MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 1704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019702	GATGC	2	10	858	867	20 %	20 %	40 %	20 %	428220141
2	NC_019702	AACCA	2	10	3030	3039	60 %	0 %	0 %	40 %	428220143
3	NC_019702	CCCCG	2	10	4016	4025	0 %	0 %	20 %	80 %	428220144
4	NC_019702	AGAAA	2	10	6144	6153	80 %	0 %	20 %	0 %	428220146
5	NC_019702	GGGAA	2	10	6476	6485	40 %	0 %	60 %	0 %	428220147
6	NC_019702	AGCTT	2	10	8544	8553	20 %	40 %	20 %	20 %	428220147
7	NC_019702	GACTT	2	10	12268	12277	20 %	40 %	20 %	20 %	428220151
8	NC_019702	ACCAA	2	10	13423	13432	60 %	0 %	0 %	40 %	428220153
9	NC_019702	AGCAG	2	10	16847	16856	40 %	0 %	40 %	20 %	428220156
10	NC_019702	CAAAG	2	10	17585	17594	60 %	0 %	20 %	20 %	428220156
11	NC_019702	CAAAC	2	10	18929	18938	60 %	0 %	0 %	40 %	428220157
12	NC_019702	TTTGT	2	10	22444	22453	0 %	80 %	20 %	0 %	428220161
13	NC_019702	TTACC	2	10	26542	26551	20 %	40 %	0 %	40 %	428220165
14	NC_019702	AAGTA	2	10	29760	29769	60 %	20 %	20 %	0 %	428220166
15	NC_019702	TGACC	2	10	33972	33981	20 %	20 %	20 %	40 %	428220168
16	NC_019702	CTTTT	2	10	35798	35807	0 %	80 %	0 %	20 %	428220169
17	NC_019702	ACCTT	2	10	36057	36066	20 %	40 %	0 %	40 %	428220170
18	NC_019702	GCACA	2	10	47300	47309	40 %	0 %	20 %	40 %	428220184
19	NC_019702	TAATT	2	10	48001	48010	40 %	60 %	0 %	0 %	428220185
20	NC_019702	TTACT	2	10	49025	49034	20 %	60 %	0 %	20 %	428220185
21	NC_019702	CAATT	2	10	50469	50478	40 %	40 %	0 %	20 %	428220187
22	NC_019702	GCTTT	2	10	50941	50950	0 %	60 %	20 %	20 %	428220187
23	NC_019702	ATTTG	2	10	52966	52975	20 %	60 %	20 %	0 %	428220190
24	NC_019702	TTGAA	2	10	55544	55553	40 %	40 %	20 %	0 %	428220194
25	NC_019702	TAATT	2	10	61673	61682	40 %	60 %	0 %	0 %	428220201
26	NC_019702	GCCTT	2	10	62548	62557	0 %	40 %	20 %	40 %	428220201
27	NC_019702	ACTCC	2	10	64185	64194	20 %	20 %	0 %	60 %	428220202
28	NC_019702	CCATG	2	10	64277	64286	20 %	20 %	20 %	40 %	428220203
29	NC_019702	TGGTC	2	10	64452	64461	0 %	40 %	40 %	20 %	428220203
30	NC_019702	TGTGC	2	10	68514	68523	0 %	40 %	40 %	20 %	428220208
31	NC_019702	GCAAG	2	10	69022	69031	40 %	0 %	40 %	20 %	428220208
32	NC_019702	CTTGG	2	10	73884	73893	0 %	40 %	40 %	20 %	428220213
33	NC_019702	AGTTG	2	10	77402	77411	20 %	40 %	40 %	0 %	428220215
34	NC_019702	CCTGT	2	10	77799	77808	0 %	40 %	20 %	40 %	428220215
35	NC_019702	TTGAG	2	10	82083	82092	20 %	40 %	40 %	0 %	428220218
36	NC_019702	AAATT	2	10	86139	86148	60 %	40 %	0 %	0 %	428220223
37	NC_019702	GCATG	2	10	86342	86351	20 %	20 %	40 %	20 %	428220223
