MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 33265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019702	GAG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220141
2	NC_019702	TAC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220141
3	NC_019702	ATC	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220141
4	NC_019702	AGA	3	9	518	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220141
5	NC_019702	AGT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220141
6	NC_019702	GTG	3	9	721	729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220141
7	NC_019702	ATT	3	9	999	1007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220141
8	NC_019702	TGC	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220141
9	NC_019702	GGC	2	6	1399	1404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220141
10	NC_019702	ATT	2	6	1571	1576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220141
11	NC_019702	AAT	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
12	NC_019702	ACA	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220142
13	NC_019702	TAA	2	6	1834	1839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
14	NC_019702	ACT	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220142
15	NC_019702	GTG	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220142
16	NC_019702	AGC	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220142
17	NC_019702	GCT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220142
18	NC_019702	ATC	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220142
19	NC_019702	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220142
20	NC_019702	TAA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
21	NC_019702	ATA	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220142
22	NC_019702	GGC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220143
23	NC_019702	CTA	2	6	3196	3201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220143
24	NC_019702	CAT	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220143
25	NC_019702	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220143
26	NC_019702	TAG	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220143
27	NC_019702	AGC	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220144
28	NC_019702	TAA	3	9	3682	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
29	NC_019702	TCA	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220144
30	NC_019702	ATA	2	6	3737	3742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
31	NC_019702	ACC	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220144
32	NC_019702	GCC	3	9	3962	3970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220144
33	NC_019702	CGC	2	6	4079	4084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220144
34	NC_019702	ATA	2	6	4102	4107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
35	NC_019702	GTT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220144
36	NC_019702	GGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220144
37	NC_019702	CTG	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220144
38	NC_019702	CAA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220144
39	NC_019702	AAT	2	6	4299	4304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220144
40	NC_019702	CGG	2	6	4410	4415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220144
41	NC_019702	TGT	2	6	4538	4543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220144
42	NC_019702	TGC	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220144
43	NC_019702	CTT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220144
44	NC_019702	ATT	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220144
45	NC_019702	CAG	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220145
46	NC_019702	AAT	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220145
47	NC_019702	ATC	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220145
48	NC_019702	AAT	2	6	5126	5131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220145
49	NC_019702	ACT	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220145
50	NC_019702	TAA	2	6	5293	5298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220145
51	NC_019702	CAT	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220145
52	NC_019702	GCT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220145
53	NC_019702	TGC	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220145
54	NC_019702	CAC	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220145
55	NC_019702	ATT	2	6	5911	5916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220146
56	NC_019702	GAA	3	9	5924	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220146
57	NC_019702	GCT	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220146
58	NC_019702	ATC	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220146
59	NC_019702	TTA	2	6	6828	6833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220147
60	NC_019702	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
61	NC_019702	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220147
62	NC_019702	AAT	2	6	7082	7087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
63	NC_019702	CAT	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220147
64	NC_019702	GGC	2	6	7274	7279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220147
65	NC_019702	TCT	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220147
66	NC_019702	ACC	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220147
67	NC_019702	TAA	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
68	NC_019702	GAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220147
69	NC_019702	TAG	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220147
70	NC_019702	CTG	2	6	7785	7790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220147
71	NC_019702	AAT	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
72	NC_019702	GAT	2	6	7885	7890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220147
73	NC_019702	TTG	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220147
74	NC_019702	CCG	2	6	8065	8070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220147
75	NC_019702	CGA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220147
76	NC_019702	TCT	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220147
77	NC_019702	CAC	2	6	8290	8295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220147
78	NC_019702	CAT	2	6	8443	8448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220147
79	NC_019702	ACT	2	6	8454	8459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220147
80	NC_019702	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
81	NC_019702	CTG	2	6	8507	8512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220147
82	NC_019702	CTT	2	6	8557	8562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220147
83	NC_019702	ACA	2	6	8574	8579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220147
84	NC_019702	GCC	2	6	8634	8639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220147
85	NC_019702	AAT	2	6	8651	8656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220147
