MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019727	GT	3	6	1880	1885	0 %	50 %	50 %	0 %	428303474
2	NC_019727	AG	3	6	3449	3454	50 %	0 %	50 %	0 %	428303475
3	NC_019727	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	428303475
4	NC_019727	CG	3	6	4330	4335	0 %	0 %	50 %	50 %	428303475
5	NC_019727	AT	3	6	5009	5014	50 %	50 %	0 %	0 %	428303476
6	NC_019727	TA	3	6	5098	5103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019727	CA	3	6	5621	5626	50 %	0 %	0 %	50 %	428303477
8	NC_019727	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	428303477
9	NC_019727	AC	3	6	6015	6020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019727	AT	3	6	11260	11265	50 %	50 %	0 %	0 %	428303481
11	NC_019727	TA	3	6	11990	11995	50 %	50 %	0 %	0 %	428303481
12	NC_019727	TC	3	6	12321	12326	0 %	50 %	0 %	50 %	428303481
13	NC_019727	CA	3	6	13634	13639	50 %	0 %	0 %	50 %	428303481
14	NC_019727	AT	3	6	14016	14021	50 %	50 %	0 %	0 %	428303481
15	NC_019727	AT	3	6	14621	14626	50 %	50 %	0 %	0 %	428303481
16	NC_019727	TC	3	6	15059	15064	0 %	50 %	0 %	50 %	428303481
17	NC_019727	TA	3	6	15273	15278	50 %	50 %	0 %	0 %	428303481
18	NC_019727	AT	3	6	15582	15587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019727	AT	3	6	15655	15660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019727	GA	3	6	18653	18658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019727	TA	3	6	19468	19473	50 %	50 %	0 %	0 %	428303487
22	NC_019727	TA	4	8	20076	20083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019727	GA	3	6	21768	21773	50 %	0 %	50 %	0 %	428303488
24	NC_019727	TA	3	6	23323	23328	50 %	50 %	0 %	0 %	428303490
25	NC_019727	TG	3	6	23414	23419	0 %	50 %	50 %	0 %	428303490
26	NC_019727	AT	3	6	24088	24093	50 %	50 %	0 %	0 %	428303490
27	NC_019727	TC	3	6	24119	24124	0 %	50 %	0 %	50 %	428303490
28	NC_019727	CA	3	6	24213	24218	50 %	0 %	0 %	50 %	428303490
29	NC_019727	TC	4	8	26301	26308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019727	TG	3	6	26312	26317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019727	GA	3	6	26326	26331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019727	TG	3	6	26716	26721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019727	CA	3	6	28579	28584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019727	AG	3	6	29120	29125	50 %	0 %	50 %	0 %	428303494
35	NC_019727	TG	3	6	29753	29758	0 %	50 %	50 %	0 %	428303494
36	NC_019727	CA	3	6	29786	29791	50 %	0 %	0 %	50 %	428303494
37	NC_019727	AT	3	6	30275	30280	50 %	50 %	0 %	0 %	428303496
38	NC_019727	TG	3	6	30886	30891	0 %	50 %	50 %	0 %	428303497
39	NC_019727	CT	3	6	32783	32788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019727	GA	3	6	32799	32804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019727	CA	3	6	34112	34117	50 %	0 %	0 %	50 %	428303500
42	NC_019727	AT	3	6	34961	34966	50 %	50 %	0 %	0 %	428303500
43	NC_019727	GA	3	6	35877	35882	50 %	0 %	50 %	0 %	428303501
44	NC_019727	CT	3	6	39662	39667	0 %	50 %	0 %	50 %	428303503
45	NC_019727	TA	3	6	39955	39960	50 %	50 %	0 %	0 %	428303503
46	NC_019727	GA	3	6	40587	40592	50 %	0 %	50 %	0 %	428303505
47	NC_019727	GA	3	6	41420	41425	50 %	0 %	50 %	0 %	428303505
48	NC_019727	CT	3	6	41515	41520	0 %	50 %	0 %	50 %	428303505
49	NC_019727	CT	3	6	41591	41596	0 %	50 %	0 %	50 %	428303505
50	NC_019727	CT	3	6	41990	41995	0 %	50 %	0 %	50 %	428303505
51	NC_019727	AT	3	6	42081	42086	50 %	50 %	0 %	0 %	428303505
52	NC_019727	TA	3	6	42126	42131	50 %	50 %	0 %	0 %	428303505
53	NC_019727	CA	3	6	42162	42167	50 %	0 %	0 %	50 %	428303505
54	NC_019727	AC	3	6	42747	42752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019727	TC	3	6	43818	43823	0 %	50 %	0 %	50 %	428303507
56	NC_019727	GT	3	6	43886	43891	0 %	50 %	50 %	0 %	428303507
57	NC_019727	AT	3	6	45342	45347	50 %	50 %	0 %	0 %	428303508
58	NC_019727	GA	3	6	45769	45774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019727	AC	3	6	46314	46319	50 %	0 %	0 %	50 %	428303509
60	NC_019727	TA	3	6	47256	47261	50 %	50 %	0 %	0 %	428303510