38	NC_019702	CGATT	2	10	87234	87243	20 %	40 %	20 %	20 %	428220224
39	NC_019702	GTTTG	2	10	87545	87554	0 %	60 %	40 %	0 %	428220224
40	NC_019702	TATTT	2	10	87715	87724	20 %	80 %	0 %	0 %	428220224
41	NC_019702	GTGAT	2	10	90597	90606	20 %	40 %	40 %	0 %	428220226
42	NC_019702	TGCTT	2	10	92322	92331	0 %	60 %	20 %	20 %	428220228
43	NC_019702	TTGCT	2	10	92699	92708	0 %	60 %	20 %	20 %	428220228
44	NC_019702	ATGTG	2	10	93883	93892	20 %	40 %	40 %	0 %	428220228
45	NC_019702	GTAAT	2	10	93904	93913	40 %	40 %	20 %	0 %	428220228
46	NC_019702	ATCTA	2	10	97475	97484	40 %	40 %	0 %	20 %	428220230
47	NC_019702	TTCCT	2	10	98258	98267	0 %	60 %	0 %	40 %	428220230
48	NC_019702	ACGAG	2	10	101058	101067	40 %	0 %	40 %	20 %	428220233
49	NC_019702	CGGGG	2	10	102084	102093	0 %	0 %	80 %	20 %	428220234
50	NC_019702	GTACA	2	10	105388	105397	40 %	20 %	20 %	20 %	428220238
51	NC_019702	TGATC	2	10	106179	106188	20 %	40 %	20 %	20 %	428220239
52	NC_019702	AATAA	2	10	106353	106362	80 %	20 %	0 %	0 %	428220239
53	NC_019702	GCCAA	2	10	106836	106845	40 %	0 %	20 %	40 %	428220239
54	NC_019702	GCATA	2	10	107610	107619	40 %	20 %	20 %	20 %	428220240
55	NC_019702	GGTTT	2	10	107906	107915	0 %	60 %	40 %	0 %	428220240
56	NC_019702	ACGGA	2	10	108182	108191	40 %	0 %	40 %	20 %	428220240
57	NC_019702	AAATA	2	10	108666	108675	80 %	20 %	0 %	0 %	428220241
58	NC_019702	AAAGA	2	10	111143	111152	80 %	0 %	20 %	0 %	428220244
59	NC_019702	ATGCC	2	10	112325	112334	20 %	20 %	20 %	40 %	428220245
60	NC_019702	GAGGT	2	10	114583	114592	20 %	20 %	60 %	0 %	428220247
61	NC_019702	GATTA	2	10	116369	116378	40 %	40 %	20 %	0 %	428220249
62	NC_019702	CCCAT	2	10	116662	116671	20 %	20 %	0 %	60 %	428220249
63	NC_019702	AAATC	2	10	118103	118112	60 %	20 %	0 %	20 %	428220252
64	NC_019702	AACTT	2	10	118306	118315	40 %	40 %	0 %	20 %	428220252
65	NC_019702	AATTA	2	10	119737	119746	60 %	40 %	0 %	0 %	428220255
66	NC_019702	TTAGG	2	10	120660	120669	20 %	40 %	40 %	0 %	428220256
67	NC_019702	CCTTG	2	10	121654	121663	0 %	40 %	20 %	40 %	428220257
68	NC_019702	GAAAA	2	10	123911	123920	80 %	0 %	20 %	0 %	428220262
69	NC_019702	CCACA	2	10	124896	124905	40 %	0 %	0 %	60 %	428220263
70	NC_019702	CTCAT	2	10	125155	125164	20 %	40 %	0 %	40 %	428220263
71	NC_019702	AGCCT	2	10	127438	127447	20 %	20 %	20 %	40 %	428220265
72	NC_019702	TTTGA	2	10	134290	134299	20 %	60 %	20 %	0 %	428220270
73	NC_019702	TCTGG	2	10	134698	134707	0 %	40 %	40 %	20 %	428220271
74	NC_019702	AAACT	2	10	138402	138411	60 %	20 %	0 %	20 %	428220273
75	NC_019702	TAGTA	2	10	140212	140221	40 %	40 %	20 %	0 %	428220275
