MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 4719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019699	AGC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019699	GCA	2	6	52	57	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019699	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019699	CGC	2	6	161	166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019699	CAA	2	6	312	317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204731
7	NC_019699	CAG	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
8	NC_019699	TGC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
9	NC_019699	CAG	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
10	NC_019699	CCA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204731
11	NC_019699	TCA	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204731
12	NC_019699	ACA	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204731
13	NC_019699	ATT	2	6	931	936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204731
14	NC_019699	TGC	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
15	NC_019699	TGC	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
16	NC_019699	TGG	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204731
17	NC_019699	CAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204731
18	NC_019699	CAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
19	NC_019699	AAC	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204731
20	NC_019699	TAG	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204731
21	NC_019699	CTG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
22	NC_019699	CAG	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
23	NC_019699	TAG	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204731
24	NC_019699	CTG	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
25	NC_019699	CAA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204732
26	NC_019699	TTG	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204732
27	NC_019699	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204732
28	NC_019699	ACC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204732
29	NC_019699	CCA	2	6	1789	1794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204732
30	NC_019699	CAA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204732
31	NC_019699	TTA	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204732
32	NC_019699	AAC	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204732
33	NC_019699	CAT	2	6	2045	2050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204732
34	NC_019699	CTT	2	6	2069	2074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204732
35	NC_019699	CTG	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019699	GCA	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204733
37	NC_019699	GTC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204733
38	NC_019699	ACA	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204733
39	NC_019699	GCC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204733
40	NC_019699	CGC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204733
41	NC_019699	GGA	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204733
42	NC_019699	TGC	3	9	2886	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204733
43	NC_019699	AAG	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204733
44	NC_019699	GCT	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204733
45	NC_019699	AAT	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019699	GGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204734
47	NC_019699	TTC	2	6	3448	3453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204734
48	NC_019699	AGC	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204734
49	NC_019699	TGC	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204734
50	NC_019699	AAT	2	6	3773	3778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204734
51	NC_019699	GTA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204735
52	NC_019699	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204735
53	NC_019699	ATT	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204735
54	NC_019699	GAA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204735
55	NC_019699	GCG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204735
56	NC_019699	CAA	2	6	4382	4387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204735
57	NC_019699	AGC	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204735
58	NC_019699	TGG	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204735
59	NC_019699	TCC	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204735
60	NC_019699	CAA	2	6	4794	4799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204735
61	NC_019699	AGC	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204736
62	NC_019699	ATG	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204736
63	NC_019699	AAC	2	6	5206	5211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204736
64	NC_019699	TGG	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204736
65	NC_019699	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204736
66	NC_019699	CTA	2	6	5385	5390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204736
67	NC_019699	TTA	2	6	5554	5559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204737
68	NC_019699	TAA	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204737
69	NC_019699	AGT	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204737
70	NC_019699	ATT	2	6	5983	5988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019699	GCG	2	6	6100	6105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019699	CCG	2	6	6384	6389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204738
73	NC_019699	AGC	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204738
74	NC_019699	CAA	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204738
75	NC_019699	ATC	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204739
76	NC_019699	CTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204739
77	NC_019699	TAG	4	12	6846	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204739
78	NC_019699	CAA	2	6	6925	6930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204739
79	NC_019699	GGA	2	6	7096	7101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204739
80	NC_019699	TAG	3	9	7194	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204739
81	NC_019699	CTT	2	6	7242	7247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204739
82	NC_019699	GCC	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204739
83	NC_019699	GAA	2	6	7271	7276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204739
84	NC_019699	CCA	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204739
85	NC_019699	TAG	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204739
86	NC_019699	GCT	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019699	GCT	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019699	TTG	2	6	7500	7505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019699	TCT	2	6	7529	7534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019699	GGT	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019699	AAC	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019699	AAC	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019699	TAG	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019699	TTC	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204740