61	NC_019727	TA	3	6	49439	49444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019727	AT	3	6	49446	49451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019727	AT	3	6	50324	50329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019727	TC	3	6	50352	50357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019727	TA	3	6	50467	50472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019727	TA	3	6	51721	51726	50 %	50 %	0 %	0 %	428303514
67	NC_019727	AC	3	6	52475	52480	50 %	0 %	0 %	50 %	428303514
68	NC_019727	AC	3	6	53693	53698	50 %	0 %	0 %	50 %	428303515
69	NC_019727	TA	4	8	53976	53983	50 %	50 %	0 %	0 %	428303515
70	NC_019727	TA	3	6	54037	54042	50 %	50 %	0 %	0 %	428303515
71	NC_019727	AT	3	6	54163	54168	50 %	50 %	0 %	0 %	428303515
72	NC_019727	AC	3	6	54218	54223	50 %	0 %	0 %	50 %	428303515
73	NC_019727	TC	3	6	54549	54554	0 %	50 %	0 %	50 %	428303515
74	NC_019727	CT	3	6	55381	55386	0 %	50 %	0 %	50 %	428303516
75	NC_019727	TC	3	6	56878	56883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019727	CT	3	6	58905	58910	0 %	50 %	0 %	50 %	428303517
77	NC_019727	TA	3	6	59848	59853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019727	TC	4	8	59975	59982	0 %	50 %	0 %	50 %	428303518
79	NC_019727	CT	3	6	60845	60850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019727	TC	3	6	60948	60953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019727	AT	3	6	61031	61036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019727	GA	3	6	61340	61345	50 %	0 %	50 %	0 %	428303519
83	NC_019727	AG	3	6	61560	61565	50 %	0 %	50 %	0 %	428303519
84	NC_019727	TG	3	6	61696	61701	0 %	50 %	50 %	0 %	428303519
85	NC_019727	AC	3	6	62153	62158	50 %	0 %	0 %	50 %	428303519
86	NC_019727	AC	3	6	62801	62806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019727	AG	3	6	63118	63123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019727	AG	3	6	63796	63801	50 %	0 %	50 %	0 %	428303520
89	NC_019727	TC	3	6	64172	64177	0 %	50 %	0 %	50 %	428303520
90	NC_019727	GA	3	6	64629	64634	50 %	0 %	50 %	0 %	428303520
91	NC_019727	AG	3	6	65081	65086	50 %	0 %	50 %	0 %	428303520
92	NC_019727	TA	3	6	65946	65951	50 %	50 %	0 %	0 %	428303520
93	NC_019727	TA	3	6	67251	67256	50 %	50 %	0 %	0 %	428303521
94	NC_019727	TA	3	6	67632	67637	50 %	50 %	0 %	0 %	428303521
95	NC_019727	AT	4	8	68015	68022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019727	AG	3	6	68150	68155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019727	AG	3	6	68434	68439	50 %	0 %	50 %	0 %	428303522
98	NC_019727	AC	3	6	68675	68680	50 %	0 %	0 %	50 %	428303522
99	NC_019727	GA	3	6	68827	68832	50 %	0 %	50 %	0 %	428303522
100	NC_019727	CT	4	8	69180	69187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019727	GA	3	6	69517	69522	50 %	0 %	50 %	0 %	428303523
102	NC_019727	TA	3	6	69680	69685	50 %	50 %	0 %	0 %	428303523
103	NC_019727	AT	6	12	70090	70101	50 %	50 %	0 %	0 %	428303523
104	NC_019727	CA	3	6	70956	70961	50 %	0 %	0 %	50 %	428303524
105	NC_019727	AG	3	6	71787	71792	50 %	0 %	50 %	0 %	428303524
106	NC_019727	AC	3	6	74495	74500	50 %	0 %	0 %	50 %	428303525
107	NC_019727	TC	4	8	74720	74727	0 %	50 %	0 %	50 %	428303525
108	NC_019727	TA	3	6	74883	74888	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
109	NC_019727	GA	3	6	74936	74941	50 %	0 %	50 %	0 %	428303525
110	NC_019727	TA	3	6	75044	75049	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
111	NC_019727	TA	3	6	75278	75283	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
112	NC_019727	TC	4	8	75818	75825	0 %	50 %	0 %	50 %	428303525
113	NC_019727	AT	3	6	76349	76354	50 %	50 %	0 %	0 %	428303525
114	NC_019727	CA	3	6	77042	77047	50 %	0 %	0 %	50 %	428303525
115	NC_019727	CT	3	6	78693	78698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019727	AT	4	8	78826	78833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019727	TA	3	6	79211	79216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019727	TA	3	6	79591	79596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.