76	NC_019702	AAATA	2	10	141394	141403	80 %	20 %	0 %	0 %	428220276
77	NC_019702	GCCAT	2	10	142139	142148	20 %	20 %	20 %	40 %	428220276
78	NC_019702	ATTTC	2	10	144263	144272	20 %	60 %	0 %	20 %	428220278
79	NC_019702	TCTCC	2	10	145769	145778	0 %	40 %	0 %	60 %	428220279
80	NC_019702	TTGGT	2	10	148818	148827	0 %	60 %	40 %	0 %	428220281
81	NC_019702	TAGAG	2	10	149910	149919	40 %	20 %	40 %	0 %	428220283
82	NC_019702	AGACC	2	10	152764	152773	40 %	0 %	20 %	40 %	428220290
83	NC_019702	AGTAA	2	10	152811	152820	60 %	20 %	20 %	0 %	428220290
84	NC_019702	CGAAT	2	10	153236	153245	40 %	20 %	20 %	20 %	428220291
85	NC_019702	CCATT	2	10	153566	153575	20 %	40 %	0 %	40 %	428220291
86	NC_019702	AAAAT	2	10	155628	155637	80 %	20 %	0 %	0 %	428220293
87	NC_019702	GTAAC	2	10	156040	156049	40 %	20 %	20 %	20 %	428220293
88	NC_019702	TACCC	2	10	159134	159143	20 %	20 %	0 %	60 %	428220296
89	NC_019702	CAAAC	2	10	159333	159342	60 %	0 %	0 %	40 %	428220296
90	NC_019702	TCAAT	2	10	160742	160751	40 %	40 %	0 %	20 %	428220297
91	NC_019702	ATTCC	2	10	161314	161323	20 %	40 %	0 %	40 %	428220299
92	NC_019702	TAAGT	2	10	169207	169216	40 %	40 %	20 %	0 %	428220307
93	NC_019702	AGTTT	2	10	169546	169555	20 %	60 %	20 %	0 %	428220308
94	NC_019702	GCTAA	2	10	170582	170591	40 %	20 %	20 %	20 %	428220309
95	NC_019702	AGTTC	2	10	172067	172076	20 %	40 %	20 %	20 %	428220311
96	NC_019702	AACAT	2	10	173024	173033	60 %	20 %	0 %	20 %	428220312
97	NC_019702	TAGCT	2	10	173995	174004	20 %	40 %	20 %	20 %	428220313
98	NC_019702	CCCTT	2	10	178160	178169	0 %	40 %	0 %	60 %	428220316
99	NC_019702	AAACT	2	10	179364	179373	60 %	20 %	0 %	20 %	428220318
100	NC_019702	TTTGA	2	10	180341	180350	20 %	60 %	20 %	0 %	428220318
101	NC_019702	AATTA	2	10	187905	187914	60 %	40 %	0 %	0 %	428220324
102	NC_019702	ACTTC	2	10	188068	188077	20 %	40 %	0 %	40 %	428220324
103	NC_019702	GTACT	2	10	188252	188261	20 %	40 %	20 %	20 %	428220324
104	NC_019702	AGGAA	2	10	188302	188311	60 %	0 %	40 %	0 %	428220324
105	NC_019702	ACTGG	2	10	188746	188755	20 %	20 %	40 %	20 %	428220325
106	NC_019702	AATTC	2	10	191515	191524	40 %	40 %	0 %	20 %	428220327
107	NC_019702	TTTAG	2	10	193038	193047	20 %	60 %	20 %	0 %	428220329
108	NC_019702	AGTAA	2	10	193774	193783	60 %	20 %	20 %	0 %	428220329
109	NC_019702	ATCCT	2	10	194164	194173	20 %	40 %	0 %	40 %	428220330
110	NC_019702	TTTGC	2	10	194273	194282	0 %	60 %	20 %	20 %	428220330
111	NC_019702	GTTGT	2	10	195637	195646	0 %	60 %	40 %	0 %	428220334
112	NC_019702	ATTTT	2	10	196462	196471	20 %	80 %	0 %	0 %	428220335
113	NC_019702	TTTGG	2	10	202675	202684	0 %	60 %	40 %	0 %	428220340
