MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019727	ATC	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019727	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019727	TAG	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019727	CCA	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_019727	TAA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019727	AAT	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019727	GAT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019727	CAA	2	6	5191	5196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019727	ATT	2	6	7174	7179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019727	ATA	2	6	7260	7265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019727	CTA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019727	AAT	2	6	10146	10151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019727	CCG	2	6	10177	10182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019727	TTA	2	6	10209	10214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019727	CAA	2	6	10233	10238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019727	TGA	2	6	10322	10327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019727	ATC	2	6	10385	10390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019727	GAA	2	6	10394	10399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019727	GAT	2	6	10476	10481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019727	AAG	2	6	10494	10499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019727	TTG	2	6	10509	10514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019727	ACT	2	6	10529	10534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019727	ATT	2	6	10559	10564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019727	ATA	2	6	15439	15444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019727	AAT	2	6	15452	15457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019727	AAT	2	6	15468	15473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019727	ATT	2	6	15521	15526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019727	CAA	2	6	15647	15652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019727	TTC	2	6	15681	15686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019727	ATA	2	6	15702	15707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019727	CAA	2	6	15923	15928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019727	ACT	2	6	17768	17773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019727	GAC	2	6	18157	18162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019727	ATT	2	6	18637	18642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019727	GTT	2	6	18755	18760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019727	ATC	2	6	20018	20023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019727	AGT	2	6	20027	20032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019727	TGT	2	6	20102	20107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019727	CAA	2	6	21935	21940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019727	AAC	2	6	22823	22828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019727	ACC	2	6	22847	22852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019727	AGG	2	6	22868	22873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019727	TAT	2	6	22906	22911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019727	CTT	2	6	23104	23109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019727	ACC	2	6	23123	23128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019727	GTA	2	6	26335	26340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019727	ATT	2	6	26358	26363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019727	TGT	2	6	27064	27069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019727	TGC	2	6	27092	27097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019727	GGC	2	6	27106	27111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019727	TAA	2	6	27140	27145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019727	TTG	2	6	27349	27354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019727	ACG	2	6	27365	27370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019727	TAA	2	6	27641	27646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019727	TAA	2	6	27650	27655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019727	TTA	2	6	27667	27672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019727	CAA	2	6	28158	28163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019727	GAT	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019727	CTT	2	6	28194	28199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019727	ATT	2	6	28482	28487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019727	ATA	2	6	28552	28557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019727	AGG	2	6	28654	28659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019727	TTA	2	6	30166	30171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019727	CAA	2	6	30210	30215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019727	AGC	2	6	30551	30556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019727	CGC	2	6	30700	30705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019727	ACA	2	6	30719	30724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019727	TGA	2	6	31494	31499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019727	AAG	2	6	31650	31655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019727	CAA	2	6	31765	31770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019727	CAA	2	6	31804	31809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019727	TCA	2	6	31811	31816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019727	AGG	2	6	31867	31872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019727	ATT	2	6	32899	32904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019727	TAA	2	6	32923	32928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019727	ACT	2	6	32960	32965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019727	ATC	2	6	32984	32989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019727	ATA	2	6	35441	35446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019727	AGC	2	6	35511	35516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019727	ATT	2	6	35590	35595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019727	ATT	2	6	35713	35718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019727	ATA	2	6	35741	35746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019727	ATC	2	6	36668	36673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019727	TAT	2	6	36759	36764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019727	TAT	2	6	36839	36844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019727	CTC	2	6	36866	36871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019727	ATC	2	6	36876	36881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019727	AGT	2	6	36959	36964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019727	TGT	2	6	36970	36975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019727	CTG	2	6	37028	37033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019727	CAT	2	6	42783	42788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019727	CTT	3	9	42866	42874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019727	ATC	2	6	43535	43540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019727	TCT	3	9	44863	44871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019727	ATT	2	6	44978	44983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019727	ACG	2	6	45865	45870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019727	AGC	2	6	46038	46043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019727	AGG	2	6	47813	47818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019727	CTT	2	6	49426	49431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019727	AAT	3	9	49500	49508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019727	ATT	2	6	49511	49516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019727	ATA	3	9	49522	49530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019727	TTA	2	6	49701	49706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019727	TAT	2	6	49756	49761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019727	GTC	2	6	50170	50175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019727	GTT	2	6	50208	50213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019727	CAA	2	6	50236	50241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019727	GAT	2	6	50287	50292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019727	TCA	2	6	50297	50302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019727	GTT	2	6	50334	50339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019727	TTC	2	6	50348	50353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019727	ATT	2	6	50475	50480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019727	AGT	2	6	50505	50510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019727	TCT	2	6	50586	50591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019727	GCT	2	6	50631	50636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019727	TTC	2	6	50660	50665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019727	TAA	2	6	51279	51284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019727	TTC	2	6	53030	53035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019727	AAT	2	6	55060	55065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019727	CTA	2	6	55088	55093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019727	GAA	2	6	56151	56156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019727	TAC	2	6	56184	56189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019727	GAC	2	6	56190	56195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019727	AAT	2	6	56356	56361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019727	ACA	2	6	56425	56430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019727	GAC	2	6	56496	56501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019727	AAC	2	6	56801	56806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019727	ACA	2	6	56823	56828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019727	CAA	2	6	56911	56916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019727	TGT	2	6	56977	56982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019727	TCA	2	6	57096	57101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019727	ACT	2	6	57107	57112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019727	AAT	2	6	57129	57134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019727	TGC	3	9	57205	57213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019727	CTT	2	6	57459	57464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019727	GAA	2	6	59294	59299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019727	AAT	2	6	59307	59312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019727	TTC	2	6	59460	59465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019727	TGA	2	6	59521	59526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019727	ATA	2	6	59592	59597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019727	AAT	2	6	59639	59644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.