MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	A	7	7	144	150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019699	T	6	6	604	609	0 %	100 %	0 %	0 %	428204731
3	NC_019699	A	6	6	744	749	100 %	0 %	0 %	0 %	428204731
4	NC_019699	A	6	6	1340	1345	100 %	0 %	0 %	0 %	428204731
5	NC_019699	A	6	6	5688	5693	100 %	0 %	0 %	0 %	428204737
6	NC_019699	A	6	6	6188	6193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019699	A	6	6	6322	6327	100 %	0 %	0 %	0 %	428204738
8	NC_019699	T	6	6	7746	7751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019699	A	6	6	9430	9435	100 %	0 %	0 %	0 %	428204741
10	NC_019699	A	6	6	9499	9504	100 %	0 %	0 %	0 %	428204741
11	NC_019699	A	8	8	10032	10039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019699	A	6	6	10618	10623	100 %	0 %	0 %	0 %	428204742
13	NC_019699	A	6	6	10774	10779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019699	A	6	6	12915	12920	100 %	0 %	0 %	0 %	428204745
15	NC_019699	T	6	6	13062	13067	0 %	100 %	0 %	0 %	428204745
16	NC_019699	T	6	6	14784	14789	0 %	100 %	0 %	0 %	428204746
17	NC_019699	T	6	6	15115	15120	0 %	100 %	0 %	0 %	428204746
18	NC_019699	T	6	6	17449	17454	0 %	100 %	0 %	0 %	428204749
19	NC_019699	C	6	6	17664	17669	0 %	0 %	0 %	100 %	428204750
20	NC_019699	T	6	6	18351	18356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019699	A	6	6	18532	18537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019699	T	6	6	20868	20873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019699	T	6	6	23282	23287	0 %	100 %	0 %	0 %	428204755
24	NC_019699	T	6	6	23404	23409	0 %	100 %	0 %	0 %	428204755
25	NC_019699	C	6	6	23435	23440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_019699	T	6	6	23533	23538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019699	T	7	7	23556	23562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019699	T	6	6	24831	24836	0 %	100 %	0 %	0 %	428204756
29	NC_019699	T	7	7	25974	25980	0 %	100 %	0 %	0 %	428204758
30	NC_019699	T	8	8	26141	26148	0 %	100 %	0 %	0 %	428204758
31	NC_019699	T	6	6	27166	27171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019699	T	6	6	29025	29030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019699	A	6	6	31023	31028	100 %	0 %	0 %	0 %	428204760
34	NC_019699	T	6	6	31641	31646	0 %	100 %	0 %	0 %	428204760
35	NC_019699	T	6	6	31799	31804	0 %	100 %	0 %	0 %	428204760
36	NC_019699	C	6	6	32951	32956	0 %	0 %	0 %	100 %	428204761
37	NC_019699	T	7	7	33991	33997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019699	A	6	6	34064	34069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019699	T	6	6	34121	34126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019699	A	6	6	35861	35866	100 %	0 %	0 %	0 %	428204762
41	NC_019699	T	6	6	37764	37769	0 %	100 %	0 %	0 %	428204763
42	NC_019699	T	6	6	39581	39586	0 %	100 %	0 %	0 %	428204764
43	NC_019699	T	6	6	39851	39856	0 %	100 %	0 %	0 %	428204764
44	NC_019699	T	6	6	40534	40539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019699	T	6	6	41694	41699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019699	T	7	7	44410	44416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019699	T	7	7	45271	45277	0 %	100 %	0 %	0 %	428204767
48	NC_019699	A	6	6	48236	48241	100 %	0 %	0 %	0 %	428204769
49	NC_019699	A	6	6	48740	48745	100 %	0 %	0 %	0 %	428204769
50	NC_019699	T	7	7	51910	51916	0 %	100 %	0 %	0 %	428204772
51	NC_019699	A	6	6	51931	51936	100 %	0 %	0 %	0 %	428204772
52	NC_019699	T	6	6	52657	52662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019699	T	6	6	52811	52816	0 %	100 %	0 %	0 %	428204773
54	NC_019699	A	6	6	53377	53382	100 %	0 %	0 %	0 %	428204774
55	NC_019699	T	6	6	55350	55355	0 %	100 %	0 %	0 %	428204776
56	NC_019699	T	6	6	55689	55694	0 %	100 %	0 %	0 %	428204777
57	NC_019699	A	7	7	56977	56983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019699	T	6	6	59376	59381	0 %	100 %	0 %	0 %	428204781
59	NC_019699	T	6	6	60765	60770	0 %	100 %	0 %	0 %	428204783
60	NC_019699	T	9	9	61225	61233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019699	T	6	6	61316	61321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019699	T	6	6	61509	61514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019699	A	6	6	61545	61550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019699	A	6	6	61624	61629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019699	T	6	6	62581	62586	0 %	100 %	0 %	0 %	428204784
66	NC_019699	A	6	6	64357	64362	100 %	0 %	0 %	0 %	428204787
67	NC_019699	T	6	6	64914	64919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019699	T	6	6	65235	65240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019699	T	6	6	65684	65689	0 %	100 %	0 %	0 %	428204789
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71	NC_019699	T	6	6	71981	71986	0 %	100 %	0 %	0 %	428204794
72	NC_019699	T	6	6	72134	72139	0 %	100 %	0 %	0 %	428204794
73	NC_019699	A	6	6	72550	72555	100 %	0 %	0 %	0 %	428204795
74	NC_019699	A	6	6	72738	72743	100 %	0 %	0 %	0 %	428204795
75	NC_019699	A	6	6	74948	74953	100 %	0 %	0 %	0 %	428204798
76	NC_019699	A	6	6	75313	75318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019699	T	6	6	75334	75339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019699	T	6	6	76631	76636	0 %	100 %	0 %	0 %	428204800
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85	NC_019699	A	6	6	88690	88695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_019699	A	6	6	92564	92569	100 %	0 %	0 %	0 %	428204816
91	NC_019699	A	6	6	93241	93246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_019699	A	6	6	94054	94059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_019699	A	7	7	102600	102606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_019699	A	6	6	105200	105205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_019699	A	7	7	105534	105540	100 %	0 %	0 %	0 %	428204827
110	NC_019699	A	6	6	106070	106075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019699	T	6	6	106098	106103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_019699	A	8	8	107103	107110	100 %	0 %	0 %	0 %	428204829
114	NC_019699	G	6	6	107626	107631	0 %	0 %	100 %	0 %	428204830
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116	NC_019699	G	6	6	110184	110189	0 %	0 %	100 %	0 %	428204831
117	NC_019699	A	6	6	113749	113754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.