114	NC_019702	TAATT	2	10	205234	205243	40 %	60 %	0 %	0 %	428220343
115	NC_019702	AACAG	2	10	206117	206126	60 %	0 %	20 %	20 %	428220344
116	NC_019702	TTGGC	2	10	206146	206155	0 %	40 %	40 %	20 %	428220344
117	NC_019702	CCCCG	2	10	208712	208721	0 %	0 %	20 %	80 %	428220347
118	NC_019702	GGTAA	2	10	213664	213673	40 %	20 %	40 %	0 %	428220351
119	NC_019702	GCCTC	2	10	214136	214145	0 %	20 %	20 %	60 %	428220351
120	NC_019702	AGTCA	2	10	215539	215548	40 %	20 %	20 %	20 %	428220351
121	NC_019702	AATTT	2	10	216983	216992	40 %	60 %	0 %	0 %	428220352
122	NC_019702	ACTCC	2	10	217346	217355	20 %	20 %	0 %	60 %	428220352
123	NC_019702	AATCA	2	10	221562	221571	60 %	20 %	0 %	20 %	428220356
124	NC_019702	TTTAG	2	10	225508	225517	20 %	60 %	20 %	0 %	428220360
125	NC_019702	ATGCT	2	10	227716	227725	20 %	40 %	20 %	20 %	428220361
126	NC_019702	AATCT	2	10	227997	228006	40 %	40 %	0 %	20 %	428220362
127	NC_019702	ATCGC	2	10	234261	234270	20 %	20 %	20 %	40 %	428220367
128	NC_019702	ACATC	2	10	234994	235003	40 %	20 %	0 %	40 %	428220367
129	NC_019702	TAATT	2	10	235905	235914	40 %	60 %	0 %	0 %	428220369
130	NC_019702	TAAAG	2	10	242363	242372	60 %	20 %	20 %	0 %	428220375
131	NC_019702	TCAAA	2	10	243992	244001	60 %	20 %	0 %	20 %	428220376
132	NC_019702	TCAAC	2	10	245046	245055	40 %	20 %	0 %	40 %	428220376
133	NC_019702	TGGCT	2	10	246364	246373	0 %	40 %	40 %	20 %	428220377
134	NC_019702	ACCGT	2	10	246511	246520	20 %	20 %	20 %	40 %	428220377
135	NC_019702	TTACT	2	10	252875	252884	20 %	60 %	0 %	20 %	428220382
136	NC_019702	AAATC	2	10	253286	253295	60 %	20 %	0 %	20 %	428220382
137	NC_019702	AATTA	2	10	255605	255614	60 %	40 %	0 %	0 %	428220383
138	NC_019702	AACTG	2	10	259896	259905	40 %	20 %	20 %	20 %	428220389
139	NC_019702	TTTCC	2	10	263772	263781	0 %	60 %	0 %	40 %	428220392
140	NC_019702	GAAGT	2	10	274722	274731	40 %	20 %	40 %	0 %	428220402
141	NC_019702	GAGCA	2	10	276667	276676	40 %	0 %	40 %	20 %	428220403
142	NC_019702	ATCAG	2	10	280220	280229	40 %	20 %	20 %	20 %	428220406
143	NC_019702	AGTAC	2	10	280970	280979	40 %	20 %	20 %	20 %	428220406
144	NC_019702	TATTT	2	10	292449	292458	20 %	80 %	0 %	0 %	428220417
145	NC_019702	GTTTT	2	10	292565	292574	0 %	80 %	20 %	0 %	428220417
146	NC_019702	TAAAG	2	10	293236	293245	60 %	20 %	20 %	0 %	428220418
147	NC_019702	GAACT	2	10	293732	293741	40 %	20 %	20 %	20 %	428220418
148	NC_019702	CCGCA	2	10	295153	295162	20 %	0 %	20 %	60 %	428220419
149	NC_019702	TCCAC	2	10	295607	295616	20 %	20 %	0 %	60 %	428220419