86	NC_019702	ACG	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220147
87	NC_019702	GGT	2	6	8777	8782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220147
88	NC_019702	CTG	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220147
89	NC_019702	CAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220148
90	NC_019702	CCA	2	6	8943	8948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220148
91	NC_019702	GTT	2	6	9096	9101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220148
92	NC_019702	CAA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220148
93	NC_019702	GAT	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220149
94	NC_019702	AAT	2	6	9513	9518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220149
95	NC_019702	TAA	2	6	9540	9545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220149
96	NC_019702	ATC	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220149
97	NC_019702	CTG	2	6	9786	9791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220149
98	NC_019702	CTG	2	6	9941	9946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220149
99	NC_019702	GCC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220149
100	NC_019702	ATC	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220149
101	NC_019702	GTG	2	6	10255	10260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220149
102	NC_019702	CTT	2	6	10273	10278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220149
103	NC_019702	ATA	2	6	10388	10393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220150
104	NC_019702	TTG	2	6	10426	10431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220150
105	NC_019702	CGT	2	6	10488	10493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220150
106	NC_019702	ACC	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220150
107	NC_019702	ATC	2	6	10529	10534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
108	NC_019702	TCG	2	6	10563	10568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220150
109	NC_019702	AAC	2	6	10812	10817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220150
110	NC_019702	TTG	2	6	10883	10888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220150
111	NC_019702	ACC	2	6	11117	11122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220150
112	NC_019702	CAT	2	6	11158	11163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
113	NC_019702	ATT	3	9	11174	11182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220150
114	NC_019702	ATT	2	6	11189	11194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220150
115	NC_019702	TCT	2	6	11295	11300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220150
116	NC_019702	ATC	2	6	11303	11308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
117	NC_019702	TGA	2	6	11457	11462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220150
118	NC_019702	CTA	2	6	11484	11489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
119	NC_019702	GGA	2	6	11550	11555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220150
120	NC_019702	TGC	2	6	11565	11570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220150
121	NC_019702	TCA	2	6	11589	11594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
122	NC_019702	ATC	2	6	11595	11600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
123	NC_019702	GAC	2	6	11698	11703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220150
124	NC_019702	TAA	2	6	11741	11746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220150
125	NC_019702	ACT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
126	NC_019702	TCT	2	6	11847	11852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220150
127	NC_019702	TAC	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
128	NC_019702	GAC	2	6	11962	11967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220150
129	NC_019702	TCA	2	6	11992	11997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220150
130	NC_019702	GGT	2	6	12243	12248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220151
131	NC_019702	CAG	2	6	12309	12314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220151
132	NC_019702	ACC	2	6	12333	12338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220151
133	NC_019702	AAT	2	6	12475	12480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220152
134	NC_019702	GGT	2	6	12553	12558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220152
135	NC_019702	TTA	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220152
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137	NC_019702	TAG	2	6	12802	12807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220152
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139	NC_019702	GTG	2	6	12927	12932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220152
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142	NC_019702	TTC	2	6	12994	12999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220153
143	NC_019702	TAA	2	6	13170	13175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220153
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146	NC_019702	AAT	2	6	13475	13480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220153
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155	NC_019702	TTC	2	6	14703	14708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220154
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158	NC_019702	TAA	2	6	14831	14836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220154
159	NC_019702	CAT	2	6	15005	15010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220154
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161	NC_019702	CCA	2	6	15157	15162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220154
162	NC_019702	ACC	2	6	15234	15239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220154
163	NC_019702	TGA	2	6	15406	15411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220155
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180	NC_019702	TAT	2	6	17538	17543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220156
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249	NC_019702	CAT	2	6	24902	24907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220163
250	NC_019702	CAC	2	6	25004	25009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220163
251	NC_019702	GCA	2	6	25069	25074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220163
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253	NC_019702	TAC	2	6	25127	25132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220163
254	NC_019702	CAG	2	6	25181	25186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220163
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497	NC_019702	ACT	2	6	50092	50097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220186
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499	NC_019702	CGG	2	6	50510	50515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220187
500	NC_019702	TGG	2	6	50520	50525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220187

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