MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 69663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	CAG	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
2	NC_019703	CTT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223462
3	NC_019703	GCC	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
4	NC_019703	CAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223462
5	NC_019703	CGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
6	NC_019703	GCC	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
7	NC_019703	CCG	3	9	337	345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
8	NC_019703	TCG	3	9	410	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
9	NC_019703	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
10	NC_019703	CGC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
11	NC_019703	GCG	3	9	500	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
12	NC_019703	CGC	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
13	NC_019703	CCG	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
14	NC_019703	CTG	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
15	NC_019703	CGA	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
16	NC_019703	AGT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223462
17	NC_019703	AGA	2	6	908	913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
18	NC_019703	ACA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
19	NC_019703	AAG	3	9	1087	1095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
20	NC_019703	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
21	NC_019703	GAA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
22	NC_019703	GGC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
23	NC_019703	ACG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
24	NC_019703	AAC	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
25	NC_019703	AGC	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019703	GCT	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019703	TGC	2	6	1480	1485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019703	TCA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019703	CTA	3	9	1881	1889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019703	AGT	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019703	AGC	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019703	AGC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019703	GTT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019703	GAA	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019703	GCA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019703	AGC	2	6	2853	2858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019703	CTT	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
38	NC_019703	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223463
39	NC_019703	CTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
40	NC_019703	ATG	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223463
41	NC_019703	CTT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019703	AAG	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019703	CTG	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019703	TTG	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223464
45	NC_019703	AAG	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
46	NC_019703	CGC	2	6	3758	3763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223464
47	NC_019703	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223464
48	NC_019703	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
49	NC_019703	ACG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
50	NC_019703	ACG	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
51	NC_019703	TGG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223464
52	NC_019703	TCA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
53	NC_019703	CAT	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
54	NC_019703	GCT	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
55	NC_019703	CGT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
56	NC_019703	GAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
57	NC_019703	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223465
58	NC_019703	AAT	2	6	4649	4654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223465
59	NC_019703	TGG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223465
60	NC_019703	TGC	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019703	CTG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223466
62	NC_019703	CAT	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223466
63	NC_019703	AGC	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019703	GAG	2	6	5349	5354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019703	ATG	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019703	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
67	NC_019703	GGC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
68	NC_019703	CAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
69	NC_019703	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223467
70	NC_019703	CTA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
71	NC_019703	CGG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
72	NC_019703	AGC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
73	NC_019703	GCT	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
74	NC_019703	AGC	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
75	NC_019703	GCA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
76	NC_019703	GCT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
77	NC_019703	CTG	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
78	NC_019703	CGT	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
79	NC_019703	CAC	3	9	6177	6185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
80	NC_019703	GGC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
81	NC_019703	AGC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
82	NC_019703	GGC	2	6	6396	6401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
83	NC_019703	CGG	2	6	6435	6440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
84	NC_019703	ACC	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
85	NC_019703	TGG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223467
86	NC_019703	CAA	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
87	NC_019703	ACC	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
88	NC_019703	GAC	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
89	NC_019703	CAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
90	NC_019703	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
91	NC_019703	GCC	2	6	6707	6712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223467
92	NC_019703	CAG	2	6	6979	6984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019703	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019703	GTA	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019703	TCC	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019703	ATC	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223468
97	NC_019703	TCG	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
98	NC_019703	AGG	2	6	7186	7191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223468
99	NC_019703	TGG	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
100	NC_019703	GAT	2	6	7373	7378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223468
101	NC_019703	GGC	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
102	NC_019703	TGT	2	6	7488	7493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223468
103	NC_019703	TGG	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
104	NC_019703	GGC	2	6	7585	7590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
105	NC_019703	CGC	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223468
106	NC_019703	TGG	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
107	NC_019703	CGG	2	6	7681	7686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
108	NC_019703	CGT	2	6	7783	7788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
109	NC_019703	GAC	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223468
110	NC_019703	TGC	3	9	7821	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
111	NC_019703	CTG	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
112	NC_019703	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
113	NC_019703	GCA	2	6	8278	8283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
114	NC_019703	ACT	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223469
