATAA	2	8	56103	56110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019727	CTTC	2	8	57004	57011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019727	GTGA	2	8	57115	57122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019727	GTTT	2	8	59346	59353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019727	TAAT	2	8	59409	59416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019727	TAAA	2	8	59541	59548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019727	TCTT	2	8	59731	59738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019727	ATTA	2	8	59810	59817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019727	ATTA	2	8	59842	59849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019727	TAAT	2	8	59907	59914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019727	TGAC	2	8	61087	61094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019727	CAAC	2	8	62577	62584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019727	TTGC	2	8	62998	63005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019727	ATGT	2	8	63201	63208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019727	TACA	2	8	63211	63218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019727	TTTA	2	8	63275	63282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019727	TAAA	2	8	63371	63378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019727	TGAA	2	8	66124	66131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019727	ATAA	2	8	66145	66152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019727	TTTA	2	8	68134	68141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019727	TATT	2	8	69134	69141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019727	TTAG	2	8	69159	69166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019727	ATTG	2	8	70372	70379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019727	AGAT	2	8	70439	70446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019727	AGAA	2	8	71959	71966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019727	TTTC	2	8	78350	78357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019727	TAAG	2	8	78620	78627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019727	TAAA	2	8	78707	78714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019727	AATT	2	8	78999	79006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019727	TATT	2	8	79102	79109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019727	TTAT	2	8	79234	79241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019727	AAAG	2	8	79372	79379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019727	AATT	2	8	79612	79619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019727	AGCA	2	8	79966	79973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019727	AAAG	2	8	80119	80126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019727	AACT	2	8	80413	80420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019727	ATTC	2	8	80715	80722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.