MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019698	AGATGA	3	18	1021	1038	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434389902
2	NC_019698	CCAGCA	2	12	1054	1065	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019698	TCAACT	2	12	1412	1423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389903
4	NC_019698	TGGTCG	2	12	2069	2080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434389903
5	NC_019698	GACCGC	2	12	6929	6940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	434389907
6	NC_019698	CTCATC	2	12	9309	9320	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	434389910
7	NC_019698	GCGTAG	2	12	9998	10009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434389911
8	NC_019698	AAGGGG	2	12	11270	11281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019698	GCAACC	2	12	11481	11492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	434389913
10	NC_019698	TAAAGA	2	12	11537	11548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434389913
11	NC_019698	GAAATG	2	12	11745	11756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434389913
12	NC_019698	GGATTG	2	12	12067	12078	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434389913
13	NC_019698	ATAGAC	2	12	13606	13617	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434389914
14	NC_019698	AATACA	2	12	14446	14457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434389914
15	NC_019698	TGAAGC	2	12	17803	17814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434389915
16	NC_019698	TATGGG	2	12	20354	20365	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019698	GTGAAG	2	12	24056	24067	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434389918
18	NC_019698	TGTAGA	2	12	24498	24509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389918
19	NC_019698	TAGGTG	2	12	25697	25708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434389918
20	NC_019698	AATTGG	2	12	30724	30735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389922
21	NC_019698	TTGATT	2	12	31006	31017	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434389922

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.