115	NC_019703	GGT	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223469
116	NC_019703	CGA	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
117	NC_019703	CGG	2	6	8513	8518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
118	NC_019703	ATG	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223469
119	NC_019703	TGC	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
120	NC_019703	GCC	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223469
121	NC_019703	GCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
122	NC_019703	ACT	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223469
123	NC_019703	GAT	2	6	8963	8968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223469
124	NC_019703	GGC	2	6	8977	8982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
125	NC_019703	GGT	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223469
126	NC_019703	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
127	NC_019703	GCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
128	NC_019703	GGC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
129	NC_019703	GGA	2	6	9157	9162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223469
130	NC_019703	CAG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
131	NC_019703	CAC	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223469
132	NC_019703	TGC	2	6	9423	9428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
133	NC_019703	ATT	2	6	9436	9441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223469
134	NC_019703	ATG	2	6	9496	9501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019703	CGG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223470
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138	NC_019703	CAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223471
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140	NC_019703	CGA	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223472
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258	NC_019703	CTT	2	6	17341	17346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223480
259	NC_019703	TGC	2	6	17355	17360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
260	NC_019703	CTG	4	12	17432	17443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
261	NC_019703	GCT	3	9	17485	17493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
262	NC_019703	CAT	2	6	17527	17532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223480
263	NC_019703	GAG	2	6	17618	17623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223480
264	NC_019703	GAC	2	6	17634	17639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223480
265	NC_019703	CCG	2	6	17651	17656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223481
266	NC_019703	AAC	2	6	17658	17663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223481
267	NC_019703	GCT	3	9	17712	17720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223481
268	NC_019703	TGC	2	6	17822	17827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223481
269	NC_019703	GCC	2	6	17961	17966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223481
270	NC_019703	GGC	2	6	18036	18041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223481
271	NC_019703	ACA	2	6	18068	18073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223481
272	NC_019703	CTA	2	6	18102	18107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223481
273	NC_019703	CAA	2	6	18135	18140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223481
274	NC_019703	AGC	2	6	18154	18159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223481
275	NC_019703	CTG	2	6	18330	18335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223482
276	NC_019703	CTG	2	6	18355	18360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223482
277	NC_019703	AAG	2	6	18448	18453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223482
278	NC_019703	GTC	2	6	18469	18474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223482
279	NC_019703	TGG	2	6	18538	18543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223482
280	NC_019703	TAC	2	6	18630	18635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223482
281	NC_019703	CCG	2	6	18648	18653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223482
282	NC_019703	AGA	2	6	18665	18670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223482
283	NC_019703	AAG	2	6	18712	18717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223482
284	NC_019703	CGC	2	6	18897	18902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223482
285	NC_019703	CGC	2	6	18921	18926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223482
286	NC_019703	CTG	2	6	19016	19021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223483
287	NC_019703	CGC	2	6	19025	19030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223483
288	NC_019703	GGC	2	6	19126	19131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223483
289	NC_019703	TGG	2	6	19152	19157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223483
290	NC_019703	GCC	2	6	19254	19259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223483
291	NC_019703	CGT	2	6	19273	19278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223483
292	NC_019703	CAG	2	6	19325	19330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223483
293	NC_019703	AAT	2	6	19333	19338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223483
294	NC_019703	ATC	2	6	19428	19433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223483
295	NC_019703	CGC	2	6	19436	19441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223483
296	NC_019703	GCT	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223483
297	NC_019703	GGA	2	6	19546	19551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223483
298	NC_019703	GAG	2	6	19613	19618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223483
299	NC_019703	TGG	2	6	19630	19635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223483
300	NC_019703	CGA	2	6	19654	19659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223483
301	NC_019703	TCG	2	6	19782	19787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223483
302	NC_019703	GCG	2	6	19798	19803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223483
303	NC_019703	CAC	2	6	19835	19840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223483
304	NC_019703	AGA	2	6	20041	20046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_019703	GAG	2	6	20204	20209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223484
306	NC_019703	GGT	2	6	20258	20263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223484
307	NC_019703	TGC	2	6	20332	20337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223484
308	NC_019703	AGG	2	6	20434	20439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223484
309	NC_019703	CGC	2	6	20672	20677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223484
310	NC_019703	GTC	2	6	20688	20693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223484
311	NC_019703	GGC	2	6	20736	20741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223484
312	NC_019703	CCA	2	6	20769	20774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223484
313	NC_019703	CGC	2	6	20796	20801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223484
314	NC_019703	GGC	2	6	20895	20900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223484
315	NC_019703	GCC	2	6	20928	20933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223484
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323	NC_019703	CAG	2	6	21264	21269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223484
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325	NC_019703	GAT	2	6	21571	21576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223485
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332	NC_019703	GCA	2	6	22083	22088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223485
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334	NC_019703	GGC	2	6	22239	22244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223485
335	NC_019703	ATG	2	6	22320	22325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
336	NC_019703	GGC	2	6	22411	22416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223486
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345	NC_019703	AGA	2	6	22959	22964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_019703	GCG	2	6	24785	24790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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