95	NC_019699	AGC	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
96	NC_019699	ATG	2	6	8012	8017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204740
97	NC_019699	GTA	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204740
98	NC_019699	TGG	2	6	8396	8401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204740
99	NC_019699	TCT	2	6	8429	8434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204740
100	NC_019699	CTC	2	6	8439	8444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204740
101	NC_019699	CAG	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
102	NC_019699	AGA	2	6	8582	8587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204740
103	NC_019699	CAG	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
104	NC_019699	CTA	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204740
105	NC_019699	CAT	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204740
106	NC_019699	TTA	2	6	8825	8830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204740
107	NC_019699	AGC	2	6	8833	8838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
108	NC_019699	TAT	2	6	9053	9058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019699	TGC	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204741
110	NC_019699	GGT	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204741
111	NC_019699	TTC	2	6	9307	9312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204741
112	NC_019699	GCC	2	6	9447	9452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204741
113	NC_019699	TGT	2	6	9529	9534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204741
114	NC_019699	CTG	2	6	9538	9543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204741
115	NC_019699	CAA	2	6	9546	9551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204741
116	NC_019699	TCA	2	6	9795	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204741
117	NC_019699	GTA	2	6	9855	9860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019699	CTT	2	6	9912	9917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019699	CAG	2	6	9975	9980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019699	GTA	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
121	NC_019699	AGC	2	6	10325	10330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204742
122	NC_019699	GAA	2	6	10333	10338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204742
123	NC_019699	CAA	2	6	10372	10377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204742
124	NC_019699	GCT	2	6	10387	10392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204742
125	NC_019699	AGT	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
126	NC_019699	ATG	2	6	10592	10597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
127	NC_019699	GAT	2	6	10609	10614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
128	NC_019699	AAG	2	6	10629	10634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204742
129	NC_019699	TAG	2	6	10821	10826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204743
130	NC_019699	AAT	2	6	10855	10860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204743
131	NC_019699	AGA	2	6	10942	10947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204743
132	NC_019699	ATT	2	6	10958	10963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204743
133	NC_019699	ACA	2	6	10996	11001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204743
134	NC_019699	TGC	2	6	11038	11043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204743
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139	NC_019699	GCT	2	6	11376	11381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204744
140	NC_019699	TTG	2	6	11471	11476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204744
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151	NC_019699	GAT	2	6	12550	12555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019699	TTA	2	6	12772	12777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019699	TCT	2	6	12793	12798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019699	ACA	2	6	12828	12833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_019699	ACC	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204745
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163	NC_019699	TAG	2	6	13556	13561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204745
164	NC_019699	ATT	2	6	13632	13637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204745
165	NC_019699	TAC	2	6	13655	13660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204745
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225	NC_019699	ATA	2	6	18452	18457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_019699	ATA	2	6	18504	18509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_019699	TAG	2	6	18560	18565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_019699	ATT	2	6	18595	18600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_019699	CTC	2	6	19303	19308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
233	NC_019699	ACC	2	6	19422	19427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204752
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237	NC_019699	TCT	2	6	19802	19807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_019699	CTT	2	6	20031	20036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_019699	TAA	2	6	20038	20043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_019699	CCA	2	6	20094	20099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
242	NC_019699	TCT	2	6	20102	20107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_019699	TCT	2	6	20189	20194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_019699	CTG	2	6	20250	20255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_019699	TCA	3	9	20277	20285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_019699	CGC	2	6	20305	20310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
247	NC_019699	CTG	2	6	20359	20364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_019699	CTG	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_019699	CCA	2	6	20432	20437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_019699	TTC	2	6	20500	20505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_019699	TTC	2	6	20512	20517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_019699	TTC	2	6	20575	20580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_019699	TTG	2	6	20614	20619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019699	GCT	2	6	20636	20641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_019699	CAT	2	6	20694	20699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_019699	GCC	2	6	20961	20966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_019699	CTG	2	6	21123	21128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204753
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259	NC_019699	AAT	2	6	21200	21205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204753
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