MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	AT	3	6	1673	1678	50 %	50 %	0 %	0 %	428204732
2	NC_019699	TA	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	428204732
3	NC_019699	CG	3	6	2587	2592	0 %	0 %	50 %	50 %	428204733
4	NC_019699	TC	3	6	2838	2843	0 %	50 %	0 %	50 %	428204733
5	NC_019699	TC	3	6	3220	3225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019699	AT	3	6	3490	3495	50 %	50 %	0 %	0 %	428204734
7	NC_019699	TA	3	6	3594	3599	50 %	50 %	0 %	0 %	428204734
8	NC_019699	CA	3	6	4132	4137	50 %	0 %	0 %	50 %	428204735
9	NC_019699	AG	3	6	4580	4585	50 %	0 %	50 %	0 %	428204735
10	NC_019699	AG	3	6	5931	5936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019699	AC	3	6	6141	6146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019699	TC	3	6	8134	8139	0 %	50 %	0 %	50 %	428204740
13	NC_019699	AC	3	6	8712	8717	50 %	0 %	0 %	50 %	428204740
14	NC_019699	TC	3	6	9802	9807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019699	CT	3	6	9962	9967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019699	TC	3	6	10351	10356	0 %	50 %	0 %	50 %	428204742
17	NC_019699	AT	3	6	12390	12395	50 %	50 %	0 %	0 %	428204744
18	NC_019699	CT	3	6	12797	12802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019699	TC	3	6	12928	12933	0 %	50 %	0 %	50 %	428204745
20	NC_019699	AT	3	6	13562	13567	50 %	50 %	0 %	0 %	428204745
21	NC_019699	AT	3	6	13642	13647	50 %	50 %	0 %	0 %	428204745
22	NC_019699	TA	3	6	14299	14304	50 %	50 %	0 %	0 %	428204746
23	NC_019699	AT	3	6	16302	16307	50 %	50 %	0 %	0 %	428204748
24	NC_019699	TC	3	6	16340	16345	0 %	50 %	0 %	50 %	428204748
25	NC_019699	CA	3	6	18574	18579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019699	TC	3	6	19743	19748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019699	AT	3	6	20624	20629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019699	GA	3	6	22318	22323	50 %	0 %	50 %	0 %	428204754
29	NC_019699	GT	3	6	24260	24265	0 %	50 %	50 %	0 %	428204756
30	NC_019699	CT	3	6	24874	24879	0 %	50 %	0 %	50 %	428204756
31	NC_019699	AT	3	6	25801	25806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019699	TC	3	6	26080	26085	0 %	50 %	0 %	50 %	428204758
33	NC_019699	GC	3	6	28036	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019699	AT	3	6	29207	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019699	TG	3	6	30368	30373	0 %	50 %	50 %	0 %	428204759
36	NC_019699	TC	3	6	31091	31096	0 %	50 %	0 %	50 %	428204760
37	NC_019699	TC	3	6	31990	31995	0 %	50 %	0 %	50 %	428204760
38	NC_019699	GA	3	6	32350	32355	50 %	0 %	50 %	0 %	428204760
39	NC_019699	CT	3	6	33055	33060	0 %	50 %	0 %	50 %	428204761
40	NC_019699	CT	3	6	33548	33553	0 %	50 %	0 %	50 %	428204761
41	NC_019699	AT	3	6	34163	34168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019699	TG	3	6	34824	34829	0 %	50 %	50 %	0 %	428204762
43	NC_019699	TC	3	6	34938	34943	0 %	50 %	0 %	50 %	428204762
44	NC_019699	TA	4	8	41796	41803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019699	CG	3	6	42062	42067	0 %	0 %	50 %	50 %	428204766
46	NC_019699	AT	3	6	45131	45136	50 %	50 %	0 %	0 %	428204767
47	NC_019699	TG	3	6	45987	45992	0 %	50 %	50 %	0 %	428204768
48	NC_019699	AG	3	6	46186	46191	50 %	0 %	50 %	0 %	428204768
49	NC_019699	TC	3	6	50570	50575	0 %	50 %	0 %	50 %	428204771
50	NC_019699	AG	3	6	50832	50837	50 %	0 %	50 %	0 %	428204771
