MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 38684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019702	ATC	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019702	TTA	2	6	150	155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019702	GAG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220141
4	NC_019702	TAC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220141
5	NC_019702	ATC	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220141
6	NC_019702	AGA	3	9	518	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220141
7	NC_019702	AGT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220141
8	NC_019702	GTG	3	9	721	729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220141
9	NC_019702	ATT	3	9	999	1007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220141
10	NC_019702	TGC	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220141
11	NC_019702	GGC	2	6	1399	1404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220141
12	NC_019702	ATT	2	6	1571	1576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220141
13	NC_019702	AAT	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
14	NC_019702	ACA	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220142
15	NC_019702	TAA	2	6	1834	1839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
16	NC_019702	ACT	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220142
17	NC_019702	GTG	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220142
18	NC_019702	AGC	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220142
19	NC_019702	GCT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220142
20	NC_019702	ATC	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220142
21	NC_019702	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220142
22	NC_019702	TAA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
23	NC_019702	ATA	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
24	NC_019702	ATG	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019702	AGG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019702	GGC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220143
27	NC_019702	CTA	2	6	3196	3201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220143
28	NC_019702	CAT	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220143
29	NC_019702	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220143
30	NC_019702	TAG	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220143
31	NC_019702	AGC	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220144
32	NC_019702	TAA	3	9	3682	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
33	NC_019702	TCA	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220144
34	NC_019702	ATA	2	6	3737	3742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
35	NC_019702	ACC	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220144
36	NC_019702	GCC	3	9	3962	3970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220144
37	NC_019702	CGC	2	6	4079	4084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220144
38	NC_019702	ATA	2	6	4102	4107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
39	NC_019702	GTT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220144
40	NC_019702	GGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220144
41	NC_019702	CTG	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220144
42	NC_019702	CAA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220144
43	NC_019702	AAT	2	6	4299	4304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
44	NC_019702	CGG	2	6	4410	4415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220144
45	NC_019702	TGT	2	6	4538	4543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220144
46	NC_019702	TGC	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220144
47	NC_019702	CTT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220144
48	NC_019702	ATT	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220144
49	NC_019702	ATA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019702	CAG	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220145
51	NC_019702	AAT	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220145
52	NC_019702	ATC	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220145
53	NC_019702	AAT	2	6	5126	5131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220145
54	NC_019702	ACT	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220145
55	NC_019702	TAA	2	6	5293	5298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220145
56	NC_019702	CAT	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220145
57	NC_019702	GCT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220145
58	NC_019702	TGC	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220145
59	NC_019702	CAC	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220145
60	NC_019702	ATT	2	6	5911	5916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220146
61	NC_019702	GAA	3	9	5924	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220146
62	NC_019702	GCT	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220146
63	NC_019702	ATC	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220146
64	NC_019702	TTA	2	6	6828	6833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220147
65	NC_019702	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
66	NC_019702	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220147
67	NC_019702	AAT	2	6	7082	7087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
68	NC_019702	CAT	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220147
69	NC_019702	GGC	2	6	7274	7279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220147
70	NC_019702	TCT	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220147
71	NC_019702	ACC	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220147
72	NC_019702	TAA	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
73	NC_019702	GAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220147
74	NC_019702	TAG	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220147
75	NC_019702	CTG	2	6	7785	7790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220147
76	NC_019702	AAT	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
77	NC_019702	GAT	2	6	7885	7890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220147
78	NC_019702	TTG	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220147
79	NC_019702	CCG	2	6	8065	8070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220147
80	NC_019702	CGA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220147
81	NC_019702	TCT	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220147
82	NC_019702	CAC	2	6	8290	8295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220147
83	NC_019702	CAT	2	6	8443	8448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220147
84	NC_019702	ACT	2	6	8454	8459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220147
85	NC_019702	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
86	NC_019702	CTG	2	6	8507	8512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220147
87	NC_019702	CTT	2	6	8557	8562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220147
88	NC_019702	ACA	2	6	8574	8579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220147
89	NC_019702	GCC	2	6	8634	8639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220147
90	NC_019702	AAT	2	6	8651	8656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
91	NC_019702	ACG	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220147
92	NC_019702	GGT	2	6	8777	8782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220147
93	NC_019702	CTG	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220147
94	NC_019702	AAC	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019702	CAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220148
96	NC_019702	CCA	2	6	8943	8948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220148
97	NC_019702	GTT	2	6	9096	9101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220148
98	NC_019702	CAA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220148
99	NC_019702	GGA	2	6	9358	9363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019702	GAA	2	6	9396	9401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019702	GAT	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220149
102	NC_019702	AAT	2	6	9513	9518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220149
103	NC_019702	TAA	2	6	9540	9545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220149
104	NC_019702	ATC	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220149
105	NC_019702	CTG	2	6	9786	9791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220149
106	NC_019702	CTG	2	6	9941	9946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220149
107	NC_019702	GCC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220149
108	NC_019702	ATC	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220149
109	NC_019702	GTG	2	6	10255	10260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220149
110	NC_019702	CTT	2	6	10273	10278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220149
111	NC_019702	ATA	2	6	10388	10393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220150
112	NC_019702	TTG	2	6	10426	10431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220150
113	NC_019702	CGT	2	6	10488	10493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220150
114	NC_019702	ACC	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220150
