MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	TTTAAA	2	12	1893	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019703	AATTTC	2	12	59384	59395	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019703	GCGATC	2	12	81096	81107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019703	GGATAC	2	12	83969	83980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019703	AGAACA	2	12	85033	85044	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019703	GGCCAA	2	12	85723	85734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019703	TCAGCT	2	12	109130	109141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019703	GGGGCG	2	12	124202	124213	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019703	AGGTTA	2	12	160010	160021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019703	ATTACT	2	12	187326	187337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019703	GATTGT	2	12	188582	188593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019703	TTTAAC	2	12	193424	193435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019703	TGCCTG	2	12	221220	221231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019703	TAAGGC	2	12	235774	235785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019703	AAAGCG	2	12	238592	238603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019703	TAAGGC	2	12	255568	255579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019703	AAAGCG	2	12	258390	258401	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019703	AAGAGG	2	12	260849	260860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019703	CTTTGA	2	12	304003	304014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019703	TCAAGA	2	12	372354	372365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019703	GGAGTT	2	12	401927	401938	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019703	TAAGGC	2	12	419947	419958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019703	AAAGCG	2	12	422766	422777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019703	AAGAGG	2	12	425225	425236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019703	CCCAGC	2	12	440898	440909	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019703	GATTGG	2	12	444535	444546	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019703	CAAAAG	2	12	486604	486615	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019703	GCTGGT	2	12	498002	498013	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019703	GAGGCG	2	12	502255	502266	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019703	AAAAAG	2	12	507680	507691	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019703	CTGGCT	2	12	543516	543527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019703	AGGTCA	2	12	545829	545840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019703	GGGGAT	2	12	575680	575691	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019703	TGGGCT	2	12	583031	583042	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019703	CTCAGT	2	12	601957	601968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019703	CCCCTA	2	12	616196	616207	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019703	TGATTT	2	12	662206	662217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019703	CCCTTT	2	12	666366	666377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019703	CTGATT	2	12	668572	668583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019703	TACCAA	2	12	676541	676552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019703	ATCGCG	2	12	729490	729501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019703	GCCCCA	2	12	730476	730487	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019703	CTGTTT	2	12	741947	741958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019703	GCCCTT	2	12	766316	766327	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019703	AACGCT	2	12	808794	808805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019703	GCCAGC	2	12	875629	875640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019703	GGCCCC	2	12	877240	877251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019703	CTCAAT	2	12	898345	898356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019703	TTTTTG	2	12	907581	907592	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019703	GCTGGG	2	12	935844	935855	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019703	CAAGCA	2	12	960596	960607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019703	CGCTGT	2	12	969118	969129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019703	GCGATC	2	12	974022	974033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019703	GATCGC	2	12	1025236	1025247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019703	CGCCTC	2	12	1036580	1036591	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019703	TTAACT	2	12	1053746	1053757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019703	GCGATC	2	12	1073431	1073442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019703	GATCGC	2	12	1170806	1170817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019703	ACGGGT	2	12	1227876	1227887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019703	AGTGAG	2	12	1246427	1246438	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019703	TGGATT	2	12	1255607	1255618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019703	AACCCT	2	12	1301656	1301667	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019703	TGACCC	2	12	1313262	1313273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019703	CCCTCA	2	12	1324683	1324694	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019703	AGAGAT	2	12	1343589	1343600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019703	CTCAAG	2	12	1353050	1353061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019703	GAACTC	2	12	1380436	1380447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019703	AAACTT	2	12	1384410	1384421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019703	CGTTCT	2	12	1489968	1489979	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019703	CCCGTC	2	12	1495320	1495331	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019703	TCAGCA	2	12	1499828	1499839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019703	TCAGCC	2	12	1503850	1503861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019703	TGCGTT	2	12	1511209	1511220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019703	TAAAAG	2	12	1515763	1515774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019703	CAGCCC	2	12	1546972	1546983	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019703	GATTGA	2	12	1576386	1576397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019703	ATTAAG	2	12	1611079	1611090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019703	ACGACT	2	12	1626811	1626822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019703	AATCAA	2	12	1714295	1714306	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019703	TGTTTT	2	12	1716268	1716279	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019703	