51	NC_019699	CT	3	6	51074	51079	0 %	50 %	0 %	50 %	428204771
52	NC_019699	AG	3	6	52984	52989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019699	TG	3	6	54597	54602	0 %	50 %	50 %	0 %	428204776
54	NC_019699	TG	3	6	54888	54893	0 %	50 %	50 %	0 %	428204776
55	NC_019699	AG	3	6	55930	55935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019699	AG	3	6	59820	59825	50 %	0 %	50 %	0 %	428204782
57	NC_019699	AG	3	6	60501	60506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019699	CT	3	6	60895	60900	0 %	50 %	0 %	50 %	428204783
59	NC_019699	GA	3	6	62284	62289	50 %	0 %	50 %	0 %	428204784
60	NC_019699	CG	3	6	64276	64281	0 %	0 %	50 %	50 %	428204787
61	NC_019699	AT	3	6	65101	65106	50 %	50 %	0 %	0 %	428204788
62	NC_019699	CT	3	6	66054	66059	0 %	50 %	0 %	50 %	428204789
63	NC_019699	TC	3	6	67434	67439	0 %	50 %	0 %	50 %	428204790
64	NC_019699	TG	3	6	69799	69804	0 %	50 %	50 %	0 %	428204792
65	NC_019699	TC	3	6	70648	70653	0 %	50 %	0 %	50 %	428204793
66	NC_019699	GA	3	6	71707	71712	50 %	0 %	50 %	0 %	428204794
67	NC_019699	AT	3	6	72571	72576	50 %	50 %	0 %	0 %	428204795
68	NC_019699	TG	3	6	73577	73582	0 %	50 %	50 %	0 %	428204797
69	NC_019699	TG	3	6	74040	74045	0 %	50 %	50 %	0 %	428204797
70	NC_019699	AG	3	6	75117	75122	50 %	0 %	50 %	0 %	428204798
71	NC_019699	CT	3	6	76789	76794	0 %	50 %	0 %	50 %	428204800
72	NC_019699	TA	3	6	79335	79340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019699	GA	3	6	80017	80022	50 %	0 %	50 %	0 %	428204804
74	NC_019699	GA	3	6	80582	80587	50 %	0 %	50 %	0 %	428204804
75	NC_019699	GA	3	6	82505	82510	50 %	0 %	50 %	0 %	428204807
76	NC_019699	CT	3	6	84387	84392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019699	CT	4	8	85114	85121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019699	CG	3	6	85973	85978	0 %	0 %	50 %	50 %	428204811
79	NC_019699	AG	3	6	86480	86485	50 %	0 %	50 %	0 %	428204811
80	NC_019699	TC	3	6	86676	86681	0 %	50 %	0 %	50 %	428204811
81	NC_019699	TC	3	6	87859	87864	0 %	50 %	0 %	50 %	428204812
82	NC_019699	GA	3	6	88709	88714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019699	GT	3	6	89056	89061	0 %	50 %	50 %	0 %	428204813
84	NC_019699	GT	3	6	89662	89667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019699	GA	3	6	90053	90058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019699	CT	3	6	90373	90378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019699	TA	3	6	91253	91258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019699	TC	3	6	91449	91454	0 %	50 %	0 %	50 %	428204815
89	NC_019699	TA	3	6	91540	91545	50 %	50 %	0 %	0 %	428204815
90	NC_019699	CT	3	6	92265	92270	0 %	50 %	0 %	50 %	428204816
91	NC_019699	TC	3	6	92403	92408	0 %	50 %	0 %	50 %	428204816
92	NC_019699	CA	3	6	92590	92595	50 %	0 %	0 %	50 %	428204816
93	NC_019699	TG	3	6	93150	93155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019699	CA	4	8	93946	93953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019699	AC	3	6	96560	96565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019699	TC	3	6	97774	97779	0 %	50 %	0 %	50 %	428204822
97	NC_019699	TA	3	6	98887	98892	50 %	50 %	0 %	0 %	428204822
98	NC_019699	AG	3	6	99904	99909	50 %	0 %	50 %	0 %	428204823
99	NC_019699	TA	3	6	101717	101722	50 %	50 %	0 %	0 %	428204824
