MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 62305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	CAG	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
2	NC_019703	CTT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223462
3	NC_019703	GCC	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
4	NC_019703	CAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223462
5	NC_019703	CGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
6	NC_019703	GCC	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
7	NC_019703	CCG	3	9	337	345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
8	NC_019703	TCG	3	9	410	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
9	NC_019703	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
10	NC_019703	CGC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
11	NC_019703	GCG	3	9	500	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
12	NC_019703	CGC	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
13	NC_019703	CCG	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
14	NC_019703	CTG	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
15	NC_019703	CGA	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
16	NC_019703	AGT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223462
17	NC_019703	AGA	2	6	908	913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
18	NC_019703	ACA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
19	NC_019703	AAG	3	9	1087	1095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
20	NC_019703	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
21	NC_019703	GAA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
22	NC_019703	GGC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
23	NC_019703	ACG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
24	NC_019703	AAC	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
25	NC_019703	CTT	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
26	NC_019703	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223463
27	NC_019703	CTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
28	NC_019703	ATG	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223463
29	NC_019703	TTG	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223464
30	NC_019703	AAG	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
31	NC_019703	CGC	2	6	3758	3763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223464
32	NC_019703	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223464
33	NC_019703	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
34	NC_019703	ACG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
35	NC_019703	ACG	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
36	NC_019703	TGG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223464
37	NC_019703	TCA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
38	NC_019703	CAT	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
39	NC_019703	GCT	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
40	NC_019703	CGT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
41	NC_019703	GAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
42	NC_019703	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223465
43	NC_019703	AAT	2	6	4649	4654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223465
44	NC_019703	TGG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223465
45	NC_019703	CTG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223466
46	NC_019703	CAT	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223466
47	NC_019703	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
48	NC_019703	GGC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
49	NC_019703	CAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
50	NC_019703	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223467
51	NC_019703	CTA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
52	NC_019703	CGG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
53	NC_019703	AGC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
54	NC_019703	GCT	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
55	NC_019703	AGC	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
56	NC_019703	GCA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
57	NC_019703	GCT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
58	NC_019703	CTG	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
59	NC_019703	CGT	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
60	NC_019703	CAC	3	9	6177	6185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
61	NC_019703	GGC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
62	NC_019703	AGC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
63	NC_019703	GGC	2	6	6396	6401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
64	NC_019703	CGG	2	6	6435	6440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
65	NC_019703	ACC	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
66	NC_019703	TGG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223467
67	NC_019703	CAA	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
68	NC_019703	ACC	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
69	NC_019703	GAC	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
70	NC_019703	CAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
71	NC_019703	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
72	NC_019703	GCC	2	6	6707	6712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223467
73	NC_019703	ATC	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223468
74	NC_019703	TCG	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
75	NC_019703	AGG	2	6	7186	7191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223468
76	NC_019703	TGG	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
77	NC_019703	GAT	2	6	7373	7378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223468
78	NC_019703	GGC	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
79	NC_019703	TGT	2	6	7488	7493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223468
80	NC_019703	TGG	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
81	NC_019703	GGC	2	6	7585	7590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
82	NC_019703	CGC	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223468
83	NC_019703	TGG	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
84	NC_019703	CGG	2	6	7681	7686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
85	NC_019703	CGT	2	6	7783	7788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
86	NC_019703	GAC	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223468
87	NC_019703	TGC	3	9	7821	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
88	NC_019703	CTG	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
89	NC_019703	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
90	NC_019703	GCA	2	6	8278	8283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
91	NC_019703	ACT	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223469
92	NC_019703	GGT	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223469
93	NC_019703	CGA	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
94	NC_019703	CGG	2	6	8513	8518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
95	NC_019703	ATG	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223469
96	NC_019703	TGC	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
97	NC_019703	GCC	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223469
98	NC_019703	GCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
99	NC_019703	ACT	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223469
100	NC_019703	GAT	2	6	8963	8968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223469
101	NC_019703	GGC	2	6	8977	8982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
102	NC_019703	GGT	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223469
103	NC_019703	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
104	NC_019703	GCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
105	NC_019703	GGC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
106	NC_019703	GGA	2	6	9157	9162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223469
107	NC_019703	CAG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
108	NC_019703	CAC	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223469
109	NC_019703	TGC	2	6	9423	9428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
110	NC_019703	ATT	2	6	9436	9441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223469
111	NC_019703	CGG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223470
112	NC_019703	GAA	2	6	9871	9876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223471
113	NC_019703	CAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223471
114	NC_019703	CGA	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223472
115	NC_019703	GGC	2	6	10492	10497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223472
116	NC_019703	AAG	2	6	10572	10577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223472
117	NC_019703	GCG	2	6	10615	10620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223472
118	NC_019703	TCT	2	6	10702	10707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223472
119	NC_019703	GCT	2	6	10714	10719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223472
120	NC_019703	CTG	2	6	10763	10768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223472
121	NC_019703	ACG	2	6	10862	10867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223472
122	NC_019703	GCC	2	6	10910	10915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223472
123	NC_019703	CAG	2	6	11519	11524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223474
124	NC_019703	GCG	2	6	11556	11561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223474
125	NC_019703	CGG	2	6	11574	11579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223474
126	NC_019703	CTA	2	6	11581	11586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223474
127	NC_019703	GAT	2	6	11716	11721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223474
128	NC_019703	AGG	2	6	11748	11753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223474
129	NC_019703	GCG	2	6	11793	11798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223474
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252	NC_019703	GCT	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223483
253	NC_019703	GGA	2	6	19546	19551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223483
254	NC_019703	GAG	2	6	19613	19618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223483
255	NC_019703	TGG	2	6	19630	19635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223483
256	NC_019703	CGA	2	6	19654	19659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223483
257	NC_019703	TCG	2	6	19782	19787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223483
258	NC_019703	GCG	2	6	19798	19803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223483
259	NC_019703	CAC	2	6	19835	19840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223483
260	NC_019703	GAG	2	6	20204	20209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223484
261	NC_019703	GGT	2	6	20258	20263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223484
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269	NC_019703	GGC	2	6	20895	20900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223484
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283	NC_019703	GGC	2	6	21706	21711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223485
284	NC_019703	GCC	2	6	21731	21736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223485
285	NC_019703	GAA	2	6	21823	21828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223485
286	NC_019703	TGC	2	6	21843	21848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223485
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498	NC_019703	ATC	2	6	36038	36043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223500
499	NC_019703	CGC	2	6	36060	36065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223500
500	NC_019703	GCG	2	6	36092	36097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223500

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