ATGATT	2	12	1724404	1724415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019703	TTGGGG	2	12	1756745	1756756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019703	AGCGGA	2	12	1777512	1777523	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019703	CCTGAA	2	12	1823481	1823492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019703	CGGAGC	2	12	1825370	1825381	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019703	TTTCTC	2	12	1833594	1833605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019703	TATCCT	2	12	1843934	1843945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019703	AACGGC	2	12	1851460	1851471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019703	CTACAC	2	12	1859344	1859355	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019703	AAAGTC	2	12	1935604	1935615	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019703	CGATCG	2	12	1971883	1971894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019703	TCAATC	2	12	1979529	1979540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019703	AGCGGG	2	12	1983529	1983540	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019703	GCGATC	2	12	1983669	1983680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019703	ACTGGC	2	12	1994089	1994100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019703	AGGGTG	2	12	2018879	2018890	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019703	ATAAAA	2	12	2047175	2047186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019703	CTGCCC	2	12	2062419	2062430	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019703	CTTGGG	2	12	2087761	2087772	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019703	TAATTT	2	12	2088761	2088772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019703	CTTGAT	2	12	2093466	2093477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019703	GCTCTT	2	12	2107730	2107741	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019703	CCTGAG	2	12	2159240	2159251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019703	GAACTT	2	12	2188545	2188556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019703	TTCTCT	2	12	2191302	2191313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019703	GAAGGG	2	12	2258752	2258763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019703	TTTGAA	2	12	2333848	2333859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019703	GAGATA	2	12	2338292	2338303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019703	ACACAA	2	12	2360469	2360480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019703	TGGGGC	2	12	2397261	2397272	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019703	ATACAA	2	12	2417149	2417160	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019703	CGGCTC	2	12	2457996	2458007	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019703	TTTATC	2	12	2458498	2458509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019703	GCCAAA	2	12	2480127	2480138	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019703	CTGGCC	2	12	2511875	2511886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019703	GCGATC	2	12	2560042	2560053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019703	ATGAAG	2	12	2578277	2578288	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019703	TGGGAT	2	12	2614555	2614566	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019703	TTGGTT	2	12	2698431	2698442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019703	TCAAAA	2	12	2701969	2701980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019703	CCTTCT	2	12	2750672	2750683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019703	AGAAGG	2	12	2750694	2750705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019703	CAAAAA	2	12	2765996	2766007	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019703	CCCAGA	2	12	2775405	2775416	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019703	GCAGAA	2	12	2797975	2797986	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019703	TATTTT	2	12	2865788	2865799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019703	TTCAAT	2	12	2865869	2865880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019703	GCGATC	2	12	2998658	2998669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019703	TCTAGG	2	12	3020841	3020852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019703	ATGCCT	2	12	3086235	3086246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019703	TTGACA	2	12	3151309	3151320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019703	GTCAGG	2	12	3164553	3164564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019703	GGCTTT	2	12	3165725	3165736	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_019703	CTTTTA	2	12	3165794	3165805	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019703	GCAATT	2	12	3181647	3181658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019703	GCTTTT	2	12	3200684	3200695	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_019703	CCATTT	2	12	3222787	3222798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019703	GGTCAG	2	12	3234166	3234177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_019703	CCCTAG	2	12	3234664	3234675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019703	ATGGCC	2	12	3246899	3246910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019703	CAAAAT	2	12	3261050	3261061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_019703	CAAACA	2	12	3283862	3283873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019703	ACTAAT	2	12	3301191	3301202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_019703	GTTGAC	2	12	3301849	3301860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_019703	AAAGTA	2	12	3335631	3335642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019703	CTTTGC	2	12	3423432	3423443	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019703	GCAAAC	2	12	3435493	3435504	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019703	GTACGA	2	12	3458104	3458115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_019703	ATCAAG	2	12	3465961	3465972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_019703	ACGAGT	2	12	3467741	3467752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_019703	AAAAAT	2	12	3507203	3507214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019703	AAAATG	2	12	3547998	3548009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019703	TAGGGT	2	12	3553617	3553628	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019703	GGGTCT	2	12	3578203	3578214	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_019703	GCCAGA	2	12	3592449	3592460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019703	ATCGCG	2	12	3645887	3645898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019703	AACACA	2	12	3683605	3683616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019703	TACCTT	2	12	3697057	3697068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_019703	CAATAA	2	12	3825594	3825605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.