100	NC_019699	GA	3	6	102265	102270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019699	TC	3	6	102401	102406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019699	GC	3	6	102893	102898	0 %	0 %	50 %	50 %	428204825
103	NC_019699	GA	3	6	104722	104727	50 %	0 %	50 %	0 %	428204826
104	NC_019699	TC	3	6	106421	106426	0 %	50 %	0 %	50 %	428204828
105	NC_019699	AC	3	6	106536	106541	50 %	0 %	0 %	50 %	428204828
106	NC_019699	GA	3	6	106598	106603	50 %	0 %	50 %	0 %	428204828
107	NC_019699	CT	3	6	106610	106615	0 %	50 %	0 %	50 %	428204828
108	NC_019699	GT	3	6	106637	106642	0 %	50 %	50 %	0 %	428204828
109	NC_019699	TC	3	6	107255	107260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019699	GC	3	6	108027	108032	0 %	0 %	50 %	50 %	428204830
111	NC_019699	TG	3	6	109085	109090	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
112	NC_019699	AG	3	6	109985	109990	50 %	0 %	50 %	0 %	428204831
113	NC_019699	TC	3	6	110121	110126	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
114	NC_019699	CG	3	6	110820	110825	0 %	0 %	50 %	50 %	428204831
115	NC_019699	TC	3	6	110999	111004	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
116	NC_019699	TC	3	6	111247	111252	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
117	NC_019699	GC	3	6	111578	111583	0 %	0 %	50 %	50 %	428204831
118	NC_019699	CA	3	6	111584	111589	50 %	0 %	0 %	50 %	428204831
119	NC_019699	GT	3	6	111712	111717	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
120	NC_019699	AG	3	6	112573	112578	50 %	0 %	50 %	0 %	428204832
121	NC_019699	CT	3	6	114467	114472	0 %	50 %	0 %	50 %	428204833
122	NC_019699	AT	3	6	117496	117501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019699	GA	4	8	118293	118300	50 %	0 %	50 %	0 %	428204836
124	NC_019699	CA	3	6	118814	118819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019699	TA	4	8	118932	118939	50 %	50 %	0 %	0 %	428204837
126	NC_019699	AC	3	6	119452	119457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019699	CA	3	6	120283	120288	50 %	0 %	0 %	50 %	428204838
128	NC_019699	CA	3	6	120574	120579	50 %	0 %	0 %	50 %	428204838
129	NC_019699	TG	3	6	122109	122114	0 %	50 %	50 %	0 %	428204840
130	NC_019699	TA	3	6	123062	123067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019699	TC	3	6	124068	124073	0 %	50 %	0 %	50 %	428204841
132	NC_019699	TG	3	6	124185	124190	0 %	50 %	50 %	0 %	428204841
133	NC_019699	GC	3	6	124481	124486	0 %	0 %	50 %	50 %	428204841
134	NC_019699	TC	3	6	125445	125450	0 %	50 %	0 %	50 %	428204842
135	NC_019699	TC	4	8	127322	127329	0 %	50 %	0 %	50 %	428204844
136	NC_019699	GA	4	8	128767	128774	50 %	0 %	50 %	0 %	428204845
137	NC_019699	TG	3	6	128926	128931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019699	CT	3	6	131181	131186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019699	TC	3	6	131385	131390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019699	TC	3	6	133783	133788	0 %	50 %	0 %	50 %	428204849
141	NC_019699	CT	3	6	135589	135594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019699	CT	3	6	135669	135674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019699	CA	3	6	136582	136587	50 %	0 %	0 %	50 %	428204851
144	NC_019699	CA	3	6	138235	138240	50 %	0 %	0 %	50 %	428204855
145	NC_019699	GA	3	6	139070	139075	50 %	0 %	50 %	0 %	428204856
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.