150	NC_019702	TCCAT	2	10	300148	300157	20 %	40 %	0 %	40 %	428220421
151	NC_019702	TGCCA	2	10	301129	301138	20 %	20 %	20 %	40 %	428220422
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153	NC_019702	AATTA	2	10	311344	311353	60 %	40 %	0 %	0 %	428220434
154	NC_019702	CCTTG	2	10	313805	313814	0 %	40 %	20 %	40 %	428220436
155	NC_019702	GGTTG	2	10	315015	315024	0 %	40 %	60 %	0 %	428220436
156	NC_019702	TTTAC	2	10	315204	315213	20 %	60 %	0 %	20 %	428220436
157	NC_019702	TAGGC	2	10	318421	318430	20 %	20 %	40 %	20 %	428220438
158	NC_019702	TTGCC	2	10	324327	324336	0 %	40 %	20 %	40 %	428220444
159	NC_019702	ATAAA	2	10	324500	324509	80 %	20 %	0 %	0 %	428220444
160	NC_019702	CGATT	2	10	327663	327672	20 %	40 %	20 %	20 %	428220447
161	NC_019702	ACCAA	2	10	328175	328184	60 %	0 %	0 %	40 %	428220447
162	NC_019702	AATCC	2	10	330050	330059	40 %	20 %	0 %	40 %	428220448
163	NC_019702	GCTGG	2	10	334464	334473	0 %	20 %	60 %	20 %	428220453
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165	NC_019702	ATTTT	2	10	341879	341888	20 %	80 %	0 %	0 %	428220460
166	NC_019702	TTCTG	2	10	344456	344465	0 %	60 %	20 %	20 %	428220463
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170	NC_019702	GACTT	2	10	352904	352913	20 %	40 %	20 %	20 %	428220472
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172	NC_019702	TTTGA	2	10	358500	358509	20 %	60 %	20 %	0 %	428220477
173	NC_019702	ATTAA	2	10	367967	367976	60 %	40 %	0 %	0 %	428220486
174	NC_019702	CACTC	2	10	368257	368266	20 %	20 %	0 %	60 %	428220486
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176	NC_019702	GATCG	2	10	369693	369702	20 %	20 %	40 %	20 %	428220487
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250	NC_019702	GTTTT	2	10	533848	533857	0 %	80 %	20 %	0 %	428220644
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253	NC_019702	GTTTA	2	10	544927	544936	20 %	60 %	20 %	0 %	428220654
254	NC_019702	AGAAA	2	10	546920	546929	80 %	0 %	20 %	0 %	428220656
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261	NC_019702	GAAAA	2	10	564694	564703	80 %	0 %	20 %	0 %	428220674
262	NC_019702	AATTA	2	10	565681	565690	60 %	40 %	0 %	0 %	428220675
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384	NC_019702	GCATA	2	10	823473	823482	40 %	20 %	20 %	20 %	428220923
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390	NC_019702	GTCAA	2	10	847589	847598	40 %	20 %	20 %	20 %	428220952
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500	NC_019702	CCCAT	2	10	1037496	1037505	20 %	20 %	0 %	60 %	428221102

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