115	NC_019702	ATC	2	6	10529	10534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
116	NC_019702	TCG	2	6	10563	10568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220150
117	NC_019702	AAC	2	6	10812	10817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220150
118	NC_019702	TTG	2	6	10883	10888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220150
119	NC_019702	ACC	2	6	11117	11122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220150
120	NC_019702	CAT	2	6	11158	11163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
121	NC_019702	ATT	3	9	11174	11182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220150
122	NC_019702	ATT	2	6	11189	11194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220150
123	NC_019702	TCT	2	6	11295	11300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220150
124	NC_019702	ATC	2	6	11303	11308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
125	NC_019702	TGA	2	6	11457	11462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220150
126	NC_019702	CTA	2	6	11484	11489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
127	NC_019702	GGA	2	6	11550	11555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220150
128	NC_019702	TGC	2	6	11565	11570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220150
129	NC_019702	TCA	2	6	11589	11594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
130	NC_019702	ATC	2	6	11595	11600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
131	NC_019702	GAC	2	6	11698	11703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220150
132	NC_019702	TAA	2	6	11741	11746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220150
133	NC_019702	ACT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
134	NC_019702	TCT	2	6	11847	11852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220150
135	NC_019702	TAC	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
136	NC_019702	GAC	2	6	11962	11967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220150
137	NC_019702	TCA	2	6	11992	11997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
138	NC_019702	AGC	2	6	12148	12153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019702	GGT	2	6	12243	12248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220151
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143	NC_019702	GGT	2	6	12553	12558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220152
144	NC_019702	TTA	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220152
145	NC_019702	TTC	2	6	12765	12770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220152
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147	NC_019702	GGT	2	6	12910	12915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220152
148	NC_019702	GTG	2	6	12927	12932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220152
149	NC_019702	TGC	2	6	12961	12966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220152
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152	NC_019702	TAA	2	6	13170	13175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220153
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156	NC_019702	AGT	2	6	13630	13635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220153
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164	NC_019702	TTC	2	6	14703	14708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220154
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168	NC_019702	CAT	2	6	15005	15010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220154
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171	NC_019702	ACC	2	6	15234	15239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220154
172	NC_019702	TGA	2	6	15406	15411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220155
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175	NC_019702	ATT	2	6	15634	15639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019702	TAG	2	6	15700	15705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019702	AAC	2	6	15791	15796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_019702	ATC	2	6	15927	15932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_019702	TTA	2	6	15973	15978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_019702	CCG	2	6	16915	16920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220156
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195	NC_019702	TAT	2	6	17538	17543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220156
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224	NC_019702	TGA	2	6	20487	20492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220158
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226	NC_019702	ATC	2	6	20649	20654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220158
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232	NC_019702	AAT	2	6	21403	21408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_019702	AAT	2	6	21446	21451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_019702	CCA	2	6	21554	21559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220160
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237	NC_019702	ACC	2	6	21792	21797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220160
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241	NC_019702	ATA	2	6	22330	22335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220160
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247	NC_019702	ACT	2	6	22852	22857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220161
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251	NC_019702	ATT	2	6	23248	23253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019702	TAA	2	6	23280	23285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220162
253	NC_019702	CGC	2	6	23367	23372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220162
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255	NC_019702	CTG	2	6	23606	23611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220162
256	NC_019702	TAA	2	6	23768	23773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220162
257	NC_019702	TGG	2	6	23888	23893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220162
258	NC_019702	AGC	2	6	23973	23978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220162
259	NC_019702	TCA	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220162
260	NC_019702	CAT	2	6	24087	24092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220162
261	NC_019702	ATT	2	6	24276	24281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019702	TAA	2	6	24300	24305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019702	CAT	2	6	24449	24454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220163
264	NC_019702	TTA	2	6	24562	24567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220163
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270	NC_019702	CAC	2	6	25004	25009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220163
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272	NC_019702	CAC	2	6	25121	25126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220163
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275	NC_019702	GAC	2	6	25310	25315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220163
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278	NC_019702	TGA	2	6	25467	25472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019702	CAC	2	6	25507	25512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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332	NC_019702	TGC	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
333	NC_019702	ATT	2	6	29119	29124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_019702	ATT	2	6	29130	29135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_019702	TCA	2	6	29211	29216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_019702	TAA	2	6	31178	31183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220167
353	NC_019702	ATT	2	6	31224	31229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220167
354	NC_019702	ATA	2	6	31399	31404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220167
355	NC_019702	AAG	2	6	31501	31506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220167
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361	NC_019702	GGC	2	6	32158	32163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220167
362	NC_019702	TGA	2	6	32510	32515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220167
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365	NC_019702	GTT	2	6	33034	33039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_019702	TAA	2	6	34020	34025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220168
377	NC_019702	GGC	2	6	34053	34058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220168
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491	NC_019702	TTG	2	6	45144	45149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220181
492	NC_019702	CAA	2	6	45219	45224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220181
493	NC_019702	TAT	2	6	45452	45457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_019702	GCC	2	6	45821	45826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220183
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499	NC_019702	GGC	2	6	46008	46013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220183
500	NC_019702	TAA	2	6	46152	46157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220183

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